
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  158 ( 1277),  selected  158 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  169 ( 1368),  selected  158 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   158       5_A - 162_A       2.04     2.04
  LCS_AVERAGE:     93.49

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   155       5_A - 159_A       1.98     2.04
  LCS_AVERAGE:     90.76

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    83       5_A - 87_A        0.86     2.22
  LCS_AVERAGE:     36.53

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  158
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     Q     5_A     Q     5_A     83  155  158     27  100  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A     6_A     A     6_A     83  155  158     21   99  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     H     7_A     H     7_A     83  155  158     21  103  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K     8_A     K     8_A     83  155  158     36  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R     9_A     R     9_A     83  155  158     59  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     83  155  158     70  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    11_A     T    11_A     83  155  158     57  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K    12_A     K    12_A     83  155  158     57  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E    13_A     E    13_A     83  155  158     70  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    14_A     Y    14_A     83  155  158     29  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K    15_A     K    15_A     83  155  158     27  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     83  155  158     43  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     M    17_A     M    17_A     83  155  158     57  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V    18_A     V    18_A     83  155  158     50  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E    19_A     E    19_A     83  155  158     45  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     83  155  158     43  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    21_A     P    21_A     83  155  158     57  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    22_A     P    22_A     83  155  158     63  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    23_A     P    23_A     83  155  158     38  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    24_A     Y    24_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    25_A     I    25_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    26_A     L    26_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A    27_A     A    27_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R    28_A     R    28_A     83  155  158     25   95  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A     83  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    30_A     N    30_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E    31_A     E    31_A     83  155  158     53  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D    32_A     D    32_A     83  155  158     16  105  128  133  137  141  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    33_A     N    33_A     83  155  158     55  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    34_A     I    34_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    35_A     L    35_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E    36_A     E    36_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     W    37_A     W    37_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     H    38_A     H    38_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    39_A     Y    39_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    40_A     I    40_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G    43_A     G    43_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    44_A     P    44_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A    45_A     A    45_A     83  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D    46_A     D    46_A     83  155  158      6   99  128  133  137  142  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    47_A     T    47_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    48_A     P    48_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    49_A     Y    49_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K    50_A     K    50_A     83  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G    51_A     G    51_A     83  155  158     11   83  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G    52_A     G    52_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Q    53_A     Q    53_A     83  155  158     65  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    54_A     Y    54_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     H    55_A     H    55_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G    56_A     G    56_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    57_A     T    57_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    59_A     T    59_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F    60_A     F    60_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    61_A     P    61_A     83  155  158     63  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S    62_A     S    62_A     83  155  158     46  103  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D    63_A     D    63_A     83  155  158      9  103  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    64_A     Y    64_A     83  155  158      9  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     83  155  158      9   97  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    66_A     Y    66_A     83  155  158     13   99  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K    67_A     K    67_A     83  155  158     61  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    68_A     P    68_A     83  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A    70_A     A    70_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    71_A     I    71_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     M    73_A     M    73_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I    74_A     I    74_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    76_A     P    76_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    77_A     N    77_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G    78_A     G    78_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R    79_A     R    79_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F    80_A     F    80_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K    81_A     K    81_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    82_A     P    82_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    83_A     N    83_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    84_A     T    84_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R    85_A     R    85_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    86_A     L    86_A     83  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     C    87_A     C    87_A     83  155  158      3    5   45   69  117  136  145  149  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L    88_A     L    88_A      4  155  158      4    4   21   34   44   64  107  132  150  152  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S    89_A     S    89_A      4  155  158      4    4    4   40   49   56   66  103  128  141  148  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     M    90_A     M    90_A      