
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  152 ( 1215),  selected  141 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  141 ( 1116),  selected  141 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   141       1_B - 151_B       3.03     3.03
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    74       1_B - 74_B        1.29     3.16
  LCS_AVERAGE:     47.61

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    73       1_B - 73_B        0.75     3.19
  LCS_AVERAGE:     45.65

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  141
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     A     1_B     A     1_B     73   74  141     26  114  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  138  138 
LCS_GDT     E     2_B     E     2_B     73   74  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  138  140 
LCS_GDT     P     3_B     P     3_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     N     4_B     N     4_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L     5_B     L     5_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Y     6_B     Y     6_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G     7_B     G     7_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R     8_B     R     8_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Y     9_B     Y     9_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    10_B     E    10_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     W    11_B     W    11_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V    12_B     V    12_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    13_B     S    13_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    14_B     L    14_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     P    15_B     P    15_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    16_B     E    16_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    17_B     L    17_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    18_B     D    18_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    19_B     R    19_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T    20_B     T    20_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    21_B     L    21_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Q    22_B     Q    22_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    23_B     A    23_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K    24_B     K    24_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     M    25_B     M    25_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    26_B     D    26_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T    27_B     T    27_B     73   74  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G    28_B     G    28_B     73   74  141     85  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    29_B     A    29_B     73   74  141     94  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Y    30_B     Y    30_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T    31_B     T    31_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    32_B     S    32_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    33_B     S    33_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    36_B     A    36_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K    37_B     K    37_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    38_B     D    38_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     I    39_B     I    39_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    40_B     E    40_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    41_B     L    41_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F    42_B     F    42_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Q    43_B     Q    43_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    44_B     R    44_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    45_B     D    45_B     73   74  141     92  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G    46_B     G    46_B     73   74  141     65  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    47_B     E    47_B     73   74  141     80  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    48_B     E    48_B     73   74  141     89  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     W    49_B     W    49_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V    50_B     V    50_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    51_B     R    51_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F    52_B     F    52_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    53_B     R    