
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.48     1.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.48     1.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    40       5_A - 44_A        0.99     1.74
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    40       6_A - 45_A        0.99     1.69
  LCS_AVERAGE:     27.12

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3   13   69   89  119  122  127  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     40  131  131     24   88  105  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     40  131  131     60   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     40  131  131     55   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     40  131  131     31   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     40  131  131      4   19   67  114  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     40  131  131      4   19   49  114  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     40  131  131      4   18   73  114  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     40  131  131      4   68  103  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     40  131  131      9   53   99  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     40  131  131     59   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     40  131  131     60   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     40  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     40  131  131     61   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     40  131  131     38   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     40  131  131     29   78  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     40  131  131     29   78  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     40  131  131     29   83  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     40  131  131     20   75  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     40  131  131     29   91  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     40  131  131     40   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     40  131  131     37   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     32   88  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     24   86  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     19   90  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     21   88  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     24   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     48   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     38   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     29   82  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     29   81  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     24   68  105  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     30   78  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     33   82  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     16   76  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     35  131  131      4    4    4    4   22   88  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   92  115  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      5  131  131      4   10   31   96  116  121  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      5  131  131      4    6   38   78  117  121  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     21  131  131     12   29   49   81  110  121  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     21  131  131      4   26   54   75  102  119  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     10   43   77  107  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     24   72  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     33   85  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     37   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     53   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     61   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     25   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     61   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     53   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     60   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     40   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     61   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     47   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     31   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   87  107  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     54   90  103  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     36  131  131      3    3    4    7   12  106  125  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   44   97  117  122  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3    6   74   98  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     40   90  107  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     57   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     57   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     58   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     60   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     49   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     56   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     59   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     60   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     56   90  107  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     62   93  109  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  75.71  (  27.12  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     62     93    109    117    120    123    126    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  47.33  70.99  83.21  89.31  91.60  93.89  96.18  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.54   0.80   0.90   1.00   1.09   1.22   1.43   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48
GDT RMS_ALL_AT   1.67   1.58   1.49   1.50   1.50   1.50   1.49   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48   1.48

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.691     4    0.442   0.424     6.120   43.690   21.323
LGA    K     5_A      K     5_A     1.763     0    0.136   0.646     3.717   71.071   62.804
LGA    T     6_A      T     6_A     0.849     0    0.048   0.056     1.028   88.214   89.184
LGA    V     7_A      V     7_A     0.792     0    0.007   0.059     0.976   92.857   91.837
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.441     0    0.086   0.149     0.712   92.857   91.270
LGA    G     9_A      G     9_A     0.654     0    0.036   0.036     0.654   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.477     0    0.057   0.061     0.754   97.619   94.048
LGA    N    11_A      N    11_A     0.451     0    0.017   0.075     0.617  100.000   96.429
LGA    E    12_A      E    12_A     0.438     0    0.056   0.096     0.814   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.929     0    0.009   0.120     2.955   90.476   75.476
LGA    A    14_A      A    14_A     0.564     0    0.147   0.191     0.825   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.222     0    0.018   0.027     1.412   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.645     0    0.060   0.984     3.863   95.238   84.821
LGA    D    17_A      D    17_A     0.795     0    0.068   0.208     1.811   84.048   88.452
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.552     0    0.071   0.284     2.108   75.119   80.079
LGA    P   123_A      P   123_A     0.577     0    0.027   0.340     1.366   92.857   89.252
LGA    L   124_A      L   124_A     0.617     0    0.037   0.104     0.817   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.666     0    0.027   0.083     0.935   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.466     0    0.019   0.610     1.988   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.469     0    0.061   0.061     0.553   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.337     0    0.032   0.089     0.897  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.348     0    0.032   0.972     3.691  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.140     0    0.051   0.065     0.460  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.294     0    0.035   0.049     0.386  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.395     0    0.029   0.774     2.600   95.238   88.360
LGA    R   133_A      R   133_A     0.795     0    0.036   1.057     3.508   90.476   81.558
LGA    F   134_A      F   134_A     0.928     0    0.045   0.184     1.265   85.952   88.831
LGA    D   135_A      D   135_A     1.107     0    0.070   0.343     2.287   81.548   77.262
LGA    A   136_A      A   136_A     0.760     0    0.065   0.075     0.966   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.760     0    0.048   1.174     5.127   90.476   73.214
LGA    V   138_A      V   138_A     0.586     0    0.015   0.035     0.810   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.655     0    0.022   0.047     0.916   90.476   90.476
LGA    P   140_A      P   140_A     0.766     0    0.012   0.043     1.012   90.476   89.184
LGA    S   141_A      S   141_A     0.785     0    0.055   0.061     0.860   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.581     0    0.018   0.069     0.873   92.857   91.667
LGA    K   143_A      K   143_A     0.349     0    0.049   0.674     2.789  100.000   91.005
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.584     0    0.039   0.087     1.613   92.857   86.032
LGA    A   145_A      A   145_A     0.659     0    0.041   0.052     1.041   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.066     0    0.026   0.049     1.292   83.690   83.238
LGA    G   147_A      G   147_A     1.102     0    0.014   0.014     1.102   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     1.156     4    0.018   0.018     1.198   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.185     0    0.029   0.040     1.413   81.429   81.429
LGA    A   150_A      A   150_A     1.616     0    0.218   0.209     1.991   79.286   78.000
LGA    C   151_A      C   151_A     0.909     0    0.546   0.605     1.969   83.810   84.524

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.477          1.467                  2.117           84.746   79.307

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.43    89.885    94.523     8.519

LGA_LOCAL      RMSD:   1.426  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.478  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.477  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.921043 * X  +  -0.343990 * Y  +   0.182623 * Z  + -28.493933
  Y_new =  -0.387759 * X  +  -0.853749 * Y  +   0.347500 * Z  +  28.000799
  Z_new =   0.036378 * X  +  -0.390876 * Y  +  -0.919724 * Z  +   4.462814 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.398478 -0.036386 -2.739728   [DEG:  -22.8311   -2.0848 -156.9749 ]
ZXZ:  2.657726  2.738174  3.048792   [DEG:  152.2765  156.8858  174.6829 ]
 
# END of job
