
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     23  118  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     41  122  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     24  119  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     65  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    101  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     37  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     44  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133    101  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     98  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    101  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     57  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     26  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     90  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     90  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     90  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     57  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    106  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     85  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133      3  100  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     37  109  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5    5    5  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3   92  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    107    126    131    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  80.45  94.74  98.50  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.40   0.50   0.55   0.55   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63
GDT RMS_ALL_AT   0.66   0.66   0.64   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.326     0    0.029   0.591     3.070   81.429   76.190
LGA    M     3_A      M     3_A     1.171     0    0.040   1.052     1.960   83.690   79.345
LGA    A     4_A      A     4_A     1.275     0    0.049   0.062     1.597   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     0.942     0    0.051   0.116     1.447   90.595   85.503
LGA    L     6_A      L     6_A     0.295     0    0.039   0.130     0.611   97.619   97.619
LGA    K     7_A      K     7_A     0.484     0    0.026   0.913     4.780  100.000   74.815
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.279     0    0.020   0.103     0.524  100.000   97.884
LGA    E     9_A      E     9_A     0.232     0    0.038   0.361     1.684  100.000   95.926
LGA    W    10_A      W    10_A     0.309     0    0.014   0.096     0.428  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.327     0    0.056   0.070     0.393  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.393     0    0.045   0.122     0.670  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.481     0    0.025   0.057     0.795   97.619   94.558
LGA    A    14_A      A    14_A     0.287     0    0.028   0.034     0.315  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.183     0    0.064   0.097     0.293  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.377     0    0.056   0.272     0.961   97.619   96.825
LGA    A    17_A      A    17_A     0.452     0    0.024   0.036     0.575   97.619   96.190
LGA    L    18_A      L    18_A     0.347     0    0.087   0.111     0.677   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.196     0    0.025   0.167     0.765  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.132     0    0.024   0.229     0.714  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.295     0    0.093   0.104     0.622   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.341     0    0.023   0.043     0.772  100.000   95.238
LGA    V    23_A      V    23_A     0.423     0    0.030   0.054     0.441  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.418     0    0.025   0.029     0.511   97.619   98.639
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.452     0    0.005   0.165     1.106  100.000   95.278
LGA    S    26_A      S    26_A     0.424     0    0.021   0.035     0.501   97.619   98.413
LGA    H    27_A      H    27_A     0.436     0    0.031   0.401     1.906  100.000   88.952
LGA    F    28_A      F    28_A     0.203     0    0.021   0.072     0.653  100.000   97.403
LGA    P    29_A      P    29_A     0.451     0    0.044   0.044     0.528  100.000   98.639
LGA    V    30_A      V    30_A     0.165     0    0.055   0.075     0.281  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.145     0    0.021   0.021     0.212  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.067     0    0.039   0.044     0.244  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.093     0    0.021   0.051     0.345  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.101     0    0.023   0.047     0.142  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.113     0    0.039   0.046     0.267  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.313     0    0.022   0.064     0.470  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.392     0    0.044   0.477     1.213  100.000   95.873
LGA    S    38_A      S    38_A     0.329     0    0.024   0.132     0.668  100.000   98.413
LGA    G    39_A      G    39_A     0.388     0    0.065   0.065     0.388  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.235     0    0.024   0.736     3.967  100.000   80.476
LGA    I    41_A      I    41_A     0.331     0    0.090   1.437     3.702  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.045     0    0.094   0.094     0.487  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.048     0    0.009   0.491     1.618  100.000   90.794
LGA    G    44_A      G    44_A     0.120     0    0.012   0.012     0.244  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.232     0    0.012   0.089     0.600  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.289     0    0.054   0.110     0.419  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.335     0    0.022   0.045     0.465  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.404     0    0.063   0.122     0.703   97.619   97.884
LGA    N    49_A      N    49_A     0.445     0    0.023   0.051     0.946  100.000   95.238
LGA    A    50_A      A    50_A     0.395     0    0.027   0.035     0.623   97.619   98.095
LGA    S    51_A      S    51_A     0.614     0    0.067   0.072     1.170   92.857   90.556
LGA    F    52_A      F    52_A     0.770     0    0.031   0.614     2.557   90.476   83.506
LGA    G    53_A      G    53_A     1.087     0    0.020   0.020     1.179   83.690   83.690
LGA    L    54_A      L    54_A     0.804     0    0.022   0.149     1.290   90.476   87.083
LGA    T    55_A      T    55_A     0.341     0    0.015   0.036     0.508   97.619   98.639
LGA    N    56_A      N    56_A     0.128     0    0.031   0.125     0.321  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.150     0    0.017   0.128     0.457  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.195     0    0.022   0.026     0.262  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.189     0    0.041   0.353     1.063  100.000   97.937
LGA    R    60_A      R    60_A     0.161     0    0.018   0.171     1.083  100.000   95.714
LGA    T    61_A      T    61_A     0.145     0    0.022   0.071     0.359  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.204     0    0.037   0.039     0.213  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.205     0    0.063   0.073     0.382  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.246     0    0.016   0.067     0.938  100.000   94.805