53_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    54_B     L    54_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T    56_B     T    56_B     73   74  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_B     73   74  141     33  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    58_B     E    58_B     73   74  141      4   80  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    59_B     A    59_B     73   74  141      4    5   38  130  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    60_B     D    60_B     73   74  141     33  117  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G    61_B     G    61_B     73   74  141     86  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    62_B     S    62_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V    63_B     V    63_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F    64_B     F    64_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    65_B     E    65_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     H    66_B     H    66_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K    67_B     K    67_B     73   74  141     96  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    68_B     L    68_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    70_B     R    70_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     I    71_B     I    71_B     73   74  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G    72_B     G    72_B     73   74  141     29  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K    73_B     K    73_B     73   74  141      3   33   76  126  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     I    74_B     I    74_B      3   74  141      3    3    3    4    5    8   11   11   11   20   21   52  101  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    85_B     D    85_B      3    5  141      3    3    4    4    5    6    7    9   15   17   21   32   69   86   96  112  130  136  139  140 
LCS_GDT     E    86_B     E    86_B      4    5  141      3    3    4    4    7   10   15   22   31   41   62   73   83   92  106  120  131  136  139  140 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_B      4    5  141      3    3    4    4    6    8   11   13   22   31   43   62   80   88   96  112  130  135  139  140 
LCS_GDT     E    88_B     E    88_B      4    5  141      3    3    4    5    7    8   12   19   42   46   70   88   93  113  128  135  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    89_B     D    89_B      4   63  141      3    3    4    5    8   10   16   21   31   41   54   73   82   93  113  127  135  137  139  140 
LCS_GDT     R    90_B     R    90_B      4   63  141      3    3    5    5   19   49   81  115  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    91_B     L    91_B     61   63  141      5   43  122  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S    92_B     S    92_B     61   63  141      3   96  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E    93_B     E    93_B     61   63  141     25  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R    94_B     R    94_B     61   63  141     19  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     P    95_B     P    95_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V    96_B     V    96_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     I    97_B     I    97_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D    98_B     D    98_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L    99_B     L    99_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Q   100_B     Q   100_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V   101_B     V   101_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     C   102_B     C   102_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L   103_B     L   103_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G   104_B     G   104_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G   105_B     G   105_B     61   63  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     M   107_B     M   107_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K   108_B     K   108_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T   109_B     T   109_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     I   110_B     I   110_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E   111_B     E   111_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     N   113_B     N   113_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L   114_B     L   114_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T   115_B     T   115_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D   116_B     D   116_B     61   63  141     26  