
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     48  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     60  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     48  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     70  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    110  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    104  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     85  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     52  123  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     86  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     85  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     45  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133     85  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     85  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     70  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     85  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    110  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133    111  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    104  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133     88  128  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133      3  121  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133      8   32  130  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5   65  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3    3   38  123  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    111    128    130    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  83.46  96.24  97.74  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.26   0.39   0.42   0.47   0.56   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65
GDT RMS_ALL_AT   0.69   0.68   0.68   0.67   0.66   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A
#   possible swapping detected:  D   133_A      D   133_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.179     0    0.028   0.604     3.044   83.690   77.698
LGA    M     3_A      M     3_A     1.043     0    0.047   0.213     1.151   85.952   85.952
LGA    A     4_A      A     4_A     1.153     0    0.052   0.065     1.426   85.952   85.048
LGA    E     5_A      E     5_A     0.868     0    0.076   0.128     1.182   92.857   87.513
LGA    L     6_A      L     6_A     0.339     0    0.038   0.139     0.603   97.619   97.619
LGA    K     7_A      K     7_A     0.478     0    0.025   0.563     1.552  100.000   91.746
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.277     0    0.027   0.098     0.523  100.000   98.942
LGA    E     9_A      E     9_A     0.272     0    0.034   0.778     3.012  100.000   80.159
LGA    W    10_A      W    10_A     0.332     0    0.017   0.092     0.386  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.326     0    0.058   0.075     0.379  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.460     0    0.050   0.131     0.657  100.000   95.238
LGA    T    13_A      T    13_A     0.486     0    0.029   0.113     0.908  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.250     0    0.028   0.033     0.296  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.115     0    0.069   0.100     0.249  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.281     0    0.054   0.262     0.930   97.619   96.825
LGA    A    17_A      A    17_A     0.454     0    0.032   0.043     0.607   97.619   96.190
LGA    L    18_A      L    18_A     0.371     0    0.082   0.110     0.720   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.155     0    0.026   0.183     0.870  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.190     0    0.022   0.225     0.577  100.000   98.942
LGA    A    21_A      A    21_A     0.274     0    0.092   0.106     0.639   97.619   98.095
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.333     0    0.025   0.057     1.033  100.000   93.690
LGA    V    23_A      V    23_A     0.343     0    0.027   0.047     0.392  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.431     0    0.025   0.027     0.574   95.238   97.279
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.440     0    0.006   0.123     0.693  100.000   96.825
LGA    S    26_A      S    26_A     0.373     0    0.016   0.039     0.467  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.426     0    0.025   0.431     1.919  100.000   88.952
LGA    F    28_A      F    28_A     0.201     0    0.019   0.055     0.440  100.000  100.000
LGA    P    29_A      P    29_A     0.307     0    0.040   0.039     0.362  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.080     0    0.048   0.054     0.149  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.161     0    0.029   0.029     0.216  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.067     0    0.041   0.045     0.208  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.142     0    0.014   0.033     0.244  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.244     0    0.024   0.048     0.340  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.198     0    0.031   0.034     0.335  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.293     0    0.014   0.052     0.380  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.318     0    0.053   0.437     1.134  100.000   96.878
