
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.58     1.58
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.58     1.58
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    38      21_A - 58_A        0.94     1.73
  LCS_AVERAGE:     24.64

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    4   10   48   87  104  120  123  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     39   91  109  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     56   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     29  131  131     25   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     29  131  131      4   17   60  113  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     29  131  131      5   15   60  115  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     29  131  131      5   16   66  115  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     38  131  131      5   65  108  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     38  131  131     10   39  106  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     38  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     38  131  131     34   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     38  131  131     30   85  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     38  131  131     30   71  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     38  131  131     29   85  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     38  131  131     29   71  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     38  131  131     30   92  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     38  131  131     33   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     38  131  131     33   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     38  131  131     33   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     38  131  131     33   94  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     38  131  131     21   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     38  131  131     56   94  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     38  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     38  131  131     42   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     38  131  131     33   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     38  131  131     29   86  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     38  131  131     29   84  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     38  131  131     25   69  107  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     38  131  131     29   74  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     38  131  131     32   90  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     38  131  131     37   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      4    5    5    5   39  117  124  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    5    8   37   59   80  112  121  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      4  131  131      4    4    4    7    8   14   24  119  126  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      8  131  131      4   17   34   57  116  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     22  131  131      4   49   83  111  119  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     36  131  131      4   37   63   91  115  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     18   42   75  111  119  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     29   71  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     30   84  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     34   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     65   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     61   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     59   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     65   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     38   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     59   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     26   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      4   29  104  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     64   93  109  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A      4  131  131      3    3    4    7   14   88  122  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   38   84  118  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      6   19   84  111  119  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     33   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     60   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     59   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     64   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     64   93  109  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     68   95  110  117  120  123  126  128  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.88  (  24.64  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     68     95    110    117    120    123    126    128    128    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  51.91  72.52  83.97  89.31  91.60  93.89  96.18  97.71  97.71  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.54   0.76   0.86   0.98   1.09   1.22   1.35   1.35   1.51   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58
GDT RMS_ALL_AT   1.75   1.66   1.60   1.60   1.61   1.60   1.59   1.59   1.59   1.59   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58   1.58

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     5.116     4    0.463   0.445     7.045   39.048   18.466
LGA    K     5_A      K     5_A     1.775     0    0.125   0.657     3.047   67.143   64.286
LGA    T     6_A      T     6_A     1.083     0    0.061   0.071     1.172   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.112     0    0.035   0.060     1.295   83.690   82.721
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.578     0    0.084   0.135     0.855   90.476   90.476
LGA    G     9_A      G     9_A     0.586     0    0.038   0.038     0.586   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.233     0    0.043   0.582     2.264  100.000   92.083
LGA    N    11_A      N    11_A     0.236     0    0.020   0.967     2.759  100.000   91.131
LGA    E    12_A      E    12_A     0.418     0    0.058   0.105     0.764   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.952     0    0.021   0.106     2.797   90.476   76.111
LGA    A    14_A      A    14_A     0.633     0    0.126   0.165     0.803   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.147     0    0.012   0.024     1.341   85.952   85.048
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LGA    D    17_A      D    17_A     0.722     0    0.058   0.207     2.100   82.024   88.631
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.331     0    0.041   0.258     1.792   79.286   85.238
LGA    P   123_A      P   123_A     0.741     0    0.015   0.331     1.269   90.476   89.184
LGA    L   124_A      L   124_A     0.695     0    0.050   0.121     0.831   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.696     0    0.025   0.100     0.838   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.458     0    0.041   0.598     2.077   97.619   93.214
LGA    G   127_A      G   127_A     0.447     0    0.047   0.047     0.470  100.000  100.000
LGA    S   128_A      S   128_A     0.297     0    0.029   0.061     0.500  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.380     0    0.027   0.941     3.603  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.186     0    0.054   0.074     0.394  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.303     0    0.040   0.059     0.527  100.000   98.810
LGA    K   132_A      K   132_A     0.311     0    0.039   0.749     2.412   97.619   90.053
LGA    R   133_A      R   133_A     0.648     0    0.035   1.041     3.348   92.857   83.030
LGA    F   134_A      F   134_A     0.824     0    0.036   0.182     1.117   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     0.965     0    0.056   0.313     2.172   85.952   79.464
LGA    A   136_A      A   136_A     0.686     0    0.068   0.084     0.902   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.834     0    0.024   0.314     2.541   90.476   80.774
LGA    V   138_A      V   138_A     0.657     0    0.013   0.027     0.968   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.820     0    0.025   0.049     1.371   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     0.988     0    0.009   0.056     1.424   90.476   86.599
LGA    S   141_A      S   141_A     0.856     0    0.080   0.083     0.950   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.442     0    0.015   0.066     0.857   97.619   95.238
LGA    K   143_A      K   143_A     0.267     0    0.028   0.668     2.415  100.000   94.021
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.580     0    0.039   0.119     1.632   92.857   86.786
LGA    A   145_A      A   145_A     0.620     0    0.044   0.056     0.917   92.857   92.381
LGA    A   146_A      A   146_A     0.883     0    0.030   0.046     1.152   85.952   86.857
LGA    G   147_A      G   147_A     0.976     0    0.018   0.018     0.981   90.476   90.476
LGA    K   148_A      K   148_A     1.097     4    0.025   0.027     1.186   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.266     0    0.035   0.313     1.517   81.429   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.655     0    0.239   0.229     2.098   79.286   76.381
LGA    C   151_A      C   151_A     0.635     0    0.559   0.659     2.716   79.881   83.413

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.584          1.563                  2.185           84.503   78.785

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.35    89.885    94.476     8.818

LGA_LOCAL      RMSD:   1.352  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.593  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.584  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.788218 * X  +   0.516187 * Y  +  -0.335057 * Z  + -29.287529
  Y_new =  -0.354493 * X  +  -0.825899 * Y  +  -0.438435 * Z  +  29.263540
  Z_new =  -0.503038 * X  +  -0.226808 * Y  +   0.833973 * Z  +   3.954242 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.718955  0.527110 -0.265538   [DEG: -155.7847   30.2012  -15.2142 ]
ZXZ: -0.652533  0.584527 -1.994379   [DEG:  -37.3874   33.4909 -114.2695 ]
 
# END of job
