
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     18  105  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     21  111  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     20  111  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     30  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    108  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133     98  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133    106  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133    101  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133     97  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133     97  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133     97  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    111  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133     91  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    115  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    108  125  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133     36  117  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     51  111  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5    5  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133      3   96  132  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    115    125    132    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  86.47  93.98  99.25  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.32   0.53   0.53   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60
GDT RMS_ALL_AT   0.64   0.64   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.697     0    0.024   0.588     3.381   75.000   70.476
LGA    M     3_A      M     3_A     1.547     0    0.049   0.656     1.726   77.143   77.143
LGA    A     4_A      A     4_A     1.558     0    0.047   0.060     1.886   77.143   76.286
LGA    E     5_A      E     5_A     1.220     0    0.057   0.200     1.869   85.952   80.582
LGA    L     6_A      L     6_A     0.494     0    0.041   0.138     0.885   97.619   94.048
LGA    K     7_A      K     7_A     0.592     0    0.020   0.905     4.804   95.238   72.698
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.319     0    0.024   0.097     0.479  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.226     0    0.033   0.354     1.730  100.000   95.926
LGA    W    10_A      W    10_A     0.291     0    0.010   0.179     0.561  100.000   97.959
LGA    I    11_A      I    11_A     0.301     0    0.051   0.072     0.421  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.280     0    0.049   0.129     0.560  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.372     0    0.023   0.120     0.709  100.000   97.279
LGA    A    14_A      A    14_A     0.265     0    0.031   0.036     0.292  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.184     0    0.063   0.097     0.308  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.292     0    0.077   0.270     0.982   97.619   95.767
LGA    A    17_A      A    17_A     0.371     0    0.021   0.028     0.497  100.000  100.000
LGA    L    18_A      L    18_A     0.299     0    0.084   0.107     0.682   97.619   98.810
LGA    D    19_A      D    19_A     0.144     0    0.021   0.194     0.704  100.000   98.810
LGA    K    20_A      K    20_A     0.185     0    0.014   0.199     0.714  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.112     0    0.075   0.086     0.360  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.299     0    0.024   0.044     0.738  100.000   95.238
LGA    V    23_A      V    23_A     0.321     0    0.030   0.040     0.365  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.449     0    0.022   0.028     0.572   97.619   95.918
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.282     0    0.004   0.167     0.684  100.000   98.413
LGA    S    26_A      S    26_A     0.237     0    0.017   0.034     0.371  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.371     0    0.030   0.366     1.924  100.000   89.857
LGA    F    28_A      F    28_A     0.177     0    0.023   0.039     0.617  100.000   97.403
LGA    P    29_A      P    29_A     0.354     0    0.034   0.035     0.364  100.000  100.000
LGA    V    30_A      V    30_A     0.199     0    0.040   0.046     0.302  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.134     0    0.022   0.022     0.184  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.084     0    0.031   0.038     0.182  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.097     0    0.019   0.057     0.328  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.185     0    0.017   0.046     0.281  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.220     0    0.024   0.031     0.398  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.280     0    0.024   0.075     0.525   97.619   98.639
LGA    E    37_A      E    37_A     0.402     0    0.046   0.549     1.357  100.000   95.873
