
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.53     1.53
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.53     1.53
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.97     1.74
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.92     1.58
  LCS_AVERAGE:     24.31

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     12  131  131      3    3   12   44   85   92  118  125  127  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     14  131  131     37   86  102  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     14  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     14  131  131     50   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     26  131  131     26   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     26  131  131      4   17   58  113  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     26  131  131      4   13   53  113  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     26  131  131      4   15   64  113  120  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     32  131  131      3   62  103  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      3   40  102  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     59   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     33   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     24   72  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     24   70  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     22   72  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     17   57  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     21   83  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     29   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     29   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     27   82  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     22   90  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     13   91  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     19   91  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     28   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     38   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     30   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     23   71  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     23   72  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     23   60   96  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     25   70  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     30   80  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131      5   79  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     34  131  131      4    4    4    4   70  120  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   91  114  119  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      6  131  131      4    6   70  101  118  121  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      6  131  131      4    6   28  100  118  121  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131      4   31   47   81  111  122  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   23   49   65   93  115  125  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     10   38   64  103  118  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     24   67  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     25   72  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     33   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     64   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     59   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     49   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     60   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     43   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     43   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     60   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     41   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     40   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     32   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   74  103  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     59   91  104  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A      4  131  131      3    3    4    7   13  102  108  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   25   64  112  121  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      4   19   87  109  119  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     36   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     63   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     56   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     58   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     44   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     65   91  106  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     65   93  108  116  120  123  127  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.77  (  24.31  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     65     93    108    116    120    123    127    129    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  49.62  70.99  82.44  88.55  91.60  93.89  96.95  98.47  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.56   0.81   0.92   1.04   1.13   1.32   1.40   1.46   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53
GDT RMS_ALL_AT   1.91   1.65   1.55   1.56   1.55   1.55   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     5.439     4    0.521   0.504     7.445   39.048   18.466
LGA    K     5_A      K     5_A     1.991     0    0.140   0.660     3.765   65.119   59.259
LGA    T     6_A      T     6_A     1.109     0    0.062   0.078     1.264   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.052     0    0.021   0.071     1.154   85.952   84.014
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.649     0    0.079   0.137     0.930   90.476   90.476
LGA    G     9_A      G     9_A     0.618     0    0.031   0.031     0.627   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.350     0    0.047   0.066     0.514  100.000   96.429
LGA    N    11_A      N    11_A     0.307     0    0.021   0.893     2.724  100.000   91.131
LGA    E    12_A      E    12_A     0.428     0    0.054   0.076     0.740   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.929     0    0.008   0.123     2.968   90.476   75.476
LGA    A    14_A      A    14_A     0.673     0    0.113   0.151     0.849   90.476   90.476
LGA    A    15_A      A    15_A     1.183     0    0.009   0.021     1.309   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.734     0    0.063   0.897     3.917   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.642     0    0.070   0.404     1.921   84.048   87.381
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.338     0    0.048   0.318     1.770   83.810   85.992
LGA    P   123_A      P   123_A     0.592     0    0.025   0.346     1.195   90.476   89.184
LGA    L   124_A      L   124_A     0.651     0    0.043   0.118     0.927   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.676     0    0.018   0.094     0.874   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.547     0    0.018   0.591     1.985   92.857   91.845
LGA    G   127_A      G   127_A     0.554     0    0.056   0.056     0.633   92.857   92.857
LGA    S   128_A      S   128_A     0.374     0    0.033   0.053     0.521  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.336     0    0.036   0.999     3.994  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.248     0    0.051   0.066     0.413  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.201     0    0.035   0.065     0.292  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.265     0    0.028   0.755     2.264   97.619   90.053
LGA    R   133_A      R   133_A     0.765     0    0.024   1.069     3.745   90.476   81.558
LGA    F   134_A      F   134_A     0.886     0    0.042   0.173     1.166   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     0.956     0    0.060   0.273     1.842   85.952   81.548
LGA    A   136_A      A   136_A     0.757     0    0.066   0.073     0.870   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.881     0    0.010   1.369     4.399   90.476   72.083
LGA    V   138_A      V   138_A     0.648     0    0.010   0.026     0.935   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.775     0    0.023   0.056     1.156   90.476   89.345
LGA    P   140_A      P   140_A     0.784     0    0.013   0.034     1.096   90.476   87.891
LGA    S   141_A      S   141_A     0.785     0    0.065   0.068     0.853   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.449     0    0.016   0.069     0.775   97.619   95.238
LGA    K   143_A      K   143_A     0.195     0    0.042   0.655     2.452  100.000   95.026
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.530     0    0.037   0.066     1.405   92.857   88.254
LGA    A   145_A      A   145_A     0.731     0    0.037   0.049     1.088   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.011     0    0.021   0.043     1.272   83.690   85.048
LGA    G   147_A      G   147_A     1.127     0    0.018   0.018     1.127   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.141     4    0.019   0.020     1.183   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.115     0    0.008   0.032     1.429   81.429   81.429
LGA    A   150_A      A   150_A     1.511     0    0.191   0.185     1.796   79.286   78.000
LGA    C   151_A      C   151_A     0.991     0    0.551   0.610     1.832   83.810   84.524

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.529          1.514                  2.200           84.247   78.799

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    129    1.40    89.504    94.379     8.614

LGA_LOCAL      RMSD:   1.398  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.532  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.529  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.650443 * X  +  -0.728795 * Y  +   0.213967 * Z  + -29.979101
  Y_new =   0.748494 * X  +  -0.662913 * Y  +   0.017408 * Z  +  27.444992
  Z_new =   0.129155 * X  +   0.171476 * Y  +   0.976686 * Z  +   4.564104 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.286219 -0.129517  0.173798   [DEG:  130.9907   -7.4208    9.9579 ]
ZXZ:  1.651976  0.216358  0.645543   [DEG:   94.6512   12.3964   36.9869 ]
 
# END of job