4  155  158      4    4    4    5    6   55   61   73  124  140  152  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S    91_A     S    91_A      5  155  158      4    6    8   17   77  129  145  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D    92_A     D    92_A      5  155  158      4    6    8   19   81  130  144  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y    93_A     Y    93_A      5  155  158      4    6    8   17   77  134  145  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     H    94_A     H    94_A      5  155  158      3    4    5   55   75  102  138  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A      5  155  158      3   14   21   37   75   88  101  136  148  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D    96_A     D    96_A     51  155  158     37  107  128  133  137  142  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A     51  155  158      3   76  118  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     W    98_A     W    98_A     51  155  158     17  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A     51  155  158     60  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P   100_A     P   100_A     51  155  158     67  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G   101_A     G   101_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     W   102_A     W   102_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   103_A     S   103_A     51  155  158     23  106  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V   104_A     V   104_A     51  155  158     53  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     51  155  158     55  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   106_A     T   106_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I   107_A     I   107_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L   108_A     L   108_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N   109_A     N   109_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G   110_A     G   110_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L   111_A     L   111_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L   112_A     L   112_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   113_A     S   113_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F   114_A     F   114_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     M   115_A     M   115_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   116_A     T   116_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   117_A     S   117_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D   118_A     D   118_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E   119_A     E   119_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A   120_A     A   120_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   121_A     T   121_A     51  155  158     70  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   122_A     T   122_A     51  155  158     38   99  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     G   123_A     G   123_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   124_A     S   124_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I   125_A     I   125_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   126_A     T   126_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   127_A     T   127_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     D   129_A     D   129_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     H   130_A     H   130_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Q   131_A     Q   131_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K   133_A     K   133_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   134_A     T   134_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L   135_A     L   135_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R   137_A     R   137_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N   138_A     N   138_A     51  155  158     72  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   139_A     S   139_A     51  155  158     73  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I   140_A     I   140_A     51  155  158     23  103  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     51  155  158     71  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Y   142_A     Y   142_A     51  155  158     65  107  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N   143_A     N   143_A     51  155  158     45  104  128  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     T   144_A     T   144_A     51  155  158     34  100  124  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F   145_A     F   145_A     51  155  158     17   85  124  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Q   146_A     Q   146_A     51  155  158      4   11   41   74  132  142  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N   147_A     N   147_A      3  155  158      5    7   17   62   76   90  134  143  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V   148_A     V   148_A     15  155  158      3   24   34   58  108  130  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     R   149_A     R   149_A     15  155  158     15   28   82  115  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F   150_A     F   150_A     15  155  158     22   73  116  133  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     K   151_A     K   151_A     15  155  158      5   37   88  121  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     L   152_A     L   152_A     15  155  158     15   25   60  100  126  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     I   153_A     I   153_A     15  155  158     16   52   93  125  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     F   154_A     F   154_A     15  155  158     15   42   91  124  137  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     P   155_A     P   155_A     15  155  158     15   25   59   98  126  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E   156_A     E   156_A     15  155  158     15   25   51   92  124  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V   157_A     V   157_A     15  155  158     15   25   57  106  133  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V   158_A     V   158_A     15  155  158     15   25   59  109  134  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     Q   159_A     Q   159_A     15  155  158     15   25   50   79  121  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     E   160_A     E   160_A     15   70  158     15   25   50   79  121  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     N   161_A     N   161_A     15   70  158     15   25   51  106  133  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_GDT     V   162_A     V   162_A     15   70  158     15   25   51   83  130  143  147  151  154  155  155  156  157  157  158  158  158  158  158  158 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  73.59  (  36.53   90.76   93.49 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     73    107    128    133    137    143    147    151    154    155    155    156    157    157    158    158    158    158    158    158 
GDT PERCENT_AT  43.20  63.31  75.74  78.70  81.07  84.62  86.98  89.35  91.12  91.72  91.72  92.31  92.90  92.90  93.49  93.49  93.49  93.49  93.49  93.49
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.51   0.72   0.81   1.00   1.42   1.45   1.61   1.71   1.77   1.77   1.83   1.92   1.92   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04
GDT RMS_ALL_AT   2.24   2.22   2.24   2.20   2.13   2.05   2.05   2.05   2.04   2.05   2.05   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04   2.04