LGA    S    38_A      S    38_A     0.264     0    0.022   0.125     0.601  100.000   98.413
LGA    G    39_A      G    39_A     0.492     0    0.060   0.060     0.492  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.214     0    0.016   0.725     4.255  100.000   79.101
LGA    I    41_A      I    41_A     0.273     0    0.086   1.406     3.786  100.000   82.917
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.136     0    0.093   0.092     0.266  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.203     0    0.014   0.094     0.356  100.000  100.000
LGA    G    44_A      G    44_A     0.182     0    0.009   0.009     0.204  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.160     0    0.013   0.081     0.653  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.171     0    0.044   0.072     0.290  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.325     0    0.038   0.058     0.540  100.000   97.619
LGA    E    48_A      E    48_A     0.379     0    0.034   0.097     0.574   97.619   98.942
LGA    N    49_A      N    49_A     0.645     0    0.014   0.049     1.341   95.238   91.726
LGA    A    50_A      A    50_A     0.317     0    0.011   0.012     0.522  100.000   98.095
LGA    S    51_A      S    51_A     0.659     0    0.075   0.079     1.301   92.857   89.048
LGA    F    52_A      F    52_A     0.490     0    0.049   0.071     1.030   97.619   92.251
LGA    G    53_A      G    53_A     0.685     0    0.019   0.019     0.685   90.476   90.476
LGA    L    54_A      L    54_A     0.593     0    0.024   0.103     1.420   95.238   89.464
LGA    T    55_A      T    55_A     0.147     0    0.076   0.076     0.332  100.000  100.000
LGA    N    56_A      N    56_A     0.307     0    0.026   0.078     0.550  100.000   96.429
LGA    C    57_A      C    57_A     0.150     0    0.013   0.059     0.509  100.000   98.413
LGA    A    58_A      A    58_A     0.152     0    0.027   0.033     0.152  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.147     0    0.035   0.168     0.758  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.203     0    0.045   0.119     1.309  100.000   92.338
LGA    T    61_A      T    61_A     0.250     0    0.016   0.068     0.315  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.249     0    0.039   0.042     0.249  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.191     0    0.055   0.062     0.336  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.212     0    0.013   0.088     0.624  100.000   97.403
LGA    K    65_A      K    65_A     0.144     0    0.031   0.093     0.376  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.174     0    0.008   0.024     0.230  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.298     0    0.041   0.041     0.464  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.358     0    0.057   0.129     0.430  100.000  100.000
LGA    E    69_A      E    69_A     0.458     0    0.024   0.238     0.685  100.000   96.825
LGA    G    70_A      G    70_A     0.546     0    0.026   0.026     0.548   92.857   92.857
LGA    E    71_A      E    71_A     0.468     0    0.027   0.248     1.446   95.238   91.587
LGA    R    72_A      R    72_A     0.464     0    0.029   0.085     0.821   97.619   93.074
LGA    S    73_A      S    73_A     0.367     0    0.057   0.059     0.438  100.000  100.000
LGA    F    74_A      F    74_A     0.084     0    0.012   0.077     0.324  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.084     0    0.023   0.067     0.233  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.101     0    0.054   0.137     0.439  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.054     0    0.012   0.069     0.328  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.056     0    0.010   0.047     0.191  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.038     0    0.023   0.060     0.192  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.124     0    0.029   0.058     0.296  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.289     0    0.013   0.013     0.656   97.619   97.619
LGA    H    82_A      H    82_A     0.741     0    0.044   0.113     1.009   88.214   89.571
LGA    T    83_A      T    83_A     0.804     0    0.031   0.053     1.096   90.476   89.184
LGA    P    84_A      P    84_A     0.658     0    0.038   0.394     0.951   90.476   91.837
LGA    D    85_A      D    85_A     0.710     0    0.021   0.032     1.070   90.476   89.345
LGA    P    86_A      P    86_A     0.660     0    0.053   0.050     0.714   90.476   90.476
LGA    I    87_A      I    87_A     0.468     0    0.049   0.077     0.538   97.619   98.810
LGA    S    88_A      S    88_A     0.469     0    0.030   0.112     0.676   95.238   96.825
LGA    P    89_A      P    89_A     0.459     0    0.012   0.093     0.527   97.619   95.918
LGA    C    90_A      C    90_A     0.495     0    0.020   0.054     0.592   95.238   96.825
