
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     40  122  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     50  122  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     40  122  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     58  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    100  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133     99  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133     91  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133     95  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133     99  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133     91  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     77  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     21  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     36  121  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     83  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     97  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     99  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     72  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     20  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     83  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     83  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     83  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     83  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    104  125  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     17   94  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     17  101  131  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  119  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3   72  108  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    104    125    131    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  78.20  93.98  98.50  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.27   0.40   0.51   0.51   0.58   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66
GDT RMS_ALL_AT   0.69   0.69   0.67   0.67   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.383     0    0.027   0.591     3.134   81.429   76.190
LGA    M     3_A      M     3_A     1.239     0    0.059   0.236     1.346   83.690   84.821
LGA    A     4_A      A     4_A     1.297     0    0.051   0.064     1.575   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     1.012     0    0.062   0.171     1.510   88.333   83.545
LGA    L     6_A      L     6_A     0.377     0    0.039   0.148     0.666   97.619   94.048
LGA    K     7_A      K     7_A     0.509     0    0.028   0.884     4.240   97.619   76.085
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.278     0    0.025   0.102     0.431  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.223     0    0.041   0.363     1.822  100.000   93.862
LGA    W    10_A      W    10_A     0.298     0    0.017   0.109     0.442  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.311     0    0.058   0.074     0.373  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.411     0    0.048   0.126     0.601  100.000   97.619
LGA    T    13_A      T    13_A     0.471     0    0.026   0.094     0.892  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.243     0    0.029   0.034     0.284  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.125     0    0.068   0.099     0.228  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.271     0    0.056   0.266     0.860   97.619   97.884
LGA    A    17_A      A    17_A     0.380     0    0.026   0.040     0.545  100.000   98.095
LGA    L    18_A      L    18_A     0.277     0    0.076   0.112     0.556   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.064     0    0.027   0.149     0.752  100.000   97.619
LGA    K    20_A      K    20_A     0.259     0    0.016   0.233     0.741  100.000   98.942
LGA    A    21_A      A    21_A     0.396     0    0.096   0.109     0.814   95.238   96.190
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.427     0    0.024   0.047     0.986  100.000   94.444
LGA    V    23_A      V    23_A     0.489     0    0.033   0.053     0.561   95.238   97.279
LGA    P    24_A      P    24_A     0.675     0    0.025   0.027     0.813   90.476   90.476
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.703     0    0.007   0.144     1.181   90.476   88.968
LGA    S    26_A      S    26_A     0.653     0    0.013   0.028     0.757   90.476   90.476
LGA    H    27_A      H    27_A     0.665     0    0.035   0.435     2.368   92.857   82.714
LGA    F    28_A      F    28_A     0.399     0    0.019   0.066     0.730  100.000   94.805
LGA    P    29_A      P    29_A     0.423     0    0.046   0.046     0.533  100.000   97.279
LGA    V    30_A      V    30_A     0.138     0    0.054   0.067     0.233  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.204     0    0.027   0.027     0.244  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.035     0    0.036   0.040     0.189  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.127     0    0.014   0.036     0.293  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.175     0    0.022   0.051     0.208  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.108     0    0.033   0.036     0.309  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.304     0    0.018   0.050     0.538   97.619   98.639
