
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.48     1.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.48     1.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    40      19_A - 58_A        0.99     1.61
  LCS_AVERAGE:     25.24

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3    9   76  105  119  125  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     13  131  131     46   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     13  131  131     46   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     13  131  131     47   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     13  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     13  131  131     53   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     13  131  131     41   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     13  131  131     25   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     13  131  131      3   10   16   44   91  117  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     40  131  131      4   28   87  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     40  131  131      6   10   59  114  120  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     40  131  131      6   78  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     40  131  131      9   84  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     40  131  131     44   97  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     40  131  131     53   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     40  131  131     49   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     40  131  131     49   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     40  131  131     53   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     40  131  131     53   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     40  131  131     35   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     40  131  131     46   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     40  131  131     39   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     40  131  131     22   89  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     40  131  131     27   95  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     40  131  131     28   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     40  131  131     22   92  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     40  131  131     22   95  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     40  131  131     26   95  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     40  131  131     28   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     40  131  131      9   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     40  131  131     45   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     40  131  131     19   97  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     40  131  131     32   94  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     40  131  131     27   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     40  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     40  131  131     41   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     40  131  131     39   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     40  131  131     29   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     40  131  131     22   81  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     40  131  131     27   89  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     40  131  131     27   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     40  131  131     39   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     35  131  131      4   12   24   41   68  121  125  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4   17   25   72  110  118  123  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      4  131  131      4    4    4    6    9    9   21   60  114  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      9  131  131      4    7   41   72  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     38  131  131      3   32   93  113  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     38  131  131      5   20   55   81  118  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     38  131  131     12   67  110  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     38  131  131     40   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     38  131  131     47   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     38  131  131     52   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     38  131  131     42   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     38  131  131     35   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     38  131  131     45   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     38  131  131     48   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     38  131  131      3   27   96  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     38  131  131     39   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     38  131  131     47   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     38  131  131     34   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     38  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     38  131  131     47   97  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     38  131  131     22   56   97  114  120  122  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     38  131  131      3    3    4   35  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A      3  131  131      3    3    8   86  119  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     31  131  131      4    9   39   90  110  121  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     31  131  131     14   69  106  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     31  131  131     44   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     31  131  131     47   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     31  131  131     15   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     31  131  131     46   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     31  131  131     34   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     31  131  131     28   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     31  131  131     36   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     31  131  131     33   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     31  131  131     54   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     31  131  131      4   94  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     31  131  131     28   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     31  131  131     28   98  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     31  131  131      3   94  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     31  131  131     15   97  113  116  121  123  126  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  75.08  (  25.24  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     54     98    113    116    121    123    126    128    130    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  41.22  74.81  86.26  88.55  92.37  93.89  96.18  97.71  99.24  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.38   0.61   0.75   0.80   0.99   1.05   1.17   1.28   1.39   1.39   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48
