
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     29  119  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     34  119  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     25  114  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     62  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133     85  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133     95  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133     95  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133     95  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133     81  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133     54  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133     81  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133     85  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     16  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     16  121  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     17  111  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     60  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133     89  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133     89  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133     95  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133     93  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     52  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     72  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     40  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     74  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     80  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     80  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     74  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133     91  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133     93  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     30  122  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     81  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133     96  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133     91  123  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133      3  108  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133      9   97  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5   95  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3   74  103  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     96    123    131    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  72.18  92.48  98.50  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.42   0.55   0.62   0.62   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71
GDT RMS_ALL_AT   0.74   0.74   0.72   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.353     0    0.026   0.586     3.020   81.429   76.190
LGA    M     3_A      M     3_A     1.256     0    0.068   0.210     1.397   83.690   84.821
LGA    A     4_A      A     4_A     1.317     0    0.049   0.063     1.620   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     0.912     0    0.058   0.167     1.420   90.595   86.508
LGA    L     6_A      L     6_A     0.309     0    0.038   0.138     0.561   97.619   97.619
LGA    K     7_A      K     7_A     0.591     0    0.030   0.897     4.393   95.238   75.026
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LGA    E    99_A      E    99_A     0.515     0    0.036   0.191     1.374   95.238   89.577
LGA    F   100_A      F   100_A     0.154     0    0.019   0.069     0.283  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.178     0    0.036   0.046     0.327  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.162     0    0.024   0.029     0.223  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.174     0    0.071   0.077     0.311  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.174     0    0.032   0.395     1.382  100.000   97.679
LGA    M   105_A      M   105_A     0.168     0    0.011   0.094     0.460  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.195     0    0.027   0.218     0.468  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.103     0    0.029   0.041     0.162  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.202     0    0.030   0.043     0.250  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.327     0    0.007   0.072     0.466  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.280     0    0.034   0.042     0.293  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.428     0    0.021   0.021     0.506   97.619   97.619
LGA    D   112_A      D   112_A     0.470     0    0.021   0.117     1.247   97.619   92.917
LGA    N   113_A      N   113_A     0.484     0    0.040   0.847     3.258  100.000   87.917
LGA    G   114_A      G   114_A     0.438     0    0.055   0.055     0.540   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.398     0    0.076   1.109     2.635   97.619   86.395
LGA    T   116_A      T   116_A     0.216     0    0.025   0.049     0.290  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.170     0    0.056   0.653     1.608  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.237     0    0.048   0.073     0.406  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.172     0    0.034   0.055     0.325  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.247     0    0.019   0.030     0.392  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.273     0    0.011   0.061     0.368  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.361     0    0.014   1.066     4.036  100.000   82.511
LGA    E   123_A      E   123_A     0.489     0    0.012   0.316     1.071   97.619   94.762
LGA    L   124_A      L   124_A     0.473     0    0.056   0.061     0.670  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.388     0    0.015   0.083     0.644  100.000   98.810
LGA    P   126_A      P   126_A     0.548     0    0.044   0.351     1.340   92.857   93.265
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.087     0    0.048   1.296     7.835   83.690   58.214
LGA    A   128_A      A   128_A     0.887     0    0.013   0.017     1.075   88.214   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     0.637     0    0.021   0.125     0.912   92.857   91.342
LGA    T   130_A      T   130_A     0.322     0    0.018   0.139     1.029   95.238   91.905
LGA    E   131_A      E   131_A     1.287     0    0.098   0.889     3.667   81.548   69.841
LGA    K   132_A      K   132_A     1.978     0    0.108   0.600     4.308   62.143   57.302
LGA    D   133_A      D   133_A     3.879     0    0.011   0.270     5.874   43.810   36.429
LGA    L   134_A      L   134_A     3.020     0    0.614   1.007     4.993   42.143   55.595

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.707          0.750                  1.075           95.310   92.727

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.71    97.932    99.192    16.485

LGA_LOCAL      RMSD:   0.707  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.707  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.707  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.747919 * X  +  -0.178126 * Y  +  -0.639444 * Z  + -29.825005
  Y_new =   0.348392 * X  +  -0.925312 * Y  +  -0.149735 * Z  +  25.401270
  Z_new =  -0.565013 * X  +  -0.334766 * Y  +   0.754116 * Z  + -12.588964 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.705665  0.600450 -0.417785   [DEG:  155.0232   34.4032  -23.9373 ]
ZXZ: -1.340777  0.716489 -2.105677   [DEG:  -76.8209   41.0518 -120.6464 ]
 
# END of job
