
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  152 ( 1215),  selected  141 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  141 ( 1116),  selected  141 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   141       1_B - 151_B       3.95     3.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    74       1_B - 74_B        1.33     4.14
  LCS_AVERAGE:     46.99

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    73       1_B - 73_B        0.78     4.18
  LCS_AVERAGE:     45.65

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  141
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     A     1_B     A     1_B     73   74  141     39  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E     2_B     E     2_B     73   74  141     92  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P     3_B     P     3_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     N     4_B     N     4_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L     5_B     L     5_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Y     6_B     Y     6_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G     7_B     G     7_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R     8_B     R     8_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Y     9_B     Y     9_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    10_B     E    10_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     W    11_B     W    11_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V    12_B     V    12_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    13_B     S    13_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    14_B     L    14_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P    15_B     P    15_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    16_B     E    16_B     73   74  141     51  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    17_B     L    17_B     73   74  141     88  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    18_B     D    18_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    19_B     R    19_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T    20_B     T    20_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    21_B     L    21_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Q    22_B     Q    22_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    23_B     A    23_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K    24_B     K    24_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     M    25_B     M    25_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    26_B     D    26_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T    27_B     T    27_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G    28_B     G    28_B     73   74  141     79  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    29_B     A    29_B     73   74  141     90  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Y    30_B     Y    30_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T    31_B     T    31_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    32_B     S    32_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    33_B     S    33_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    36_B     A    36_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K    37_B     K    37_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    38_B     D    38_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     I    39_B     I    39_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    40_B     E    40_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    41_B     L    41_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F    42_B     F    42_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Q    43_B     Q    43_B     73   74  141     86  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    44_B     R    44_B     73   74  141     86  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    45_B     D    45_B     73   74  141     85  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G    46_B     G    46_B     73   74  141     81  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    47_B     E    47_B     73   74  141     80  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    48_B     E    48_B     73   74  141     85  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     W    49_B     W    49_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V    50_B     V    50_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    51_B     R    51_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F    52_B     F    52_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    53_B     R    53_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    54_B     L    54_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T    56_B     T    56_B     73   74  141     88  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_B     73   74  141     24  111  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    58_B     E    58_B     73   74  141      4   18  127  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    59_B     A    59_B     73   74  141      4    5   41  121  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    60_B     D    60_B     73   74  141     24  111  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G    61_B     G    61_B     73   74  141     63  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    62_B     S    62_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V    63_B     V    63_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F    64_B     F    64_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    65_B     E    65_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     H    66_B     H    66_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K    67_B     K    67_B     73   74  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    68_B     L    68_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    70_B     R    70_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     I    71_B     I    71_B     73   74  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G    72_B     G    72_B     73   74  141     31  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K    73_B     K    73_B     73   74  141      8   29   66  115  132  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     I    74_B     I    74_B      3   74  141      3    3    3    4    6   10   10   10   13   19   21   51   99  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    85_B     D    85_B      4    4  141      3    3    4    4    5    6    9   11   12   14   15   16   17   21   22   28   38   52   71   85 
LCS_GDT     E    86_B     E    86_B      4    4  141      3    3    4    4    6    7    9   11   13   19   21   26   35   45   54   67   75   83   89   96 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_B      4    5  141      3    3    4    4    5    7    9   11   13   14   21   21   35   59   70   77   86   95  103  113 
LCS_GDT     E    88_B     E    88_B      4    5  141      3    3    4    6    6   10   10   14   19   26   36   49   64   73   83   92   98  115  128  133 
LCS_GDT     D    89_B     D    89_B      3    5  141      3    3    4    4    6   11   15   23   39   50   65   74   85  100  121  129  135  136  137  137 
LCS_GDT     R    90_B     R    90_B      4   62  141      3    4    5    6    9   29   64   96  120  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    91_B     L    91_B     61   62  141      8   22  105  130  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S    92_B     S    92_B     61   62  141      3   57  125  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E    93_B     E    93_B     61   62  141      3  115  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R    94_B     R    94_B     61   62  141     21  111  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P    95_B     P    95_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V    96_B     V    96_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     I    97_B     I    97_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D    98_B     D    98_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L    99_B     L    99_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Q   100_B     Q   100_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V   101_B     V   101_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     C   102_B     C   102_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L   103_B     L   103_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G   104_B     G   104_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G   105_B     G   105_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     M   107_B     M   107_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K   108_B     K   108_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T   109_B     T   109_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     I   110_B     I   110_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E   111_B     E   111_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     N   113_B     N   113_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L   114_B     L   114_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T   115_B     T   115_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D   116_B     D   116_B     61   62  141     90  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R   117_B     R   117_B     61   62  141     15  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S   118_B     S   118_B     61   62  141     83  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A   119_B     A   119_B     61   62  141     93  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F   120_B     F   120_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     N   121_B     N   121_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     Y   122_B     Y   122_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P   123_B     P   123_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F   124_B     F   124_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L   125_B     L   125_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     M   126_B     M   126_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G   127_B     G   127_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T   128_B     T   128_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K   129_B     K   129_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     G   130_B     G   130_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     L   131_B     L   131_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R   132_B     R   132_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K   133_B     K   133_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F   134_B     F   134_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     H   135_B     H   135_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V   136_B     V   136_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A   137_B     A   137_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V   138_B     V   138_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D   139_B     D   139_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P   140_B     P   140_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     S   141_B     S   141_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     E   142_B     E   142_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     R   143_B     R   143_B     61   62  141     90  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     F   144_B     F   144_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     V   145_B     V   145_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     A   146_B     A   146_B     61   62  141     94  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     D   147_B     D   147_B     61   62  141     42  123  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     K   148_B     K   148_B     61   62  141     90  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     P   149_B     P   149_B     61   62  141     92  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     T   150_B     T   150_B     61   62  141     92  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_GDT     C   151_B     C   151_B     61   62  141     79  124  129  131  133  134  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  137 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  64.22  (  45.65   46.99  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     94    124    129    131    133    134    134    134    134    134    135    135    135    135    136    136    136    136    137    137 
GDT PERCENT_AT  66.67  87.94  91.49  92.91  94.33  95.04  95.04  95.04  95.04  95.04  95.74  95.74  95.74  95.74  96.45  96.45  96.45  96.45  97.16  97.16
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.45   0.52   0.59   0.69   0.77   0.77   0.77   0.77   0.77   0.99   0.99   0.99   0.99   1.29   1.29   1.29   1.29   1.74   1.74
GDT RMS_ALL_AT   4.27   4.27   4.25   4.24   4.22   4.20   4.20   4.20   4.20   4.20   4.19   4.19   4.19   4.19   4.16   4.16   4.16   4.16   4.11   4.11

