
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  134 ( 1014),  selected  133 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  133 ( 1010),  selected  133 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.59     0.59
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.59     0.59
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   133       2_A - 134_A       0.59     0.59
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  133
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A    133  133  133     51  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M     3_A     M     3_A    133  133  133     55  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A     4_A     A     4_A    133  133  133     38  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A    133  133  133     64  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K     7_A     K     7_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q     8_A     Q     8_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E     9_A     E     9_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     W    10_A     W    10_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    12_A     N    12_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    13_A     T    13_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    15_A     I    15_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    16_A     E    16_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    17_A     A    17_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    19_A     D    19_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    20_A     K    20_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    21_A     A    21_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    22_A     Y    22_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    24_A     P    24_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    25_A     Y    25_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    26_A     S    26_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    27_A     H    27_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    28_A     F    28_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    30_A     V    30_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    33_A     C    33_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    34_A     L    34_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    36_A     T    36_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    37_A     E    37_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    38_A     S    38_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    39_A     G    39_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y    42_A     Y    42_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    44_A     G    44_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    46_A     N    46_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    47_A     I    47_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    48_A     E    48_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    49_A     N    49_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    50_A     A    50_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    52_A     F    52_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    54_A     L    54_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    55_A     T    55_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N    56_A     N    56_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    57_A     C    57_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    58_A     A    58_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    60_A     R    60_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    61_A     T    61_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    63_A     F    63_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    64_A     F    64_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    66_A     A    66_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    68_A     S    68_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    69_A     E    69_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    70_A     G    70_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    71_A     E    71_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    73_A     S    73_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F    74_A     F    74_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    76_A     H    76_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L    77_A     L    77_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    78_A     V    78_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    80_A     A    80_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    81_A     G    81_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     H    82_A     H    82_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T    83_A     T    83_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    84_A     P    84_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D    85_A     D    85_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    86_A     P    86_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     I    87_A     I    87_A    133  133  133     89  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     S    88_A     S    88_A    133  133  133     89  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    133  133  133    110  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    90_A     C    90_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G    91_A     G    91_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    92_A     A    92_A    133  133  133     88  