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    19_A      E    19_A
#   possible swapping detected:  Y    24_A      Y    24_A
#   possible swapping detected:  D    32_A      D    32_A
#   possible swapping detected:  E    36_A      E    36_A
#   possible swapping detected:  Y    49_A      Y    49_A
#   possible swapping detected:  Y    54_A      Y    54_A
#   possible swapping detected:  F    60_A      F    60_A
#   possible swapping detected:  Y    66_A      Y    66_A
#   possible swapping detected:  F    80_A      F    80_A
#   possible swapping detected:  Y    93_A      Y    93_A
#   possible swapping detected:  F   114_A      F   114_A
#   possible swapping detected:  Y   142_A      Y   142_A
#   possible swapping detected:  F   145_A      F   145_A
#   possible swapping detected:  F   154_A      F   154_A
#   possible swapping detected:  E   156_A      E   156_A
#   possible swapping detected:  E   160_A      E   160_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    Q     5_A      Q     5_A     1.699     0    0.596   0.889     8.069   71.071   47.090
LGA    A     6_A      A     6_A     1.606     0    0.078   0.080     1.689   75.000   74.571
LGA    H     7_A      H     7_A     1.654     0    0.064   1.136     7.428   75.000   47.762
LGA    K     8_A      K     8_A     1.554     0    0.035   1.076     7.463   77.143   53.228
LGA    R     9_A      R     9_A     0.887     0    0.076   1.102     3.980   88.214   81.948
LGA    L    10_A      L    10_A     0.776     0    0.024   0.085     0.999   90.476   90.476
LGA    T    11_A      T    11_A     1.108     0    0.038   0.072     1.363   83.690   82.721
LGA    K    12_A      K    12_A     0.990     0    0.028   0.206     0.998   90.476   90.476
LGA    E    13_A      E    13_A     0.845     0    0.039   0.862     4.445   88.214   75.344
LGA    Y    14_A      Y    14_A     1.279     0    0.040   0.166     2.881   81.429   71.786
LGA    K    15_A      K    15_A     1.327     0    0.043   0.859     5.538   81.429   60.899
LGA    L    16_A      L    16_A     1.278     0    0.036   0.052     1.580   81.429   80.357
LGA    M    17_A      M    17_A     1.033     0    0.037   0.644     1.695   81.429   80.357
LGA    V    18_A      V    18_A     1.427     0    0.033   0.055     2.092   77.143   74.150
LGA    E    19_A      E    19_A     1.708     0    0.092   1.209     4.532   72.857   65.926
LGA    N    20_A      N    20_A     1.455     0    0.041   1.133     5.186   81.429   70.417
LGA    P    21_A      P    21_A     0.857     0    0.129   0.200     1.678   83.810   85.374
LGA    P    22_A      P    22_A     0.633     0    0.074   0.101     0.725   95.238   93.197
LGA    P    23_A      P    23_A     0.558     0    0.030   0.129     1.291   90.476   86.599
LGA    Y    24_A      Y    24_A     0.639     0    0.067   0.114     1.178   90.595   90.516
LGA    I    25_A      I    25_A     0.985     0    0.076   0.102     1.339   85.952   83.690
LGA    L    26_A      L    26_A     0.902     0    0.018   0.110     0.921   90.476   90.476
LGA    A    27_A      A    27_A     0.944     0    0.036   0.047     1.706   81.548   81.524
LGA    R    28_A      R    28_A     1.993     0    0.139   1.051     6.409   75.000   58.225
LGA    P    29_A      P    29_A     1.320     0    0.033   0.222     1.971   81.429   78.980
LGA    N    30_A      N    30_A     1.299     0    0.025   0.162     1.506   81.429   80.357
LGA    E    31_A      E    31_A     1.778     0    0.062   0.899     5.891   72.857   52.434
LGA    D    32_A      D    32_A     2.075     0    0.053   1.184     3.414   70.833   67.976
LGA    N    33_A      N    33_A     1.188     0    0.039   0.324     1.422   83.690   83.690
LGA    I    34_A      I    34_A     1.059     0    0.024   1.236     3.300   85.952   75.655
LGA    L    35_A      L    35_A     0.876     0    0.075   0.063     1.167   88.214   89.345
LGA    E    36_A      E    36_A     0.572     0    0.036   0.383     1.892   90.476   87.513
LGA    W    37_A      W    37_A     0.663     0    0.032   0.142     2.647   92.857   79.558
LGA    H    38_A      H    38_A     0.739     0    0.044   0.200     1.176   90.476   88.667
LGA    Y    39_A      Y    39_A     0.676     0    0.014   0.132     0.705   92.857   95.238