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R   117_B     R   117_B     61   63  141     22  121  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S   118_B     S   118_B     61   63  141     83  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A   119_B     A   119_B     61   63  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F   120_B     F   120_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     N   121_B     N   121_B     61   63  141     95  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     Y   122_B     Y   122_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     P   123_B     P   123_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F   124_B     F   124_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L   125_B     L   125_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     M   126_B     M   126_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G   127_B     G   127_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T   128_B     T   128_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K   129_B     K   129_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     G   130_B     G   130_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     L   131_B     L   131_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R   132_B     R   132_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K   133_B     K   133_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F   134_B     F   134_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     H   135_B     H   135_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V   136_B     V   136_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A   137_B     A   137_B     61   63  141     86  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V   138_B     V   138_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D   139_B     D   139_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     P   140_B     P   140_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     S   141_B     S   141_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     E   142_B     E   142_B     61   63  141     94  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     R   143_B     R   143_B     61   63  141     94  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     F   144_B     F   144_B     61   63  141     94  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     V   145_B     V   145_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     A   146_B     A   146_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     D   147_B     D   147_B     61   63  141     77  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     K   148_B     K   148_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     P   149_B     P   149_B     61   63  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     T   150_B     T   150_B     61   63  141     98  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_GDT     C   151_B     C   151_B     61   63  141     99  122  129  132  133  134  134  134  134  135  135  135  135  136  136  136  136  137  139  140 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  64.42  (  45.65   47.61  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     99    122    129    132    133    134    134    134    134    135    135    135    135    136    136    136    136    137    139    140 
GDT PERCENT_AT  70.21  86.52  91.49  93.62  94.33  95.04  95.04  95.04  95.04  95.74  95.74  95.74  95.74  96.45  96.45  96.45  96.45  97.16  98.58  99.29
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.42   0.50   0.59   0.63   0.71   0.71   0.71   0.71   0.92   0.92   0.92   0.92   1.22   1.22   1.22   1.22   1.66   3.03   3.03
GDT RMS_ALL_AT   3.25   3.24   3.24   3.22   3.22   3.20   3.20   3.20   3.20   3.18   3.18   3.18   3.18   3.16   3.16   3.16   3.16   3.13   3.03   3.03

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     2_B      E     2_B
#   possible swapping detected:  E    10_B      E    10_B
#   possible swapping detected:  E    16_B      E    16_B
#   possible swapping detected:  Y    30_B      Y    30_B
#   possible swapping detected:  E    40_B      E    40_B
#   possible swapping detected:  E    47_B      E    47_B
#   possible swapping detected:  E    86_B      E    86_B
#   possible swapping detected:  D    87_B      D    87_B
#   possible swapping detected:  E    88_B      E    88_B
#   possible swapping detected:  E    93_B      E    93_B
#   possible swapping detected:  E   111_B      E   111_B
#   possible swapping detected:  F   134_B      F   134_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    A     1_B      A     1_B     1.572     0    0.687   0.623     3.877   79.286   72.095
LGA    E     2_B      E     2_B     0.633     0    0.058   0.819     3.557   90.476   82.275