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C    93_A     C    93_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Q    95_A     Q    95_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M    97_A     M    97_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A    98_A     A    98_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E    99_A     E    99_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     C   101_A     C   101_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   103_A     P   103_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     M   105_A     M   105_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   106_A     P   106_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   107_A     V   107_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   108_A     T   108_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   109_A     L   109_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   110_A     V   110_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   112_A     D   112_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     G   114_A     G   114_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   115_A     V   115_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   117_A     K   117_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   119_A     T   119_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   120_A     T   120_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     V   121_A     V   121_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     R   122_A     R   122_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   123_A     E   123_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     P   126_A     P   126_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     Y   127_A     Y   127_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     F   129_A     F   129_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     T   130_A     T   130_A    133  133  133    113  128  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     E   131_A     E   131_A    133  133  133      3  114  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A    133  133  133     33  118  131  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     D   133_A     D   133_A    133  133  133      3    3    5  122  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_GDT     L   134_A     L   134_A    133  133  133     35   90  121  132  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133  133 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    113    128    131    132    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133    133 
GDT PERCENT_AT  84.96  96.24  98.50  99.25 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.27   0.38   0.44   0.50   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59
GDT RMS_ALL_AT   0.62   0.62   0.60   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59   0.59

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E     9_A      E     9_A
#   possible swapping detected:  E    16_A      E    16_A
#   possible swapping detected:  Y    22_A      Y    22_A
#   possible swapping detected:  F    28_A      F    28_A
#   possible swapping detected:  E    37_A      E    37_A
#   possible swapping detected:  Y    42_A      Y    42_A
#   possible swapping detected:  E    48_A      E    48_A
#   possible swapping detected:  F    52_A      F    52_A
#   possible swapping detected:  E    59_A      E    59_A
#   possible swapping detected:  E    69_A      E    69_A
#   possible swapping detected:  E    71_A      E    71_A
#   possible swapping detected:  E    99_A      E    99_A
#   possible swapping detected:  E   123_A      E   123_A
#   possible swapping detected:  F   129_A      F   129_A
#   possible swapping detected:  E   131_A      E   131_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S     2_A      S     2_A     1.181     0    0.027   0.610     3.066   81.429   76.190
LGA    M     3_A      M     3_A     1.093     0    0.076   0.819     3.475   83.690   79.762
LGA    A     4_A      A     4_A     1.254     0    0.057   0.070     1.571   83.690   81.524
LGA    E     5_A      E     5_A     0.976     0    0.077   0.142     1.396   90.595   85.503
LGA    L     6_A      L     6_A     0.371     0    0.033   0.170     0.708   97.619   96.429
LGA    K     7_A      K     7_A     0.441     0    0.023   0.898     4.536  100.000   76.508
LGA    Q     8_A      Q     8_A     0.280     0    0.028   0.106     0.474  100.000  100.000
LGA    E     9_A      E     9_A     0.214     0    0.026   0.766     2.807  100.000   80.952
LGA    W    10_A      W    10_A     0.255     0    0.014   0.105     0.387  100.000  100.000
LGA    I    11_A      I    11_A     0.281     0    0.055   0.072     0.353  100.000  100.000
LGA    N    12_A      N    12_A     0.370     0    0.046   0.127     0.561  100.000   98.810
LGA    T    13_A      T    13_A     0.450     0    0.022   0.097     0.811  100.000   95.918
LGA    A    14_A      A    14_A     0.273     0    0.037   0.041     0.311  100.000  100.000
LGA    I    15_A      I    15_A     0.185     0    0.061   0.083     0.218  100.000  100.000
LGA    E    16_A      E    16_A     0.326     0    0.063   0.265     0.857   97.619   96.825
LGA    A    17_A      A    17_A     0.448     0    0.020   0.033     0.602   97.619   96.190
LGA    L    18_A      L    18_A     0.391     0    0.071   1.021     2.445   97.619   91.012
LGA    D    19_A      D    19_A     0.299     0    0.024   0.176     0.817  100.000   96.429
LGA    K    20_A      K    20_A     0.310     0    0.019   0.276     0.993  100.000   97.884
LGA    A    21_A      A    21_A     0.170     0    0.086   0.097     0.459  100.000  100.000