LGA    I    40_A      I    40_A     0.442     0    0.045   0.677     2.944   97.619   91.071
LGA    I    41_A      I    41_A     0.520     0    0.027   0.131     0.624   90.476   92.857
LGA    T    42_A      T    42_A     0.550     0    0.040   0.038     0.627   90.476   90.476
LGA    G    43_A      G    43_A     0.556     0    0.015   0.015     0.693   90.476   90.476
LGA    P    44_A      P    44_A     0.621     0    0.034   0.183     1.165   88.214   87.891
LGA    A    45_A      A    45_A     1.312     0    0.044   0.041     1.564   81.548   79.810
LGA    D    46_A      D    46_A     2.018     0    0.035   0.153     3.048   70.833   64.048
LGA    T    47_A      T    47_A     0.809     0    0.065   0.144     1.206   88.214   89.184
LGA    P    48_A      P    48_A     0.709     0    0.023   0.027     0.787   90.476   90.476
LGA    Y    49_A      Y    49_A     0.642     0    0.018   0.320     2.121   90.476   83.175
LGA    K    50_A      K    50_A     0.956     0    0.075   0.695     2.959   85.952   84.762
LGA    G    51_A      G    51_A     1.781     0    0.035   0.035     1.781   77.143   77.143
LGA    G    52_A      G    52_A     0.834     0    0.021   0.021     0.989   90.476   90.476
LGA    Q    53_A      Q    53_A     0.353     0    0.046   1.137     4.806   97.619   74.127
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LGA    N   143_A      N   143_A     0.426     0    0.041   0.080     0.710   95.238   97.619
LGA    T   144_A      T   144_A     0.598     0    0.045   1.027     2.356   88.214   83.197
LGA    F   145_A      F   145_A     1.491     0    0.068   0.112     3.797   69.762   61.255
LGA    Q   146_A      Q   146_A     3.530     0    0.621   1.066     7.994   39.762   28.042
LGA    N   147_A      N   147_A     4.983     0    0.329   0.852     7.151   35.833   24.643
LGA    V   148_A      V   148_A     4.576     0    0.103   1.047     8.843   35.714   26.327
LGA    R   149_A      R   149_A     2.969     0    0.079   1.218     8.756   59.167   35.801
LGA    F   150_A      F   150_A     1.551     0    0.052   0.136     1.992   72.857   82.424
LGA    K   151_A      K   151_A     2.689     0    0.025   0.226     3.617   53.810   53.280
LGA    L   152_A      L   152_A     3.857     0    0.052   0.088     5.563   46.667   37.857
LGA    I   153_A      I   153_A     2.485     0    0.036   0.629     2.752   60.952   64.881
LGA    F   154_A      F   154_A     2.479     0    0.013   0.102     2.971   60.952   75.758
LGA    P   155_A      P   155_A     3.869     0    0.024   0.046     4.378   43.452   41.633
LGA    E   156_A      E   156_A     4.307     0    0.030   1.097     7.284   38.690   31.905
LGA    V   157_A      V   157_A     3.175     0    0.014   0.133     3.511   48.333   52.177
LGA    V   158_A      V   158_A     3.101     0    0.080   0.089     3.682   46.667   47.143
LGA    Q   159_A      Q   159_A     4.542     0    0.019   0.198     5.946   34.405   28.836
LGA    E   160_A      E   160_A     4.301     0    0.049   0.895     5.823   37.143   30.688
LGA    N   161_A      N   161_A     3.219     0    0.018   0.167     3.609   48.333   53.690
LGA    V   162_A      V   162_A     3.865     0    0.283   0.346     4.077   40.238   41.565

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      158     632    632  100.00    1277   1277  100.00               169
SUMMARY(RMSD_GDC):     2.037          2.001                  2.571           74.699   70.347

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  158  169    4.0    151    1.61    81.213    85.775     8.819

LGA_LOCAL      RMSD:   1.612  Number of atoms:  151  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   2.046  Number of assigned atoms:  158 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   2.037  Standard rmsd on all 158 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.036117 * X  +  -0.285483 * Y  +   0.957703 * Z  +  -0.257244
  Y_new =  -0.100518 * X  +  -0.952430 * Y  +  -0.287702 * Z  +  19.878235
  Z_new =   0.994279 * X  +  -0.106658 * Y  +   0.005703 * Z  +  -0.373086 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.915742 -1.463782 -1.517377   [DEG: -109.7639  -83.8685  -86.9393 ]
ZXZ:  1.278965  1.565093  1.677659   [DEG:   73.2793   89.6732   96.1228 ]
 
# END of job
