
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.45     1.45
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.45     1.45
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    48       7_A - 54_A        1.00     1.52
  LCS_AVERAGE:     30.10

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     12  131  131      0    3    8   39  111  117  126  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     43  131  131     42   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     43  131  131     51   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     48  131  131     50   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     48  131  131     44   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     48  131  131     36   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     48  131  131     47   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     48  131  131     10   94  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     48  131  131      7   35   91  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     48  131  131      7   41   91  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     48  131  131      5   31   87  118  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     48  131  131      4   82  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     48  131  131      5   84  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     48  131  131     48   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     48  131  131     48   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     48  131  131     54   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     48  131  131     30   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     48  131  131     46   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     48  131  131     40   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     48  131  131     37   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     48  131  131     18   73  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     48  131  131     26   89  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     48  131  131     30   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     48  131  131     18   88  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     48  131  131     10   92  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     48  131  131     25   94  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     48  131  131     29   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     48  131  131     23   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     48  131  131     48   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     48  131  131     26   94  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     48  131  131     24   81  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     48  131  131     26   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     48  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     48  131  131     39   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     48  131  131     36   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     48  131  131     30   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     39  131  131     18   73  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     39  131  131     26   80  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     39  131  131     24   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     39  131  131     44   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     37  131  131      4    4   23   43   84  119  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4    9   42   61   84  119  124  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      4  131  131      4    4    4    5    7    9   14   43   55  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A     39  131  131      4   18   49  110  121  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     39  131  131      3   54  107  116  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     39  131  131      5   29   48  103  121  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     39  131  131      3   69  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     39  131  131     33   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     39  131  131     45   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     39  131  131     50   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     39  131  131     46   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     39  131  131     32   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     39  131  131     21   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     39  131  131     39   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     39  131  131     52   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     39  131  131     52   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     39  131  131     42   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     39  131  131     34   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     39  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     39  131  131     21   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     39  131  131      8   47  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     39  131  131     13   64  101  118  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     38  131  131      3    4    9   75  116  124  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A      3  131  131      3    3   10   15  118  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     31  131  131      3   33   71   95  121  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     31  131  131     24   75  109  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     31  131  131     54   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     31  131  131     26   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     31  131  131     34   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     31  131  131     52   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     31  131  131     46   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     31  131  131     14   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     31  131  131     47   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     31  131  131      4   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     31  131  131     43   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     31  131  131     32   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     31  131  131     15   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     31  131  131     55   96  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     31  131  131      3   95  113  119  122  125  128  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  76.70  (  30.10  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     55     96    113    119    122    125    128    128    129    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  41.98  73.28  86.26  90.84  93.13  95.42  97.71  97.71  98.47  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.60   0.75   0.86   0.93   1.06   1.20   1.20   1.26   1.36   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45
GDT RMS_ALL_AT   1.51   1.47   1.46   1.46   1.46   1.46   1.46   1.46   1.46   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45   1.45