LGA    Y    22_A      Y    22_A     0.237     0    0.020   0.052     0.720  100.000   96.825
LGA    V    23_A      V    23_A     0.322     0    0.029   0.048     0.411  100.000  100.000
LGA    P    24_A      P    24_A     0.307     0    0.031   0.033     0.462  100.000  100.000
LGA    Y    25_A      Y    25_A     0.412     0    0.000   0.104     0.769  100.000   96.032
LGA    S    26_A      S    26_A     0.362     0    0.016   0.031     0.373  100.000  100.000
LGA    H    27_A      H    27_A     0.286     0    0.027   0.413     1.696  100.000   90.810
LGA    F    28_A      F    28_A     0.287     0    0.026   0.052     0.774  100.000   95.671
LGA    P    29_A      P    29_A     0.501     0    0.049   0.045     0.541   95.238   95.918
LGA    V    30_A      V    30_A     0.266     0    0.046   0.056     0.318  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.244     0    0.017   0.017     0.321  100.000  100.000
LGA    A    32_A      A    32_A     0.065     0    0.038   0.045     0.254  100.000  100.000
LGA    C    33_A      C    33_A     0.143     0    0.019   0.053     0.323  100.000  100.000
LGA    L    34_A      L    34_A     0.180     0    0.020   0.050     0.227  100.000  100.000
LGA    V    35_A      V    35_A     0.143     0    0.024   0.031     0.332  100.000  100.000
LGA    T    36_A      T    36_A     0.270     0    0.017   0.037     0.320  100.000  100.000
LGA    E    37_A      E    37_A     0.325     0    0.046   0.494     1.144  100.000   95.873
LGA    S    38_A      S    38_A     0.115     0    0.039   0.059     0.290  100.000  100.000
LGA    G    39_A      G    39_A     0.344     0    0.021   0.021     0.344  100.000  100.000
LGA    K    40_A      K    40_A     0.136     0    0.027   0.143     0.585  100.000   98.942
LGA    I    41_A      I    41_A     0.330     0    0.078   1.404     3.647  100.000   81.964
LGA    Y    42_A      Y    42_A     0.095     0    0.081   0.088     0.252  100.000  100.000
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.096     0    0.009   0.723     2.637  100.000   87.143
LGA    G    44_A      G    44_A     0.156     0    0.011   0.011     0.192  100.000  100.000
LGA    I    45_A      I    45_A     0.145     0    0.011   0.091     0.605  100.000   98.810
LGA    N    46_A      N    46_A     0.210     0    0.051   0.098     0.336  100.000  100.000
LGA    I    47_A      I    47_A     0.230     0    0.020   0.048     0.321  100.000  100.000
LGA    E    48_A      E    48_A     0.312     0    0.065   0.141     0.636   97.619   97.884
LGA    N    49_A      N    49_A     0.278     0    0.031   0.088     0.623  100.000   95.238
LGA    A    50_A      A    50_A     0.235     0    0.016   0.025     0.691   97.619   98.095
LGA    S    51_A      S    51_A     0.883     0    0.076   0.075     1.384   90.476   87.460
LGA    F    52_A      F    52_A     0.771     0    0.041   0.587     1.460   90.476   87.186
LGA    G    53_A      G    53_A     0.968     0    0.016   0.016     0.968   90.476   90.476
LGA    L    54_A      L    54_A     0.650     0    0.026   0.164     1.041   95.238   91.726
LGA    T    55_A      T    55_A     0.187     0    0.046   0.056     0.376  100.000  100.000
LGA    N    56_A      N    56_A     0.154     0    0.035   0.193     0.505  100.000   98.810
LGA    C    57_A      C    57_A     0.155     0    0.018   0.111     0.368  100.000  100.000
LGA    A    58_A      A    58_A     0.202     0    0.022   0.031     0.244  100.000  100.000
LGA    E    59_A      E    59_A     0.147     0    0.035   0.203     0.789  100.000   98.942
LGA    R    60_A      R    60_A     0.100     0    0.026   0.148     0.969  100.000   96.537
LGA    T    61_A      T    61_A     0.147     0    0.014   0.066     0.298  100.000  100.000
LGA    A    62_A      A    62_A     0.214     0    0.041   0.043     0.231  100.000  100.000
LGA    F    63_A      F    63_A     0.221     0    0.056   0.056     0.387  100.000  100.000
LGA    F    64_A      F    64_A     0.189     0    0.014   0.061     0.750  100.000   94.805
LGA    K    65_A      K    65_A     0.164     0    0.020   0.070     0.454  100.000  100.000
LGA    A    66_A      A    66_A     0.266     0    0.018   0.030     0.351  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.234     0    0.037   0.040     0.255  100.000  100.000
LGA    S    68_A      S    68_A     0.334     0    0.079   0.534     2.023  100.000   94.127
LGA    E    69_A      E    69_A     0.610     0    0.023   0.268     0.937   90.476   90.476
LGA    G    70_A      G    70_A     0.610     0    0.030   0.030     0.610   90.476   90.476
LGA    E    71_A      E    71_A     0.412     0    0.020   0.050     0.478  100.000  100.000
LGA    R    72_A      R    72_A     0.419     0    0.033   0.095     0.602  100.000   93.939
LGA    S    73_A      S    73_A     0.364     0    0.069   0.071     0.515   97.619   98.413
LGA    F    74_A      F    74_A     0.149     0    0.011   0.045     0.233  100.000  100.000
LGA    T    75_A      T    75_A     0.072     0    0.021   0.051     0.186  100.000  100.000
LGA    H    76_A      H    76_A     0.114     0    0.056   0.095     0.340  100.000  100.000
LGA    L    77_A      L    77_A     0.090     0    0.007   0.068     0.194  100.000  100.000
LGA    V    78_A      V    78_A     0.084     0    0.011   0.041     0.218  100.000  100.000
LGA    V    79_A      V    79_A     0.077     0    0.033   0.074     0.202  100.000  100.000
LGA    A    80_A      A    80_A     0.113     0    0.019   0.047     0.208  100.000  100.000
LGA    G    81_A      G    81_A     0.398     0    0.012   0.012     0.398  100.000  100.000
LGA    H    82_A      H    82_A     0.365     0    0.042   0.091     0.480  100.000  100.000
LGA    T    83_A      T    83_A     0.399     0    0.029   0.050     0.874  100.000   95.918
