
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     53  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     73  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     44  125  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     73  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    106  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133     62  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    104  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     81  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     87  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     97  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    106  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    105  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     57  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     62  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     87  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     87  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     87  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     87  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133     72  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133     89  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     89  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133     98  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    107  126  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     29  122  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133      9   96  131  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5   67  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3    3  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    107    126    131    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  80.45  94.74  98.50  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.39   0.47   0.54   0.54   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63
GDT RMS_ALL_AT   0.65   0.66   0.64   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.161     0    0.029   0.597     2.990   83.690   78.889
LGA    M     3_A      M     3_A     1.032     0    0.047   0.204     1.129   83.690   84.821
LGA    A     4_A      A     4_A     1.200     0    0.050   0.063     1.502   85.952   83.333
LGA    E     5_A      E     5_A     0.908     0    0.078   0.132     1.341   90.595   85.503
LGA    L     6_A      L     6_A     0.292     0    0.040   0.137     0.585   97.619   98.810
LGA    K     7_A      K     7_A     0.466     0    0.023   0.576     1.593  100.000   90.794
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.257     0    0.026   0.101     0.444  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.208     0    0.031   0.772     2.845  100.000   80.952
LGA    W    10_A      W    10_A     0.282     0    0.014   0.096     0.390  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.316     0    0.056   0.076     0.388  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.412     0    0.043   0.127     0.619  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.448     0    0.024   0.103     0.845  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.256     0    0.023   0.027     0.281  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.120     0    0.068   0.099     0.267  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.271     0    0.053   0.289     0.843   97.619   97.884
LGA    A    17_A      A    17_A     0.408     0    0.032   0.046     0.578  100.000   98.095
LGA    L    18_A      L    18_A     0.357     0    0.084   0.122     0.679   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.129     0    0.025   0.175     0.962  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.177     0    0.012   0.280     1.191  100.000   96.878
LGA    A    21_A      A    21_A     0.286     0    0.089   0.100     0.691   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.343     0    0.023   0.036     0.904  100.000   94.444
LGA    V    23_A      V    23_A     0.391     0    0.030   0.051     0.430  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.496     0    0.020   0.024     0.589   95.238   93.197
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.482     0    0.011   0.137     0.839   92.857   94.444
LGA    S    26_A      S    26_A     0.535     0    0.014   0.027     0.672   92.857   92.063
LGA    H    27_A      H    27_A     0.595     0    0.026   0.438     2.133   95.238   84.476
LGA    F    28_A      F    28_A     0.405     0    0.020   0.085     0.641  100.000   93.939
LGA    P    29_A      P    29_A     0.212     0    0.039   0.038     0.349  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.107     0    0.048   0.058     0.247  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.192     0    0.028   0.028     0.218  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.034     0    0.037   0.042     0.167  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.121     0    0.017   0.044     0.301  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.183     0    0.024   0.054     0.223  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.139     0    0.042   0.046     0.329  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.335     0    0.016   0.051     0.457  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.480     0    0.042   0.531     1.485   97.619   94.815
LGA    S    38_A      S    38_A     0.608     0    0.033   0.078     0.655   92.857   92.063
LGA    G    39_A      G    39_A     0.409     0    0.019   0.019     0.458  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.213     0    0.021   0.750     3.817  100.000   81.429
LGA    I    41_A      I    41_A     0.332     0    0.079   1.410     3.825  100.000   82.917
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.167     0    0.080   0.084     0.668  100.000   97.619
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.162     0    0.009   0.761     2.607  100.000   87.143
LGA    G    44_A      G    44_A     0.099     0    0.008   0.008     0.170  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.133     0    0.010   0.083     0.655  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.106     0    0.047   0.114     0.358  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.286     0    0.024   0.050     0.501  100.000   98.810
LGA    E    48_A      E    48_A     0.344     0    0.068   0.154     0.700   97.619   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.373     0    0.028   0.062     0.781  100.000   95.238
LGA    A    50_A      A    50_A     0.580     0    0.023   0.028     0.744   92.857   92.381
LGA    S    51_A      S    51_A     0.605     0    0.088   0.084     1.108   92.857   90.556
LGA    F    52_A      F    52_A     0.780     0    0.048   0.587     2.426   90.476   84.199
LGA    G    53_A      G    53_A     1.037     0    0.021   0.021     1.072   85.952   85.952
LGA    L    54_A      L    54_A     0.767     0    0.034   0.170     1.109   90.476   88.214
LGA    T    55_A      T    55_A     0.371     0    0.034   0.043     0.524   97.619   98.639
LGA    N    56_A      N    56_A     0.275     0    0.031   0.129     0.475  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.054     0    0.018   0.112     0.540  100.000   98.413
LGA    A    58_A      A    58_A     0.135     0    0.022   0.030     0.157  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.178     0    0.043   0.152     0.672  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.172     0    0.025   0.197     1.410  100.000   94.069