LGA    P     3_B      P     3_B     0.340     0    0.069   0.079     0.435  100.000  100.000
LGA    N     4_B      N     4_B     0.330     0    0.017   0.071     0.462  100.000  100.000
LGA    L     5_B      L     5_B     0.477     0    0.077   0.768     2.029   95.238   88.512
LGA    Y     6_B      Y     6_B     0.317     0    0.065   0.192     0.893  100.000   96.825
LGA    G     7_B      G     7_B     0.177     0    0.067   0.067     0.300  100.000  100.000
LGA    R     8_B      R     8_B     0.398     0    0.015   0.833     4.406  100.000   76.970
LGA    Y     9_B      Y     9_B     0.340     0    0.012   0.263     2.109  100.000   87.857
LGA    E    10_B      E    10_B     0.161     0    0.042   0.140     0.472  100.000  100.000
LGA    W    11_B      W    11_B     0.186     0    0.005   0.081     0.661  100.000   96.599
LGA    V    12_B      V    12_B     0.092     0    0.073   0.094     0.369  100.000  100.000
LGA    S    13_B      S    13_B     0.387     0    0.014   0.501     1.496  100.000   96.905
LGA    L    14_B      L    14_B     0.355     0    0.095   0.160     0.740  100.000   96.429
LGA    P    15_B      P    15_B     0.426     0    0.045   0.344     1.566   97.619   93.401
LGA    E    16_B      E    16_B     0.486     0    0.032   0.506     1.606   97.619   93.810
LGA    L    17_B      L    17_B     0.451     0    0.051   0.074     0.553  100.000   97.619
LGA    D    18_B      D    18_B     0.279     0    0.050   0.179     0.929  100.000   97.619
LGA    R    19_B      R    19_B     0.251     0    0.023   0.142     0.711  100.000   94.805
LGA    T    20_B      T    20_B     0.263     0    0.009   0.044     0.468  100.000  100.000
LGA    L    21_B      L    21_B     0.240     0    0.060   0.079     0.410  100.000  100.000
LGA    Q    22_B      Q    22_B     0.134     0    0.038   0.301     0.921  100.000   97.884
LGA    A    23_B      A    23_B     0.211     0    0.019   0.024     0.291  100.000  100.000
LGA    K    24_B      K    24_B     0.349     0    0.020   0.297     2.473  100.000   91.905
LGA    M    25_B      M    25_B     0.263     0    0.021   0.100     0.579  100.000   98.810
LGA    D    26_B      D    26_B     0.305     0    0.034   0.055     0.438  100.000  100.000
LGA    T    27_B      T    27_B     0.488     0    0.019   0.044     0.620   95.238   95.918
LGA    G    28_B      G    28_B     0.628     0    0.143   0.143     1.223   88.214   88.214
LGA    A    29_B      A    29_B     0.621     0    0.083   0.111     0.910   90.476   90.476
LGA    Y    30_B      Y    30_B     0.523     0    0.034   0.169     0.729   90.476   92.063
LGA    T    31_B      T    31_B     0.615     0    0.040   0.803     2.104   90.476   85.510
LGA    S    32_B      S    32_B     0.542     0    0.048   0.061     0.596   92.857   92.063
LGA    S    33_B      S    33_B     0.294     0    0.023   0.056     0.317  100.000  100.000
LGA    L    34_B      L    34_B     0.152     0    0.010   0.051     0.293  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_B     0.452     0    0.025   0.061     0.832  100.000   96.825
LGA    A    36_B      A    36_B     0.318     0    0.017   0.028     0.342  100.000  100.000
LGA    K    37_B      K    37_B     0.396     0    0.015   0.058     0.466  100.000  100.000
LGA    D    38_B      D    38_B     0.339     0    0.032   0.091     0.713  100.000   96.429
LGA    I    39_B      I    39_B     0.319     0    0.070   0.093     0.540   97.619   97.619
LGA    E    40_B      E    40_B     0.358     0    0.030   0.866     4.134  100.000   81.429
LGA    L    41_B      L    41_B     0.498     0    0.041   0.104     0.747   95.238   94.048
LGA    F    42_B      F    42_B     0.475     0    0.039   0.087     0.517   95.238   98.268
LGA    Q    43_B      Q    43_B     0.483     0    0.032   0.688     3.470   95.238   81.481
LGA    R    44_B      R    44_B     0.525     0    0.011   1.140     3.229   90.476   81.905
LGA    D    45_B      D    45_B     0.659     0    0.032   0.908     3.438   90.476   77.143
LGA    G    46_B      G    46_B     0.865     0    0.025   0.025     0.865   90.476   90.476
LGA    E    47_B      E    47_B     0.776     0    0.020   0.837     2.576   90.476   85.767
LGA    E    48_B      E    48_B     0.653     0    0.026   0.618     2.277   95.238   85.767
LGA    W    49_B      W    49_B     0.447     0    0.035   0.059     0.576   97.619   96.599
LGA    V    50_B      V    50_B     0.267     0    0.033   0.038     0.379  100.000  100.000
LGA    R    51_B      R    51_B     0.173     0    0.016   1.074     3.034  100.000   87.316