GDT RMS_ALL_AT   1.52   1.49   1.49   1.49   1.49   1.49   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y     8_A      Y     8_A
#   possible swapping detected:  Y    13_A      Y    13_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  E    49_A      E    49_A
#   possible swapping detected:  F    54_A      F    54_A
#   possible swapping detected:  Y    55_A      Y    55_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  E   129_A      E   129_A
#   possible swapping detected:  F   134_A      F   134_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.295     4    0.540   0.521     5.939   50.357   24.762
LGA    K     5_A      K     5_A     0.941     0    0.214   0.715     3.178   81.786   77.143
LGA    T     6_A      T     6_A     0.806     0    0.072   0.147     0.843   90.476   90.476
LGA    V     7_A      V     7_A     0.700     0    0.036   0.041     1.192   90.476   89.184
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.350     0    0.024   0.184     0.524  100.000   99.206
LGA    G     9_A      G     9_A     0.487     0    0.057   0.057     0.546   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.433     0    0.015   1.398     3.642   97.619   81.964
LGA    N    11_A      N    11_A     0.529     0    0.153   1.126     2.463   90.595   87.500
LGA    E    12_A      E    12_A     0.516     0    0.029   0.098     0.570   90.476   94.709
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.482     0    0.058   0.143     0.815   92.857   94.444
LGA    A    14_A      A    14_A     0.678     0    0.013   0.035     0.762   90.476   90.476
LGA    A    15_A      A    15_A     0.786     0    0.009   0.011     0.878   92.857   92.381
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LGA    F   120_A      F   120_A     3.239     0    0.547   1.229    11.664   63.095   26.277
LGA    Q   121_A      Q   121_A     4.111     0    0.655   0.551     9.587   43.690   23.333
LGA    Y   122_A      Y   122_A     2.128     0    0.210   0.277     2.828   66.905   70.873
LGA    P   123_A      P   123_A     0.686     0    0.038   0.045     1.008   88.214   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.756     0    0.053   0.091     1.044   90.476   88.214
LGA    L   125_A      L   125_A     1.013     0    0.061   0.119     1.311   83.690   83.690
LGA    I   126_A      I   126_A     0.732     0    0.042   0.597     1.923   90.476   88.274
LGA    G   127_A      G   127_A     0.589     0    0.038   0.038     0.656   95.238   95.238
LGA    S   128_A      S   128_A     0.383     0    0.036   0.601     1.854  100.000   93.889
LGA    E   129_A      E   129_A     0.168     0    0.023   0.203     0.930  100.000   98.942
LGA    A   130_A      A   130_A     0.178     0    0.023   0.025     0.311  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.217     0    0.034   0.072     0.501  100.000   98.810
LGA    K   132_A      K   132_A     0.182     0    0.019   0.765     2.687  100.000   90.476
LGA    R   133_A      R   133_A     0.329     0    0.015   0.976     2.479   97.619   86.926
LGA    F   134_A      F   134_A     0.435     0    0.030   0.313     1.150  100.000   94.892
LGA    D   135_A      D   135_A     0.272     0    0.030   0.240     1.603  100.000   91.964
LGA    A   136_A      A   136_A     0.366     0    0.032   0.053     1.178   92.976   92.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.944     0    0.115   0.132     1.287   88.214   84.821
LGA    V   138_A      V   138_A     0.450     0    0.046   0.051     0.851   92.857   91.837
LGA    D   139_A      D   139_A     0.620     0    0.096   0.202     1.242   92.857   90.536
LGA    P   140_A      P   140_A     0.646     0    0.012   0.311     1.993   95.238   89.388
LGA    S   141_A      S   141_A     0.418     0    0.038   0.043     0.560   97.619   95.238
LGA    L   142_A      L   142_A     0.501     0    0.040   0.121     0.692   95.238   94.048
LGA    K   143_A      K   143_A     0.763     0    0.506   0.738     5.462   78.095   67.778
LGA    Y   144_A      Y   144_A     1.060     0    0.129   0.202     1.442   83.690   85.198
LGA    A   145_A      A   145_A     1.013     0    0.046   0.051     1.065   88.214   86.857
LGA    A   146_A      A   146_A     0.560     0    0.021   0.020     0.991   90.476   92.381
LGA    G   147_A      G   147_A     1.379     0    0.133   0.133     1.384   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     0.991     4    0.023   0.032     1.165   83.690   46.243
LGA    P   149_A      P   149_A     1.017     0    0.088   0.329     1.166   85.952   86.599
LGA    A   150_A      A   150_A     1.091     0    0.449   0.472     3.126   73.690   75.238
LGA    C   151_A      C   151_A     0.885     0    0.546   0.531     3.449   85.952   77.778

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.476          1.440                  2.122           85.715   79.492

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.28    90.267    94.898     9.274

LGA_LOCAL      RMSD:   1.280  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.481  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.476  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.452184 * X  +  -0.101429 * Y  +  -0.886139 * Z  + -14.367956
  Y_new =  -0.307749 * X  +  -0.914757 * Y  +   0.261745 * Z  +  39.022297
  Z_new =  -0.837150 * X  +   0.391065 * Y  +   0.382424 * Z  +  26.145884 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.544017  0.992051  0.796570   [DEG: -145.7614   56.8404   45.6401 ]
ZXZ: -1.858006  1.178378 -1.133781   [DEG: -106.4559   67.5161  -64.9609 ]
 
# END of job