LGA    S    38_A      S    38_A     0.241     0    0.028   0.068     0.321  100.000  100.000
LGA    G    39_A      G    39_A     0.233     0    0.022   0.022     0.233  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.171     0    0.021   0.739     3.839  100.000   80.476
LGA    I    41_A      I    41_A     0.421     0    0.079   1.431     3.684  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.197     0    0.084   0.067     0.527  100.000   99.206
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.171     0    0.016   0.489     1.618  100.000   90.794
LGA    G    44_A      G    44_A     0.141     0    0.010   0.010     0.203  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.187     0    0.012   0.092     0.679  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.183     0    0.050   0.100     0.338  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.308     0    0.038   0.053     0.492  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.347     0    0.066   0.143     0.729   97.619   97.884
LGA    N    49_A      N    49_A     0.485     0    0.019   0.059     1.054  100.000   94.107
LGA    A    50_A      A    50_A     0.285     0    0.008   0.016     0.477  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.728     0    0.070   0.071     1.310   92.857   89.048
LGA    F    52_A      F    52_A     0.907     0    0.049   0.483     1.890   90.476   86.450
LGA    G    53_A      G    53_A     1.322     0    0.014   0.014     1.399   81.429   81.429
LGA    L    54_A      L    54_A     0.978     0    0.041   0.167     1.513   88.214   84.881
LGA    T    55_A      T    55_A     0.447     0    0.030   0.041     0.654   97.619   97.279
LGA    N    56_A      N    56_A     0.169     0    0.037   0.133     0.313  100.000  100.000
LGA    C    57_A      C    57_A     0.092     0    0.015   0.078     0.330  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.186     0    0.025   0.033     0.235  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.218     0    0.043   0.244     0.856  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.150     0    0.034   0.118     0.876  100.000   97.403
LGA    T    61_A      T    61_A     0.133     0    0.014   0.067     0.287  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.217     0    0.039   0.041     0.282  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.274     0    0.052   0.063     0.471  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.209     0    0.017   0.053     0.612  100.000   97.403
LGA    K    65_A      K    65_A     0.162     0    0.028   0.071     0.378  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.415     0    0.015   0.027     0.505   97.619   98.095
LGA    V    67_A      V    67_A     0.416     0    0.037   0.040     0.461  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.442     0    0.068   0.131     0.548   97.619   96.825
LGA    E    69_A      E    69_A     0.717     0    0.024   0.198     0.800   90.476   90.476
LGA    G    70_A      G    70_A     0.809     0    0.028   0.028     0.809   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.658     0    0.025   0.161     0.981   90.476   91.534
LGA    R    72_A      R    72_A     0.620     0    0.049   0.099     0.922   90.476   90.476
LGA    S    73_A      S    73_A     0.366     0    0.065   0.067     0.521   97.619   98.413
LGA    F    74_A      F    74_A     0.234     0    0.010   0.059     0.343  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.155     0    0.057   0.098     0.276  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.145     0    0.052   0.546     2.870  100.000   83.333
LGA    L    77_A      L    77_A     0.117     0    0.013   0.081     0.221  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.029     0    0.011   0.043     0.206  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.061     0    0.039   0.080     0.253  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.033     0    0.030   0.060     0.238  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.224     0    0.019   0.019     0.372  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.248     0    0.039   0.084     0.338  100.000  100.000
LGA    T    83_A      T    83_A     0.360     0    0.023   0.049     0.887  100.000   95.918
LGA    P    84_A      P    84_A     0.194     0    0.051   0.398     1.541  100.000   94.762
LGA    D    85_A      D    85_A     0.282     0    0.038   0.080     0.528  100.000   98.810
LGA    P    86_A      P    86_A     0.572     0    0.073   0.067     0.688   92.857   95.918
LGA    I    87_A      I    87_A     0.746     0    0.019   0.089     0.969   92.857   91.667
LGA    S    88_A      S    88_A     0.913     0    0.048   0.163     1.829   90.476   86.032
LGA    P    89_A      P    89_A     0.776     0    0.016   0.100     1.111   90.476   87.891