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     2_B      E     2_B
#   possible swapping detected:  E    10_B      E    10_B
#   possible swapping detected:  Y    30_B      Y    30_B
#   possible swapping detected:  E    40_B      E    40_B
#   possible swapping detected:  E    86_B      E    86_B
#   possible swapping detected:  D    87_B      D    87_B
#   possible swapping detected:  E    88_B      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    93_B      E    93_B
#   possible swapping detected:  E   111_B      E   111_B
#   possible swapping detected:  F   134_B      F   134_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
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LGA    P    95_B      P    95_B     0.434     0    0.027   0.059     0.822   95.238   94.558
LGA    V    96_B      V    96_B     0.367     0    0.051   0.077     0.615  100.000   97.279
LGA    I    97_B      I    97_B     0.321     0    0.034   0.048     0.395  100.000  100.000
LGA    D    98_B      D    98_B     0.514     0    0.060   0.070     0.665   92.857   91.667
LGA    L    99_B      L    99_B     0.471     0    0.011   0.069     0.700  100.000   95.238
LGA    Q   100_B      Q   100_B     0.488     0    0.037   0.468     2.063   97.619   89.788
LGA    V   101_B      V   101_B     0.412     0    0.034   0.045     0.508   97.619   98.639
LGA    C   102_B      C   102_B     0.366     0    0.023   0.158     0.574  100.000   96.825
LGA    L   103_B      L   103_B     0.273     0    0.073   0.080     0.455  100.000  100.000
LGA    G   104_B      G   104_B     0.190     0    0.059   0.059     0.308  100.000  100.000
LGA    G   105_B      G   105_B     0.374     0    0.086   0.086     0.374  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_B     0.339     0    0.041   0.053     0.418  100.000  100.000
LGA    M   107_B      M   107_B     0.393     0    0.021   0.492     2.600  100.000   90.060
LGA    K   108_B      K   108_B     0.393     0    0.029   0.762     1.505  100.000   89.735
LGA    T   109_B      T   109_B     0.443     0    0.033   0.041     0.603  100.000   95.918
LGA    I   110_B      I   110_B     0.397     0    0.011   0.047     0.510   97.619   98.810
LGA    E   111_B      E   111_B     0.453     0    0.018   0.188     1.109   97.619   93.757
LGA    V   112_B      V   112_B     0.415     0    0.039   0.051     0.462  100.000  100.000
LGA    N   113_B      N   113_B     0.523     0    0.054   1.306     3.841   97.619   82.738
LGA    L   114_B      L   114_B     0.236     0    0.024   0.052     0.353  100.000  100.000
LGA    T   115_B      T   115_B     0.322     0    0.018   0.116     0.451  100.000  100.000
LGA    D   116_B      D   116_B     0.669     0    0.048   0.181     1.021   88.214   89.345
LGA    R   117_B      R   117_B     1.148     0    0.050   0.509     2.542   83.690   76.234
LGA    S   118_B      S   118_B     0.963     0    0.016   0.017     1.028   88.214   87.460
LGA    A   119_B      A   119_B     0.755     0    0.030   0.027     0.808   90.476   90.476
LGA    F   120_B      F   120_B     0.614     0    0.019   0.064     0.802   90.476   91.342
LGA    N   121_B      N   121_B     0.546     0    0.017   0.127     0.816   90.476   90.476
LGA    Y   122_B      Y   122_B     0.552     0    0.053   0.086     0.945   90.476   90.476
LGA    P   123_B      P   123_B     0.365     0    0.019   0.056     0.461  100.000  100.000
LGA    F   124_B      F   124_B     0.303     0    0.049   0.146     0.607   97.619   97.403