LGA    K    65_A      K    65_A     0.215     0    0.042   0.587     1.740  100.000   87.937
LGA    A    66_A      A    66_A     0.248     0    0.011   0.025     0.364  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.302     0    0.039   0.045     0.375  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.401     0    0.052   0.133     0.625  100.000   98.413
LGA    E    69_A      E    69_A     0.629     0    0.022   0.207     0.730   90.476   90.476
LGA    G    70_A      G    70_A     0.635     0    0.024   0.024     0.635   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.451     0    0.023   0.245     1.215   92.857   91.587
LGA    R    72_A      R    72_A     0.521     0    0.035   0.091     0.924   92.857   91.342
LGA    S    73_A      S    73_A     0.430     0    0.065   0.068     0.511   97.619   98.413
LGA    F    74_A      F    74_A     0.121     0    0.009   0.045     0.213  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.054     0    0.076   0.075     0.463  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.115     0    0.056   0.795     4.110  100.000   76.143
LGA    L    77_A      L    77_A     0.115     0    0.014   0.074     0.240  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.064     0    0.010   0.043     0.247  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.109     0    0.038   0.106     0.308  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.124     0    0.020   0.045     0.156  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.238     0    0.028   0.028     0.279  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.131     0    0.028   0.067     0.380  100.000  100.000
LGA    T    83_A      T    83_A     0.519     0    0.024   0.063     1.018   97.619   93.265
LGA    P    84_A      P    84_A     0.372     0    0.030   0.395     1.920   97.619   92.041
LGA    D    85_A      D    85_A     0.370     0    0.050   0.091     0.840  100.000   95.238
LGA    P    86_A      P    86_A     0.683     0    0.056   0.055     0.753   90.476   90.476
LGA    I    87_A      I    87_A     0.970     0    0.025   1.231     3.528   90.476   81.190
LGA    S    88_A      S    88_A     1.017     0    0.057   0.152     1.908   88.214   83.095
LGA    P    89_A      P    89_A     0.909     0    0.020   0.091     1.273   90.476   86.599
LGA    C    90_A      C    90_A     0.958     0    0.018   0.053     0.961   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     1.059     0    0.058   0.058     1.059   85.952   85.952
LGA    A    92_A      A    92_A     0.976     0    0.017   0.020     1.080   88.214   86.857
LGA    C    93_A      C    93_A     0.562     0    0.016   0.064     0.742   95.238   93.651
LGA    R    94_A      R    94_A     0.533     0    0.052   0.089     1.470   92.857   88.874
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.551     0    0.053   0.138     0.928   95.238   92.593
LGA    V    96_A      V    96_A     0.376     0    0.027   0.045     0.487  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.355     0    0.017   0.759     2.157  100.000   93.214
LGA    A    98_A      A    98_A     0.386     0    0.017   0.022     0.476  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.521     0    0.031   0.185     1.419   92.857   88.519
LGA    F   100_A      F   100_A     0.148     0    0.023   0.065     0.257  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.137     0    0.037   0.048     0.261  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.162     0    0.021   0.026     0.178  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.137     0    0.068   0.077     0.333  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.216     0    0.027   0.376     1.310  100.000   97.679
LGA    M   105_A      M   105_A     0.178     0    0.013   0.102     0.497  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.239     0    0.050   0.233     0.469  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.249     0    0.028   0.044     0.293  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.249     0    0.030   0.051     0.290  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.337     0    0.009   0.069     0.463  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.209     0    0.046   0.069     0.287  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.357     0    0.023   0.023     0.463  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.423     0    0.024   0.122     1.086   97.619   92.917
LGA    N   113_A      N   113_A     0.524     0    0.043   0.844     3.278   92.857   84.345
LGA    G   114_A      G   114_A     0.476     0    0.054   0.054     0.607   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.408     0    0.085   1.111     2.628   97.619   86.395
LGA    T   116_A      T   116_A     0.201     0    0.027   0.036     0.248  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.199     0    0.067   0.650     1.661  100.000   94.868
LGA    A   118_A      A   118_A     0.260     0    0.043   0.066     0.404  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.186     0    0.035   0.060     0.362  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.284     0    0.023   0.039     0.405  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.282     0    0.012   0.045     0.339  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.326     0    0.013   1.086     3.282  100.000   87.965
LGA    E   123_A      E   123_A     0.543     0    0.021   0.387     1.258   92.857   89.524
LGA    L   124_A      L   124_A     0.529     0    0.052   0.055     0.780   97.619   94.048
LGA    L   125_A      L   125_A     0.384     0    0.025   0.094     0.600  100.000   97.619
LGA    P   126_A      P   126_A     0.474     0    0.040   0.353     1.451   95.238   94.626
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.866     0    0.042   1.302     7.531   90.476   62.500
LGA    A   128_A      A   128_A     0.773     0    0.014   0.018     0.887   90.476   90.476
LGA    F   129_A      F   129_A     0.602     0    0.026   0.147     0.805   92.857   91.342
LGA    T   130_A      T   130_A     0.390     0    0.017   0.155     1.131   95.238   91.905
LGA    E   131_A      E   131_A     1.597     0    0.126   0.878     3.920   75.000   63.810
LGA    K   132_A      K   132_A     1.806     0    0.100   0.602     4.584   63.690   55.079
LGA    D   133_A      D   133_A     3.486     0    0.020   0.268     5.660   48.571   38.810
LGA    L   134_A      L   134_A     2.398     0    0.044   0.907     3.864   55.714   63.333

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.627          0.653                  1.023           96.347   93.610

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.63    98.496    99.370    18.297

LGA_LOCAL      RMSD:   0.627  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.627  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.627  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.603712 * X  +  -0.776933 * Y  +  -0.178622 * Z  + -30.370905
  Y_new =   0.795237 * X  +   0.571188 * Y  +   0.203331 * Z  +  26.327299
  Z_new =  -0.055948 * X  +  -0.264800 * Y  +   0.962679 * Z  + -12.746020 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.921458  0.055977 -0.268427   [DEG:   52.7957    3.2072  -15.3798 ]
ZXZ: -2.420794  0.274064 -2.933372   [DEG: -138.7013   15.7027 -168.0699 ]
 
# END of job