LGA    C    90_A      C    90_A     0.769     0    0.012   0.048     0.793   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     0.925     0    0.058   0.058     0.925   90.476   90.476
LGA    A    92_A      A    92_A     0.807     0    0.016   0.019     0.870   90.476   90.476
LGA    C    93_A      C    93_A     0.351     0    0.026   0.081     0.540   97.619   98.413
LGA    R    94_A      R    94_A     0.428     0    0.042   0.066     1.114  100.000   93.160
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.466     0    0.060   0.141     0.897  100.000   95.767
LGA    V    96_A      V    96_A     0.296     0    0.020   0.049     0.407  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.299     0    0.015   0.221     0.667  100.000   98.810
LGA    A    98_A      A    98_A     0.332     0    0.018   0.026     0.420  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.422     0    0.041   0.174     1.216  100.000   94.815
LGA    F   100_A      F   100_A     0.161     0    0.020   0.132     0.341  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.160     0    0.031   0.044     0.275  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.313     0    0.023   0.027     0.393  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.268     0    0.067   0.074     0.295  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.222     0    0.032   0.360     1.169  100.000   97.679
LGA    M   105_A      M   105_A     0.315     0    0.012   0.098     0.467  100.000  100.000
LGA    P   106_A      P   106_A     0.282     0    0.025   0.230     0.484  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.180     0    0.029   0.047     0.262  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.226     0    0.038   0.038     0.262  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.373     0    0.012   0.062     0.530  100.000   98.810
LGA    V   110_A      V   110_A     0.310     0    0.036   0.065     0.325  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.522     0    0.029   0.029     0.595   90.476   90.476
LGA    D   112_A      D   112_A     0.520     0    0.023   0.126     1.251   92.857   90.536
LGA    N   113_A      N   113_A     0.524     0    0.034   0.851     3.365   95.238   84.464
LGA    G   114_A      G   114_A     0.471     0    0.042   0.042     0.550   97.619   97.619
LGA    V   115_A      V   115_A     0.410     0    0.078   1.095     2.663   97.619   86.395
LGA    T   116_A      T   116_A     0.191     0    0.029   0.038     0.361  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.203     0    0.042   0.650     1.525  100.000   92.857
LGA    A   118_A      A   118_A     0.282     0    0.053   0.079     0.385  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.236     0    0.035   0.061     0.372  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.270     0    0.018   0.029     0.378  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.251     0    0.011   0.058     0.313  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.236     0    0.011   1.109     4.181  100.000   84.719
LGA    E   123_A      E   123_A     0.322     0    0.011   0.184     0.807  100.000   98.942
LGA    L   124_A      L   124_A     0.350     0    0.055   0.070     0.558  100.000   98.810
LGA    L   125_A      L   125_A     0.271     0    0.016   0.075     0.464  100.000  100.000
LGA    P   126_A      P   126_A     0.100     0    0.039   0.355     0.912  100.000   98.639
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.536     0    0.029   1.300     8.093   92.857   61.389
LGA    A   128_A      A   128_A     0.532     0    0.014   0.018     0.626   90.476   92.381
LGA    F   129_A      F   129_A     0.532     0    0.026   0.154     1.294   92.857   88.874
LGA    T   130_A      T   130_A     0.576     0    0.022   0.141     1.041   90.476   90.544
LGA    E   131_A      E   131_A     1.281     0    0.093   0.884     3.603   81.548   71.640
LGA    K   132_A      K   132_A     2.012     0    0.113   0.600     4.509   58.333   55.079
LGA    D   133_A      D   133_A     3.844     0    0.015   1.062     6.535   43.810   37.560
LGA    L   134_A      L   134_A     3.243     0    0.625   1.032     4.710   42.143   52.917

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.653          0.695                  0.997           96.517   94.317

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.65    98.684    99.380    17.655

LGA_LOCAL      RMSD:   0.653  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.653  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.653  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.425123 * X  +   0.808140 * Y  +  -0.407651 * Z  + -29.511995
  Y_new =   0.028676 * X  +  -0.438125 * Y  +  -0.898457 * Z  +  26.285530
  Z_new =  -0.904681 * X  +  -0.393644 * Y  +   0.163083 * Z  + -12.842222 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  3.074242  1.130631 -1.178032   [DEG:  176.1411   64.7804  -67.4963 ]
ZXZ: -0.425947  1.406982 -1.981207   [DEG:  -24.4049   80.6141 -113.5148 ]
 
# END of job