LGA    L   125_B      L   125_B     0.361     0    0.024   0.297     1.704   97.619   90.714
LGA    M   126_B      M   126_B     0.201     0    0.020   0.595     1.510  100.000   94.286
LGA    G   127_B      G   127_B     0.526     0    0.027   0.027     0.526   97.619   97.619
LGA    T   128_B      T   128_B     0.509     0    0.009   1.088     2.717   90.476   83.197
LGA    K   129_B      K   129_B     0.545     0    0.005   0.136     1.561   92.857   88.571
LGA    G   130_B      G   130_B     0.356     0    0.022   0.022     0.472  100.000  100.000
LGA    L   131_B      L   131_B     0.174     0    0.007   0.057     0.297  100.000  100.000
LGA    R   132_B      R   132_B     0.359     0    0.008   0.214     1.610  100.000   93.203
LGA    K   133_B      K   133_B     0.598     0    0.029   1.014     3.943   90.476   78.571
LGA    F   134_B      F   134_B     0.448     0    0.046   0.042     0.550   97.619   99.134
LGA    H   135_B      H   135_B     0.363     0    0.016   0.457     1.229  100.000   94.381
LGA    V   136_B      V   136_B     0.241     0    0.011   0.037     0.705   97.619   95.918
LGA    A   137_B      A   137_B     0.579     0    0.036   0.035     0.764   97.619   96.190
LGA    V   138_B      V   138_B     0.319     0    0.034   0.093     0.494  100.000  100.000
LGA    D   139_B      D   139_B     0.255     0    0.026   0.089     1.074  100.000   95.298
LGA    P   140_B      P   140_B     0.293     0    0.022   0.270     1.466  100.000   94.626
LGA    S   141_B      S   141_B     0.107     0    0.053   0.055     0.247  100.000  100.000
LGA    E   142_B      E   142_B     0.474     0    0.031   0.158     0.759  100.000   95.767
LGA    R   143_B      R   143_B     0.542     0    0.059   1.268     5.365   92.857   72.554
LGA    F   144_B      F   144_B     0.511     0    0.026   0.194     0.941   92.857   91.342
LGA    V   145_B      V   145_B     0.506     0    0.060   0.088     0.549   95.238   94.558
LGA    A   146_B      A   146_B     0.558     0    0.610   0.549     2.748   82.143   83.810
LGA    D   147_B      D   147_B     1.206     0    0.046   0.760     2.733   85.952   80.655
LGA    K   148_B      K   148_B     0.733     0    0.022   0.763     3.107   90.476   82.011
LGA    P   149_B      P   149_B     0.583     0    0.094   0.102     0.905   92.857   93.197
LGA    T   150_B      T   150_B     0.566     0    0.409   0.351     1.914   88.452   85.510
LGA    C   151_B      C   151_B     0.703     0    0.226   0.477     2.810   79.881   77.857

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      141     564    564  100.00    1116   1116  100.00               141
SUMMARY(RMSD_GDC):     3.951          3.869                  4.397           89.718   85.732

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  152  141    4.0    134    0.77    93.085    82.195    15.380

LGA_LOCAL      RMSD:   0.771  Number of atoms:  134  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   4.204  Number of assigned atoms:  141 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   3.951  Standard rmsd on all 141 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.368138 * X  +   0.581233 * Y  +   0.725702 * Z  +   9.124307
  Y_new =   0.895646 * X  +   0.431209 * Y  +   0.108982 * Z  +  18.219606
  Z_new =  -0.249585 * X  +   0.690093 * Y  +  -0.679323 * Z  +  28.486898 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.960775  0.252252  2.348330   [DEG:  112.3441   14.4530  134.5494 ]
ZXZ:  1.719857  2.317636 -0.347032   [DEG:   98.5406  132.7908  -19.8835 ]
 
# END of job