LGA    E    37_A      E    37_A     0.465     0    0.047   0.498     1.440  100.000   94.815
LGA    S    38_A      S    38_A     0.408     0    0.031   0.068     0.478  100.000  100.000
LGA    G    39_A      G    39_A     0.457     0    0.022   0.022     0.457  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.162     0    0.020   0.728     4.053  100.000   79.788
LGA    I    41_A      I    41_A     0.320     0    0.082   1.431     3.803  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.153     0    0.089   0.085     0.455  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.179     0    0.014   0.468     1.608  100.000   90.794
LGA    G    44_A      G    44_A     0.174     0    0.011   0.011     0.174  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.163     0    0.013   0.088     0.647  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.224     0    0.052   0.097     0.355  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.292     0    0.021   0.047     0.484  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.326     0    0.070   0.133     0.730   97.619   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.362     0    0.027   0.067     0.860  100.000   95.238
LGA    A    50_A      A    50_A     0.644     0    0.020   0.026     0.934   90.476   90.476
LGA    S    51_A      S    51_A     0.804     0    0.088   0.116     1.537   92.857   87.619
LGA    F    52_A      F    52_A     1.088     0    0.043   0.563     2.025   83.690   79.957
LGA    G    53_A      G    53_A     1.467     0    0.016   0.016     1.504   79.286   79.286
LGA    L    54_A      L    54_A     0.987     0    0.033   0.157     1.390   88.214   85.952
LGA    T    55_A      T    55_A     0.423     0    0.041   0.047     0.655   97.619   97.279
LGA    N    56_A      N    56_A     0.291     0    0.031   0.219     0.653  100.000   98.810
LGA    C    57_A      C    57_A     0.123     0    0.020   0.115     0.439  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.207     0    0.020   0.026     0.223  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.196     0    0.040   0.251     0.831  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.121     0    0.025   0.292     1.589  100.000   93.290
LGA    T    61_A      T    61_A     0.200     0    0.016   0.067     0.335  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.290     0    0.036   0.040     0.315  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.296     0    0.057   0.056     0.506   97.619   99.134
LGA    F    64_A      F    64_A     0.217     0    0.017   0.058     0.617  100.000   97.403
LGA    K    65_A      K    65_A     0.154     0    0.033   0.105     0.397  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.329     0    0.009   0.026     0.400  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.359     0    0.035   0.036     0.440  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.438     0    0.063   0.127     0.485  100.000  100.000
LGA    E    69_A      E    69_A     0.572     0    0.024   0.257     0.718   90.476   90.476
LGA    G    70_A      G    70_A     0.571     0    0.027   0.027     0.571   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.414     0    0.023   0.217     1.188   97.619   94.762
LGA    R    72_A      R    72_A     0.420     0    0.037   0.096     0.764   97.619   93.074
LGA    S    73_A      S    73_A     0.389     0    0.068   0.071     0.484  100.000  100.000
LGA    F    74_A      F    74_A     0.124     0    0.015   0.045     0.220  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.089     0    0.036   0.073     0.223  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.150     0    0.049   0.482     2.321  100.000   86.571
LGA    L    77_A      L    77_A     0.147     0    0.012   0.076     0.237  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.046     0    0.009   0.034     0.220  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.071     0    0.041   0.096     0.216  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.098     0    0.021   0.047     0.168  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.179     0    0.026   0.026     0.208  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.134     0    0.022   0.087     0.566  100.000   98.095
LGA    T    83_A      T    83_A     0.562     0    0.017   0.067     1.150   97.619   91.973
LGA    P    84_A      P    84_A     0.472     0    0.051   0.401     2.005   95.238   88.231
LGA    D    85_A      D    85_A     0.292     0    0.052   0.087     0.761  100.000   98.810
LGA    P    86_A      P    86_A     0.550     0    0.067   0.063     0.659   92.857   95.918
LGA    I    87_A      I    87_A     0.967     0    0.022   1.211     3.571   92.857   82.381
LGA    S    88_A      S    88_A     0.997     0    0.064   0.156     1.953   90.476   84.603