LGA    F    52_B      F    52_B     0.201     0    0.021   0.065     0.289  100.000  100.000
LGA    R    53_B      R    53_B     0.228     0    0.034   1.013     3.667  100.000   91.429
LGA    L    54_B      L    54_B     0.236     0    0.031   0.100     0.407  100.000  100.000
LGA    A    55_B      A    55_B     0.489     0    0.064   0.065     0.589  100.000   98.095
LGA    T    56_B      T    56_B     0.395     0    0.016   0.199     1.131   92.976   90.612
LGA    K    57_B      K    57_B     1.174     4    0.180   0.193     1.621   81.548   45.291
LGA    E    58_B      E    58_B     1.729     4    0.366   0.344     1.907   75.000   41.429
LGA    A    59_B      A    59_B     2.668     0    0.127   0.155     3.723   71.190   65.619
LGA    D    60_B      D    60_B     1.473     0    0.600   1.277     3.790   67.619   70.417
LGA    G    61_B      G    61_B     0.721     0    0.107   0.107     0.887   90.476   90.476
LGA    S    62_B      S    62_B     0.303     0    0.028   0.066     0.559  100.000   98.413
LGA    V    63_B      V    63_B     0.210     0    0.026   0.064     0.352  100.000  100.000
LGA    F    64_B      F    64_B     0.272     0    0.023   0.092     0.318  100.000  100.000
LGA    E    65_B      E    65_B     0.179     0    0.021   0.078     0.481  100.000  100.000
LGA    H    66_B      H    66_B     0.257     0    0.014   0.059     0.877  100.000   95.238
LGA    K    67_B      K    67_B     0.471     0    0.036   0.800     3.827  100.000   80.053
LGA    L    68_B      L    68_B     0.360     0    0.051   0.068     0.452  100.000  100.000
LGA    A    69_B      A    69_B     0.274     0    0.034   0.033     0.448  100.000  100.000
LGA    R    70_B      R    70_B     0.226     0    0.079   0.991     2.905  100.000   92.771
LGA    I    71_B      I    71_B     0.255     0    0.033   0.655     1.819   92.976   89.524
LGA    G    72_B      G    72_B     1.210     0    0.259   0.259     3.693   72.024   72.024
LGA    K    73_B      K    73_B     3.810     0    0.218   0.700     9.699   42.143   28.148
LGA    I    74_B      I    74_B     9.579     0    0.586   0.546    13.325    2.619    1.369
LGA    D    85_B      D    85_B    18.046     3    0.629   0.568    19.707    0.000    0.000
LGA    E    86_B      E    86_B    16.767     0    0.326   0.301    19.895    0.000    0.000
LGA    D    87_B      D    87_B    16.202     0    0.027   1.270    18.759    0.000    0.000
LGA    E    88_B      E    88_B    13.462     0    0.237   1.136    19.096    0.000    0.000
LGA    D    89_B      D    89_B    13.735     0    0.691   1.262    19.999    0.000    0.000
LGA    R    90_B      R    90_B     6.856     0    0.653   0.876    12.275   17.857    7.879
LGA    L    91_B      L    91_B     2.367     0    0.084   0.225     4.073   52.500   58.036
LGA    S    92_B      S    92_B     1.896     0    0.024   0.118     3.097   75.000   67.857
LGA    E    93_B      E    93_B     1.045     0    0.329   0.793     4.202   75.357   66.825
LGA    R    94_B      R    94_B     1.184     0    0.118   1.621    10.249   88.214   48.831
LGA    P    95_B      P    95_B     0.386     0    0.034   0.043     0.683   95.238   95.918
LGA    V    96_B      V    96_B     0.420     0    0.054   0.060     0.633  100.000   95.918
LGA    I    97_B      I    97_B     0.370     0    0.016   0.067     0.435  100.000  100.000
LGA    D    98_B      D    98_B     0.379     0    0.044   0.164     0.885  100.000   98.810
LGA    L    99_B      L    99_B     0.529     0    0.022   0.062     0.795   97.619   94.048
LGA    Q   100_B      Q   100_B     0.467     0    0.025   0.435     1.968   97.619   90.688
LGA    V   101_B      V   101_B     0.348     0    0.050   0.074     0.409  100.000  100.000
LGA    C   102_B      C   102_B     0.328     0    0.030   0.120     0.645  100.000   96.825
LGA    L   103_B      L   103_B     0.255     0    0.027   0.040     0.362  100.000  100.000
LGA    G   104_B      G   104_B     0.225     0    0.039   0.039     0.289  100.000  100.000
LGA    G   105_B      G   105_B     0.448     0    0.061   0.061     0.448  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_B     0.417     0    0.088   0.107     0.545   97.619   98.095
LGA    M   107_B      M   107_B     0.360     0    0.021   0.492     2.233   97.619   89.821
LGA    K   108_B      K   108_B     0.249     0    0.099   0.703     1.328  100.000   91.746
LGA    T   109_B      T   109_B     0.467     0    0.012   0.155     0.705   95.238   94.558
LGA    I   110_B      I   110_B     0.398     0    0.036   0.063     0.441  100.000  100.000
LGA    E   111_B      E   111_B     0.467     0    0.031   0.228     1.115   92.857   92.646
LGA    V   112_B      V   112_B     0.472     0    0.044   0.047     0.527   97.619   98.639