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y     8_A      Y     8_A
#   possible swapping detected:  Y    13_A      Y    13_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  E    49_A      E    49_A
#   possible swapping detected:  F    54_A      F    54_A
#   possible swapping detected:  Y    55_A      Y    55_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  D   116_A      D   116_A
#   possible swapping detected:  E   129_A      E   129_A
#   possible swapping detected:  F   134_A      F   134_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.661     4    0.524   0.506     6.317   45.357   22.063
LGA    K     5_A      K     5_A     1.202     0    0.207   0.852     2.534   75.357   74.074
LGA    T     6_A      T     6_A     0.944     0    0.052   0.119     1.070   88.214   87.891
LGA    V     7_A      V     7_A     0.846     0    0.032   0.036     1.358   90.476   86.599
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.422     0    0.013   0.170     0.622   97.619   97.619
LGA    G     9_A      G     9_A     0.221     0    0.060   0.060     0.285  100.000  100.000
LGA    L    10_A      L    10_A     0.803     0    0.060   0.101     0.980   90.476   90.476
LGA    N    11_A      N    11_A     0.982     0    0.248   1.470     4.627   83.810   68.929
LGA    E    12_A      E    12_A     0.519     0    0.045   0.129     0.631   90.476   93.651
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.457     0    0.057   0.215     0.820   97.619   95.238
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LGA    A    15_A      A    15_A     0.748     0    0.008   0.014     0.973   95.238   94.286
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LGA    F   120_A      F   120_A     3.560     0    0.549   1.096    12.353   59.524   24.502
LGA    Q   121_A      Q   121_A     3.654     0    0.666   0.552     9.100   46.905   26.138
LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.838     0    0.199   0.413     2.464   72.976   82.460
LGA    P   123_A      P   123_A     0.743     0    0.022   0.042     0.984   90.476   90.476
LGA    L   124_A      L   124_A     0.835     0    0.054   0.093     1.176   90.476   87.083
LGA    L   125_A      L   125_A     1.091     0    0.059   0.112     1.382   83.690   82.560
LGA    I   126_A      I   126_A     0.825     0    0.039   0.590     1.806   90.476   88.274
LGA    G   127_A      G   127_A     0.660     0    0.039   0.039     0.683   92.857   92.857
LGA    S   128_A      S   128_A     0.544     0    0.034   0.602     1.846   95.238   90.714
LGA    E   129_A      E   129_A     0.433     0    0.023   0.883     3.702  100.000   84.233
LGA    A   130_A      A   130_A     0.231     0    0.038   0.038     0.394  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.169     0    0.049   0.082     0.435  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.372     0    0.010   0.557     2.179  100.000   91.111
LGA    R   133_A      R   133_A     0.539     0    0.023   0.975     2.023   92.857   84.935
LGA    F   134_A      F   134_A     0.606     0    0.022   0.288     0.855   92.857   93.074
LGA    D   135_A      D   135_A     0.954     0    0.013   0.864     4.154   90.476   73.452
LGA    A   136_A      A   136_A     0.454     0    0.024   0.035     1.177   90.595   92.476
LGA    L   137_A      L   137_A     1.066     0    0.103   0.172     1.870   85.952   80.476
LGA    V   138_A      V   138_A     0.418     0    0.049   0.057     0.780   92.857   91.837
LGA    D   139_A      D   139_A     0.588     0    0.071   0.177     1.082   92.857   90.536
LGA    P   140_A      P   140_A     0.358     0    0.014   0.318     1.390  100.000   95.986
LGA    S   141_A      S   141_A     0.305     0    0.026   0.034     0.317  100.000  100.000
LGA    L   142_A      L   142_A     0.315     0    0.041   0.112     0.592  100.000   97.619
LGA    K   143_A      K   143_A     0.595     0    0.580   0.745     4.842   80.476   71.217
LGA    Y   144_A      Y   144_A     1.106     0    0.040   0.118     3.113   83.690   71.944
LGA    A   145_A      A   145_A     1.086     0    0.045   0.051     1.166   85.952   85.048
LGA    A   146_A      A   146_A     0.627     0    0.041   0.039     0.766   90.476   90.476
LGA    G   147_A      G   147_A     1.054     0    0.147   0.147     1.266   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.089     4    0.012   0.037     1.252   85.952   47.249
LGA    P   149_A      P   149_A     0.827     0    0.048   0.298     1.004   88.214   89.184
LGA    A   150_A      A   150_A     0.785     0    0.038   0.041     1.383   90.476   88.667
LGA    C   151_A      C   151_A     0.849     0    0.250   0.314     3.265   88.452   78.095

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.453          1.401                  2.186           86.201   79.792

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.20    90.458    95.132     9.861

LGA_LOCAL      RMSD:   1.198  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.463  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.453  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.359356 * X  +  -0.915518 * Y  +  -0.180802 * Z  + -14.564874
  Y_new =   0.521594 * X  +  -0.357705 * Y  +   0.774588 * Z  +  32.865101
  Z_new =  -0.773823 * X  +   0.184048 * Y  +   0.606073 * Z  +  29.235102 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.174073  0.884855  0.294823   [DEG:  124.5652   50.6985   16.8921 ]
ZXZ: -2.912282  0.919683 -1.337293   [DEG: -166.8615   52.6939  -76.6212 ]
 
# END of job