LGA    G    91_A      G    91_A     0.658     0    0.055   0.055     0.658   92.857   92.857
LGA    A    92_A      A    92_A     0.385     0    0.017   0.022     0.499  100.000  100.000
LGA    C    93_A      C    93_A     0.192     0    0.016   0.043     0.403  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.292     0    0.042   0.076     1.085  100.000   94.848
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.227     0    0.047   0.105     0.498  100.000  100.000
LGA    V    96_A      V    96_A     0.181     0    0.024   0.043     0.436  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.214     0    0.014   0.939     2.995  100.000   94.643
LGA    A    98_A      A    98_A     0.376     0    0.016   0.022     0.543   97.619   98.095
LGA    E    99_A      E    99_A     0.293     0    0.050   0.149     0.600  100.000   98.942
LGA    F   100_A      F   100_A     0.438     0    0.026   0.071     0.738   97.619   93.074
LGA    C   101_A      C   101_A     0.263     0    0.030   0.044     0.291  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.289     0    0.019   0.024     0.364  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.290     0    0.083   0.093     0.435  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.309     0    0.034   0.375     1.551  100.000   94.226
LGA    M   105_A      M   105_A     0.387     0    0.013   0.107     0.554  100.000   98.810
LGA    P   106_A      P   106_A     0.324     0    0.030   0.209     0.389  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.169     0    0.036   0.043     0.255  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.184     0    0.023   0.041     0.280  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.310     0    0.014   0.039     0.405  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.260     0    0.044   0.062     0.299  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.676     0    0.016   0.016     0.685   90.476   90.476
LGA    D   112_A      D   112_A     0.873     0    0.020   0.109     1.846   90.476   84.881
LGA    N   113_A      N   113_A     0.764     0    0.040   0.824     3.738   92.857   80.357
LGA    G   114_A      G   114_A     0.587     0    0.054   0.054     0.603   90.476   90.476
LGA    V   115_A      V   115_A     0.615     0    0.064   1.074     2.796   90.476   80.952
LGA    T   116_A      T   116_A     0.299     0    0.028   0.044     0.371  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.310     0    0.055   0.659     1.548  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.487     0    0.047   0.074     0.748  100.000   98.095
LGA    T   119_A      T   119_A     0.325     0    0.029   0.050     0.401  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.347     0    0.027   0.042     0.519  100.000   98.639
LGA    V   121_A      V   121_A     0.220     0    0.015   0.043     0.303  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.206     0    0.013   1.092     3.615  100.000   86.710
LGA    E   123_A      E   123_A     0.249     0    0.020   0.373     1.225  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.257     0    0.061   0.067     0.654  100.000   97.619
LGA    L   125_A      L   125_A     0.213     0    0.021   0.097     0.826  100.000   96.429
LGA    P   126_A      P   126_A     0.150     0    0.040   0.349     0.960  100.000   98.639
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.581     0    0.047   1.300     7.901   92.857   61.944
LGA    A   128_A      A   128_A     0.823     0    0.023   0.028     0.866   90.476   90.476
LGA    F   129_A      F   129_A     0.514     0    0.018   0.091     0.646   95.238   92.208
LGA    T   130_A      T   130_A     0.252     0    0.028   0.153     1.199   95.238   91.905
LGA    E   131_A      E   131_A     1.442     0    0.087   1.070     3.426   81.548   75.185
LGA    K   132_A      K   132_A     1.704     0    0.093   0.611     4.931   67.262   55.979
LGA    D   133_A      D   133_A     3.278     0    0.015   0.239     5.338   52.024   42.560
LGA    L   134_A      L   134_A     2.255     0    0.617   1.020     3.050   59.167   65.060

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.600          0.612                  0.968           96.718   94.434

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.60    98.308    99.416    18.992

LGA_LOCAL      RMSD:   0.600  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.600  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.600  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.157297 * X  +  -0.554301 * Y  +  -0.817318 * Z  + -29.945627
  Y_new =   0.986344 * X  +  -0.047270 * Y  +  -0.157769 * Z  +  26.517168
  Z_new =   0.048817 * X  +  -0.830973 * Y  +   0.554167 * Z  + -13.495215 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.728939 -0.048837 -0.982640   [DEG:   99.0609   -2.7981  -56.3011 ]
ZXZ: -1.380109  0.983435  3.082913   [DEG:  -79.0744   56.3467  176.6379 ]
 
# END of job