LGA    T    61_A      T    61_A     0.229     0    0.019   0.071     0.337  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.304     0    0.036   0.038     0.339  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.331     0    0.060   0.063     0.557   97.619   99.134
LGA    F    64_A      F    64_A     0.279     0    0.016   0.062     0.766  100.000   94.805
LGA    K    65_A      K    65_A     0.150     0    0.027   0.082     0.264  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.406     0    0.022   0.034     0.481  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.370     0    0.040   0.044     0.413  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.393     0    0.064   0.135     0.539  100.000   98.413
LGA    E    69_A      E    69_A     0.625     0    0.022   0.211     0.724   90.476   90.476
LGA    G    70_A      G    70_A     0.666     0    0.034   0.034     0.666   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.518     0    0.020   0.205     1.156   90.476   90.529
LGA    R    72_A      R    72_A     0.511     0    0.045   0.113     0.878   95.238   92.208
LGA    S    73_A      S    73_A     0.444     0    0.086   0.091     0.555   97.619   98.413
LGA    F    74_A      F    74_A     0.115     0    0.011   0.051     0.222  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.029     0    0.081   0.089     0.435  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.076     0    0.056   0.744     3.913  100.000   77.381
LGA    L    77_A      L    77_A     0.064     0    0.015   0.079     0.276  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.058     0    0.009   0.038     0.241  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.071     0    0.046   0.074     0.291  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.035     0    0.023   0.050     0.167  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.136     0    0.022   0.022     0.299  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.225     0    0.022   0.067     0.394  100.000  100.000
LGA    T    83_A      T    83_A     0.465     0    0.018   0.065     1.233  100.000   93.333
LGA    P    84_A      P    84_A     0.301     0    0.064   0.404     1.807   97.619   92.041
LGA    D    85_A      D    85_A     0.380     0    0.061   0.078     0.581   97.619   94.048
LGA    P    86_A      P    86_A     0.614     0    0.068   0.063     0.716   92.857   95.918
LGA    I    87_A      I    87_A     0.985     0    0.022   1.247     3.469   92.857   81.071
LGA    S    88_A      S    88_A     0.867     0    0.046   0.165     1.682   90.476   86.032
LGA    P    89_A      P    89_A     0.735     0    0.021   0.118     0.937   90.476   90.476
LGA    C    90_A      C    90_A     0.846     0    0.015   0.061     0.851   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     0.998     0    0.062   0.062     0.998   90.476   90.476
LGA    A    92_A      A    92_A     0.886     0    0.016   0.023     0.936   90.476   90.476
LGA    C    93_A      C    93_A     0.414     0    0.020   0.054     0.607   97.619   98.413
LGA    R    94_A      R    94_A     0.421     0    0.035   0.138     1.469  100.000   93.203
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.459     0    0.056   0.135     0.836  100.000   95.767
LGA    V    96_A      V    96_A     0.374     0    0.022   0.033     0.452  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.348     0    0.020   0.927     2.706  100.000   92.262
LGA    A    98_A      A    98_A     0.333     0    0.016   0.024     0.475  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.509     0    0.028   0.190     1.300   95.238   90.635
LGA    F   100_A      F   100_A     0.226     0    0.019   0.070     0.303  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.198     0    0.033   0.048     0.260  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.281     0    0.023   0.029     0.307  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.109     0    0.072   0.078     0.252  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.140     0    0.033   0.342     1.137  100.000   97.679
LGA    M   105_A      M   105_A     0.122     0    0.013   0.112     0.341  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.235     0    0.050   0.225     0.571  100.000   98.639
LGA    V   107_A      V   107_A     0.298     0    0.033   0.046     0.346  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.253     0    0.033   0.036     0.289  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.352     0    0.010   0.060     0.540  100.000   98.810
LGA    V   110_A      V   110_A     0.287     0    0.033   0.036     0.300  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.455     0    0.020   0.020     0.484  100.000  100.000
LGA    D   112_A      D   112_A     0.427     0    0.024   0.114     1.452  100.000   91.845
LGA    N   113_A      N   113_A     0.365     0    0.041   0.863     3.162   97.619   87.917
LGA    G   114_A      G   114_A     0.562     0    0.057   0.057     0.562   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.162     0    0.075   1.121     2.636   97.619   87.483
LGA    T   116_A      T   116_A     0.085     0    0.036   0.047     0.324  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.137     0    0.042   0.653     1.745  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.215     0    0.049   0.073     0.537   97.619   98.095
LGA    T   119_A      T   119_A     0.206     0    0.039   0.061     0.345  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.232     0    0.018   0.026     0.335  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.216     0    0.011   0.043     0.272  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.234     0    0.013   1.102     4.049  100.000   84.719
LGA    E   123_A      E   123_A     0.357     0    0.009   0.296     1.054  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.343     0    0.054   0.063     0.621  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.267     0    0.020   0.073     0.561  100.000   98.810
LGA    P   126_A      P   126_A     0.399     0    0.049   0.053     0.631   95.238   97.279
LGA    Y   127_A      Y   127_A     1.032     0    0.036   1.301     7.282   83.690   60.119
LGA    A   128_A      A   128_A     0.936     0    0.016   0.018     1.052   88.214   88.667
LGA    F   129_A      F   129_A     0.762     0    0.015   0.089     0.959   90.476   90.476
LGA    T   130_A      T   130_A     0.270     0    0.019   0.158     0.889  100.000   97.279
LGA    E   131_A      E   131_A     1.098     0    0.096   0.884     3.532   81.548   70.741
LGA    K   132_A      K   132_A     1.804     0    0.108   0.605     4.455   63.690   57.249
LGA    D   133_A      D   133_A     3.726     0    0.032   0.274     5.865   45.238   37.143
LGA    L   134_A      L   134_A     2.760     0    0.614   1.024     4.449   48.690   59.940

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.630          0.670                  0.994           96.423   93.918

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.63    98.496    99.370    18.229

LGA_LOCAL      RMSD:   0.630  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.630  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.630  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.093331 * X  +   0.994785 * Y  +   0.041136 * Z  + -29.873480
  Y_new =   0.010467 * X  +   0.040333 * Y  +  -0.999131 * Z  +  24.773954
  Z_new =  -0.995580 * X  +   0.093681 * Y  +  -0.006648 * Z  + -13.312645 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.111685  1.476741  1.641645   [DEG:    6.3991   84.6110   94.0593 ]
ZXZ:  0.041148  1.577445 -1.476976   [DEG:    2.3576   90.3809  -84.6245 ]
 
# END of job