LGA    N   113_B      N   113_B     0.494     0    0.013   1.326     3.662  100.000   83.929
LGA    L   114_B      L   114_B     0.201     0    0.061   0.079     0.587   97.619   98.810
LGA    T   115_B      T   115_B     0.453     0    0.039   0.058     0.586   95.238   95.918
LGA    D   116_B      D   116_B     0.802     0    0.018   0.126     1.146   85.952   88.214
LGA    R   117_B      R   117_B     1.166     0    0.007   0.380     2.572   81.429   73.853
LGA    S   118_B      S   118_B     0.900     0    0.051   0.069     1.038   90.476   87.460
LGA    A   119_B      A   119_B     0.747     0    0.039   0.039     0.789   90.476   90.476
LGA    F   120_B      F   120_B     0.494     0    0.063   0.094     0.876   92.857   93.074
LGA    N   121_B      N   121_B     0.552     0    0.042   0.124     0.821   92.857   91.667
LGA    Y   122_B      Y   122_B     0.473     0    0.052   0.091     0.654   97.619   92.857
LGA    P   123_B      P   123_B     0.342     0    0.036   0.054     0.394  100.000  100.000
LGA    F   124_B      F   124_B     0.295     0    0.033   0.080     0.358  100.000  100.000
LGA    L   125_B      L   125_B     0.316     0    0.012   0.156     1.442   97.619   92.976
LGA    M   126_B      M   126_B     0.279     0    0.035   0.618     1.512  100.000   95.417
LGA    G   127_B      G   127_B     0.522     0    0.067   0.067     0.636   95.238   95.238
LGA    T   128_B      T   128_B     0.407     0    0.027   0.051     0.455  100.000  100.000
LGA    K   129_B      K   129_B     0.470     0    0.015   0.499     1.576  100.000   90.741
LGA    G   130_B      G   130_B     0.206     0    0.101   0.101     0.376  100.000  100.000
LGA    L   131_B      L   131_B     0.065     0    0.035   0.054     0.302  100.000  100.000
LGA    R   132_B      R   132_B     0.207     0    0.024   0.203     1.316  100.000   95.714
LGA    K   133_B      K   133_B     0.464     0    0.063   0.688     2.884   97.619   88.042
LGA    F   134_B      F   134_B     0.387     0    0.017   0.070     0.436  100.000  100.000
LGA    H   135_B      H   135_B     0.394     0    0.019   0.411     1.089  100.000   94.381
LGA    V   136_B      V   136_B     0.349     0    0.053   0.072     0.686   95.238   94.558
LGA    A   137_B      A   137_B     0.610     0    0.013   0.025     0.804   95.238   94.286
LGA    V   138_B      V   138_B     0.275     0    0.022   0.082     0.391  100.000  100.000
LGA    D   139_B      D   139_B     0.225     0    0.045   0.076     0.856   97.619   95.238
LGA    P   140_B      P   140_B     0.272     0    0.022   0.298     1.403  100.000   97.347
LGA    S   141_B      S   141_B     0.411     0    0.047   0.093     0.787   95.238   96.825
LGA    E   142_B      E   142_B     0.567     0    0.037   0.100     0.995   90.476   90.476
LGA    R   143_B      R   143_B     0.529     0    0.015   1.229     4.991   92.857   74.545
LGA    F   144_B      F   144_B     0.539     0    0.023   0.211     0.939   90.476   90.476
LGA    V   145_B      V   145_B     0.472     0    0.114   0.119     0.576   97.619   95.918
LGA    A   146_B      A   146_B     0.459     0    0.583   0.542     2.844   84.524   85.714
LGA    D   147_B      D   147_B     0.928     0    0.026   0.597     2.401   85.952   82.738
LGA    K   148_B      K   148_B     0.603     0    0.034   0.749     3.045   90.476   83.016
LGA    P   149_B      P   149_B     0.598     0    0.091   0.124     0.774   92.857   93.197
LGA    T   150_B      T   150_B     0.540     0    0.418   0.390     1.644   90.833   88.163
LGA    C   151_B      C   151_B     0.472     0    0.251   0.438     2.822   86.429   83.810

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      141     564    564  100.00    1116   1116  100.00               141
SUMMARY(RMSD_GDC):     3.032          2.972                  3.450           90.183   86.445

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  152  141    4.0    134    0.71    92.908    82.348    16.460

LGA_LOCAL      RMSD:   0.714  Number of atoms:  134  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   3.203  Number of assigned atoms:  141 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   3.032  Standard rmsd on all 141 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.045815 * X  +   0.279159 * Y  +   0.959151 * Z  +   9.636257
  Y_new =   0.971142 * X  +  -0.237417 * Y  +   0.022712 * Z  +  17.899391
  Z_new =   0.234060 * X  +   0.930432 * Y  +  -0.281980 * Z  +  30.900642 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.523655 -0.236251  1.865061   [DEG:   87.2990  -13.5362  106.8601 ]
ZXZ:  1.594472  1.856653  0.246447   [DEG:   91.3565  106.3784   14.1203 ]
 
# END of job