LGA    P    89_A      P    89_A     0.814     0    0.022   0.111     1.171   90.476   86.599
LGA    C    90_A      C    90_A     0.829     0    0.013   0.058     0.879   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     1.048     0    0.063   0.063     1.048   88.214   88.214
LGA    A    92_A      A    92_A     0.949     0    0.020   0.022     1.003   90.476   88.667
LGA    C    93_A      C    93_A     0.474     0    0.027   0.085     0.670   97.619   98.413
LGA    R    94_A      R    94_A     0.517     0    0.033   0.116     1.423   92.857   88.874
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.574     0    0.058   0.128     0.980   92.857   91.534
LGA    V    96_A      V    96_A     0.451     0    0.021   0.031     0.528   97.619   97.279
LGA    M    97_A      M    97_A     0.351     0    0.016   0.229     0.780  100.000   97.619
LGA    A    98_A      A    98_A     0.358     0    0.017   0.024     0.417  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.458     0    0.030   0.171     1.225  100.000   94.815
LGA    F   100_A      F   100_A     0.192     0    0.025   0.070     0.330  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.200     0    0.030   0.042     0.315  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.170     0    0.022   0.027     0.248  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.220     0    0.072   0.078     0.354  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.207     0    0.030   0.346     1.276  100.000   96.488
LGA    M   105_A      M   105_A     0.218     0    0.010   0.110     0.356  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.255     0    0.013   0.205     0.653  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.190     0    0.040   0.047     0.303  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.183     0    0.035   0.045     0.252  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.303     0    0.010   0.060     0.478  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.213     0    0.037   0.066     0.256  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.358     0    0.038   0.038     0.464  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.295     0    0.021   0.109     0.923  100.000   96.429
LGA    N   113_A      N   113_A     0.436     0    0.054   0.850     3.188   97.619   86.726
LGA    G   114_A      G   114_A     0.516     0    0.056   0.056     0.516   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.293     0    0.068   1.096     2.645   97.619   86.395
LGA    T   116_A      T   116_A     0.141     0    0.032   0.038     0.341  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.192     0    0.056   0.652     1.746  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.281     0    0.046   0.073     0.506   97.619   98.095
LGA    T   119_A      T   119_A     0.306     0    0.067   0.118     0.530   97.619   98.639
LGA    T   120_A      T   120_A     0.296     0    0.024   0.062     0.473  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.253     0    0.010   0.063     0.346  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.338     0    0.013   1.057     4.941  100.000   81.039
LGA    E   123_A      E   123_A     0.497     0    0.017   0.487     1.565   97.619   92.804
LGA    L   124_A      L   124_A     0.483     0    0.065   0.073     0.718  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.396     0    0.013   0.077     0.587  100.000   97.619
LGA    P   126_A      P   126_A     0.349     0    0.040   0.353     1.153   97.619   95.986
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.848     0    0.038   1.299     7.685   90.476   61.230
LGA    A   128_A      A   128_A     0.823     0    0.013   0.016     0.914   90.476   90.476
LGA    F   129_A      F   129_A     0.651     0    0.017   0.179     1.033   90.476   89.654
LGA    T   130_A      T   130_A     0.328     0    0.016   0.145     0.756   95.238   94.558
LGA    E   131_A      E   131_A     1.195     0    0.122   0.878     4.576   81.548   65.397
LGA    K   132_A      K   132_A     1.801     0    0.114   0.596     4.453   63.690   58.201
LGA    D   133_A      D   133_A     3.681     0    0.014   0.279     5.818   45.238   37.798
LGA    L   134_A      L   134_A     2.819     0    0.620   1.020     4.480   48.690   59.048

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.660          0.696                  1.034           96.108   93.586

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.66    98.120    99.258    17.504

LGA_LOCAL      RMSD:   0.660  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.660  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.660  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.429763 * X  +   0.394405 * Y  +  -0.812249 * Z  + -29.741411
  Y_new =  -0.331775 * X  +  -0.905609 * Y  +  -0.264194 * Z  +  24.909082
  Z_new =  -0.839779 * X  +   0.155943 * Y  +   0.520051 * Z  + -13.004823 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.484163  0.996876  0.291329   [DEG: -142.3321   57.1168   16.6919 ]
ZXZ: -1.256327  1.023886 -1.387193   [DEG:  -71.9822   58.6643  -79.4803 ]
 
# END of job
