
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.51     1.51
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.51     1.51
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.95     1.72
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.95     1.57
  LCS_AVERAGE:     24.28

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    4   38   70   90  116  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     25   90  104  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     43   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     26   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      5   25   71  114  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   15   61  114  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      3   15   67  114  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     34  131  131      5   64  103  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131     13   46  102  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     64   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     29   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     25   71  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     25   71  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     24   73  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     18   57  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     21   85  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     27   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     27   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     24   81  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     19   80  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     18   91  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     18   90  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     41   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     35   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     28   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     24   73  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     25   73  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     23   64  102  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     24   69  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     28   81  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131      6   80  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      3    4    4    4   47  107  124  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      3    4   92  110  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      7  131  131      4    6    8   15  110  121  124  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      7  131  131      4    6   38   97  118  122  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131      4   35   62   93  115  122  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   19   44   63   82  114  125  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     10   35   62   95  118  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     24   69  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     25   77  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     29   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     64   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     59   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     59   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     43   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     43   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     64   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     43   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     43   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     25   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   50  101  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     23   90  103  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A      4  131  131      3    3    4    7   12  100  121  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3   18   35   65  115  122  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   18   74   99  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     49   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     63   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     59   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     64   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     65   90  106  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     65   93  108  117  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.76  (  24.28  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     65     93    108    117    120    123    126    129    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  49.62  70.99  82.44  89.31  91.60  93.89  96.18  98.47  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.55   0.80   0.93   1.03   1.12   1.25   1.42   1.46   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51
GDT RMS_ALL_AT   1.89   1.63   1.53   1.53   1.53   1.53   1.52   1.52   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51   1.51

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.714     4    0.483   0.466     6.384   45.357   22.063
LGA    K     5_A      K     5_A     1.840     0    0.129   0.667     3.665   68.929   62.646
LGA    T     6_A      T     6_A     1.160     0    0.049   0.081     1.263   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.112     0    0.032   0.057     1.280   83.690   82.721
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.624     0    0.074   0.124     1.060   90.476   88.214
LGA    G     9_A      G     9_A     0.605     0    0.047   0.047     0.635   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.199     0    0.058   0.332     1.317  100.000   96.488
LGA    N    11_A      N    11_A     0.251     0    0.017   1.079     2.747  100.000   91.250
LGA    E    12_A      E    12_A     0.409     0    0.051   0.095     0.712   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.910     0    0.008   0.118     2.896   90.476   76.111
LGA    A    14_A      A    14_A     0.636     0    0.124   0.163     0.816   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.153     0    0.012   0.026     1.301   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.655     0    0.082   0.997     3.783   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.664     0    0.078   0.303     1.802   84.048   88.512
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.388     0    0.062   0.257     1.887   79.286   83.730
LGA    P   123_A      P   123_A     0.619     0    0.020   0.348     1.305   90.476   89.184
LGA    L   124_A      L   124_A     0.648     0    0.052   0.146     0.849   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.689     0    0.029   0.095     0.895   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.444     0    0.021   0.604     2.019   97.619   93.214
LGA    G   127_A      G   127_A     0.441     0    0.055   0.055     0.587   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.310     0    0.036   0.091     0.779  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.369     0    0.023   0.982     3.807  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.170     0    0.051   0.067     0.419  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.268     0    0.027   0.054     0.388  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.274     0    0.020   0.768     2.272   97.619   90.053
LGA    R   133_A      R   133_A     0.666     0    0.013   0.961     2.971   92.857   85.152
LGA    F   134_A      F   134_A     0.842     0    0.049   0.158     1.209   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     0.972     0    0.057   0.302     1.887   85.952   82.619
LGA    A   136_A      A   136_A     0.833     0    0.063   0.070     0.950   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.958     0    0.041   0.243     2.475   90.476   81.726
LGA    V   138_A      V   138_A     0.736     0    0.013   0.032     1.037   88.214   89.184
LGA    D   139_A      D   139_A     0.840     0    0.023   0.053     1.253   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     0.968     0    0.016   0.062     1.386   90.476   86.599
LGA    S   141_A      S   141_A     0.864     0    0.073   0.078     0.950   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.512     0    0.022   0.074     0.793   95.238   92.857
LGA    K   143_A      K   143_A     0.265     0    0.037   0.676     2.691  100.000   92.116
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.515     0    0.035   0.088     1.451   92.857   88.254
LGA    A   145_A      A   145_A     0.662     0    0.040   0.052     1.011   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     0.998     0    0.027   0.048     1.268   85.952   86.857
LGA    G   147_A      G   147_A     1.128     0    0.016   0.016     1.128   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.154     4    0.018   0.019     1.216   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.139     0    0.014   0.036     1.539   79.286   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.695     0    0.217   0.209     2.088   79.286   76.381
LGA    C   151_A      C   151_A     1.012     0    0.550   0.621     1.985   81.548   83.016

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.512          1.497                  2.173           83.962   78.761

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    129    1.42    89.695    94.389     8.463

LGA_LOCAL      RMSD:   1.424  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.515  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.512  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.195225 * X  +   0.229169 * Y  +   0.953608 * Z  + -27.447878
  Y_new =   0.262578 * X  +   0.924609 * Y  +  -0.275956 * Z  +  27.972473
  Z_new =  -0.944955 * X  +   0.304270 * Y  +   0.120332 * Z  +   2.953378 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.931472  1.237457  1.194195   [DEG:   53.3694   70.9011   68.4223 ]
ZXZ:  1.289110  1.450172 -1.259285   [DEG:   73.8606   83.0887  -72.1517 ]
 
# END of job