LGA    P    84_A      P    84_A     0.254     0    0.059   0.399     1.401  100.000   97.347
LGA    D    85_A      D    85_A     0.379     0    0.039   0.073     0.584  100.000   98.810
LGA    P    86_A      P    86_A     0.599     0    0.077   0.071     0.732   92.857   94.558
LGA    I    87_A      I    87_A     0.700     0    0.023   0.084     0.736   92.857   92.857
LGA    S    88_A      S    88_A     0.673     0    0.027   0.150     1.284   90.476   88.968
LGA    P    89_A      P    89_A     0.653     0    0.015   0.096     0.787   90.476   90.476
LGA    C    90_A      C    90_A     0.746     0    0.017   0.058     0.772   90.476   90.476
LGA    G    91_A      G    91_A     0.909     0    0.061   0.061     0.909   90.476   90.476
LGA    A    92_A      A    92_A     0.770     0    0.017   0.020     0.839   90.476   90.476
LGA    C    93_A      C    93_A     0.287     0    0.016   0.057     0.481  100.000  100.000
LGA    R    94_A      R    94_A     0.378     0    0.044   0.105     1.335  100.000   92.338
LGA    Q    95_A      Q    95_A     0.420     0    0.053   0.104     0.770  100.000   95.767
LGA    V    96_A      V    96_A     0.244     0    0.022   0.038     0.330  100.000  100.000
LGA    M    97_A      M    97_A     0.273     0    0.026   0.945     2.690  100.000   92.262
LGA    A    98_A      A    98_A     0.302     0    0.018   0.025     0.367  100.000  100.000
LGA    E    99_A      E    99_A     0.327     0    0.032   0.194     1.089  100.000   94.815
LGA    F   100_A      F   100_A     0.134     0    0.026   0.071     0.245  100.000  100.000
LGA    C   101_A      C   101_A     0.177     0    0.028   0.047     0.298  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.182     0    0.018   0.024     0.238  100.000  100.000
LGA    P   103_A      P   103_A     0.168     0    0.077   0.084     0.285  100.000  100.000
LGA    D   104_A      D   104_A     0.176     0    0.035   0.355     1.229  100.000   97.679
LGA    M   105_A      M   105_A     0.261     0    0.014   0.288     0.722  100.000   97.619
LGA    P   106_A      P   106_A     0.278     0    0.048   0.222     0.422  100.000  100.000
LGA    V   107_A      V   107_A     0.255     0    0.030   0.045     0.317  100.000  100.000
LGA    T   108_A      T   108_A     0.278     0    0.034   0.037     0.322  100.000  100.000
LGA    L   109_A      L   109_A     0.361     0    0.014   0.043     0.444  100.000  100.000
LGA    V   110_A      V   110_A     0.283     0    0.035   0.060     0.308  100.000  100.000
LGA    G   111_A      G   111_A     0.604     0    0.043   0.043     0.726   90.476   90.476
LGA    D   112_A      D   112_A     0.615     0    0.022   0.122     1.334   90.476   88.214
LGA    N   113_A      N   113_A     0.657     0    0.040   0.858     3.423   90.476   82.083
LGA    G   114_A      G   114_A     0.482     0    0.043   0.043     0.561   92.857   92.857
LGA    V   115_A      V   115_A     0.483     0    0.068   1.093     2.695   95.238   85.034
LGA    T   116_A      T   116_A     0.248     0    0.028   0.038     0.346  100.000  100.000
LGA    K   117_A      K   117_A     0.271     0    0.057   0.646     1.673  100.000   93.862
LGA    A   118_A      A   118_A     0.298     0    0.045   0.070     0.401  100.000  100.000
LGA    T   119_A      T   119_A     0.215     0    0.036   0.061     0.389  100.000  100.000
LGA    T   120_A      T   120_A     0.279     0    0.018   0.031     0.378  100.000  100.000
LGA    V   121_A      V   121_A     0.243     0    0.012   0.049     0.285  100.000  100.000
LGA    R   122_A      R   122_A     0.248     0    0.011   1.114     3.989  100.000   86.710
LGA    E   123_A      E   123_A     0.318     0    0.010   0.378     1.236  100.000   96.878
LGA    L   124_A      L   124_A     0.284     0    0.056   0.067     0.576  100.000   98.810
LGA    L   125_A      L   125_A     0.228     0    0.016   0.077     0.477  100.000  100.000
LGA    P   126_A      P   126_A     0.267     0    0.045   0.048     0.371  100.000  100.000
LGA    Y   127_A      Y   127_A     0.702     0    0.036   1.297     7.731   90.476   61.230
LGA    A   128_A      A   128_A     0.681     0    0.013   0.017     0.750   92.857   92.381
LGA    F   129_A      F   129_A     0.545     0    0.017   0.145     0.821   92.857   91.342
LGA    T   130_A      T   130_A     0.270     0    0.022   0.162     0.795   95.238   94.558
LGA    E   131_A      E   131_A     1.255     0    0.095   0.883     3.662   81.548   70.741
LGA    K   132_A      K   132_A     1.714     0    0.100   0.614     4.428   63.690   58.201
LGA    D   133_A      D   133_A     3.538     0    0.025   0.273     5.600   48.810   39.583
LGA    L   134_A      L   134_A     2.541     0    0.610   1.036     4.591   47.262   59.107

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      133     532    532  100.00    1010   1010  100.00               133
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.591          0.637                  0.953           96.812   94.552

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  134  133    4.0    133    0.59    98.872    99.538    19.257

LGA_LOCAL      RMSD:   0.591  Number of atoms:  133  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.591  Number of assigned atoms:  133 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.591  Standard rmsd on all 133 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.205977 * X  +   0.643301 * Y  +   0.737386 * Z  + -31.160837
  Y_new =  -0.183295 * X  +   0.765570 * Y  +  -0.616689 * Z  +  25.474867
  Z_new =  -0.961237 * X  +  -0.008136 * Y  +   0.275604 * Z  + -12.999703 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.727197  1.291454 -0.029511   [DEG:  -41.6653   73.9949   -1.6908 ]
ZXZ:  0.874300  1.291579 -1.579260   [DEG:   50.0937   74.0020  -90.4849 ]
 
# END of job
