
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.56     1.56
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.56     1.56
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.94     1.80
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.96     1.59
  LCS_AVERAGE:     24.50

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     14  131  131      3    4   42   79   96  116  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     47   89  103  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     23  131  131     44   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     27   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      4   22   68  114  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   13   52  113  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      4   13   66  113  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     33  131  131      4   65  103  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131     13   53  101  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     62   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     63   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     33   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     26   71  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     26   71  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     26   75  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     21   56  106  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     23   85  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     33   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     33   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     26   81  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     21   83  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     23   91  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     21   90  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     45   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     36   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     33   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     25   71  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     26   71  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     23   63   98  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     26   69  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     29   75  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     27   83  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      3    3    4    6    8   63  102  124  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      6   16   80  103  114  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      6  131  131      3    5    7   17   27   80  123  125  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      6  131  131      3    5    8   87  117  121  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131     17   44   74   96  115  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      3    6   33   61   82  107  124  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     14   35   58   92  117  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     26   64  103  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     26   75  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     30   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     58   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     63   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     62   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     51   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     51   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     51   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     63   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     45   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     61   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     33   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     38   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      8   85  103  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131      3   90  102  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     35  131  131      3    3    4    7   12   96  124  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   43   60  115  121  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   17   72  103  119  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     24   90  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     62   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     62   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     51   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     51   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     59   90  103  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     64   92  107  117  120  122  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.83  (  24.50  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     64     92    107    117    120    122    126    128    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  48.85  70.23  81.68  89.31  91.60  93.13  96.18  97.71  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.55   0.80   0.94   1.04   1.11   1.27   1.39   1.50   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56
GDT RMS_ALL_AT   1.82   1.65   1.57   1.57   1.57   1.58   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56   1.56

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.480     4    0.515   0.499     5.954   46.786   23.175
LGA    K     5_A      K     5_A     1.782     0    0.140   0.652     2.834   68.929   72.116
LGA    T     6_A      T     6_A     1.115     0    0.052   0.067     1.245   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.047     0    0.020   0.049     1.199   85.952   84.014
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.649     0    0.071   0.132     0.950   90.476   90.476
LGA    G     9_A      G     9_A     0.600     0    0.041   0.041     0.635   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.248     0    0.056   0.073     0.582  100.000   98.810
LGA    N    11_A      N    11_A     0.244     0    0.018   1.064     2.760  100.000   91.250
LGA    E    12_A      E    12_A     0.390     0    0.048   0.088     0.681   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.934     0    0.007   0.143     3.290   90.476   72.262
LGA    A    14_A      A    14_A     0.610     0    0.127   0.167     0.783   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.138     0    0.012   0.028     1.270   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.689     0    0.078   1.003     3.864   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.627     0    0.079   0.374     1.794   86.190   88.452
LGA    G    18_A      G    18_A     2.804     0    0.130   0.130     4.411   52.262   52.262
LGA    I    19_A      I    19_A     2.871     0    0.646   0.628     4.011   52.143   56.548
LGA    N    20_A      N    20_A     3.165     0    0.133   0.887     7.798   53.571   36.488
LGA    L    21_A      L    21_A     2.083     0    0.035   1.378     3.769   66.786   63.155
LGA    E    22_A      E    22_A     2.173     0    0.032   0.660     4.165   68.810   55.556
LGA    V    23_A      V    23_A     0.979     0    0.070   1.042     2.795   85.952   80.612
LGA    A    24_A      A    24_A     1.121     0    0.019   0.037     1.342   83.690   83.238
LGA    A    25_A      A    25_A     0.597     0    0.019   0.029     0.741   92.857   94.286
LGA    K    26_A      K    26_A     0.517     0    0.023   0.278     1.505   90.476   90.635
LGA    L    27_A      L    27_A     0.331     0    0.035   0.108     0.560   97.619   98.810
LGA    D    28_A      D    28_A     0.390     0    0.043   0.263     1.392  100.000   95.298
LGA    T    29_A      T    29_A     0.357     0    0.062   0.104     0.676   97.619   97.279
LGA    G    30_A      G    30_A     0.643     0    0.018   0.018     0.918   92.857   92.857
LGA    A    31_A      A    31_A     0.777     0    0.023   0.032     0.882   92.857   92.381
LGA    K    32_A      K    32_A     0.639     0    0.012   0.938     3.245   95.238   79.524
LGA    T    33_A      T    33_A     0.659     0    0.041   0.089     0.896   90.476   90.476
LGA    A    34_A      A    34_A     0.667     0    0.040   0.073     0.721   92.857   92.381
LGA    S    35_A      S    35_A     0.709     0    0.028   0.730     2.232   90.476   86.190
LGA    L    36_A      L    36_A     0.667     0    0.038   0.115     0.919   92.857   91.667
LGA    S    37_A      S    37_A     0.652     0    0.049   0.055     0.931   90.476   90.476
LGA    A    38_A      A    38_A     0.554     0    0.085   0.112     1.316   90.595   92.476
LGA    R    39_A      R    39_A     1.570     0    0.082   1.184     4.545   75.000   62.078
LGA    D    40_A      D    40_A     1.656     0    0.092   0.093     1.968   72.857   72.857
LGA    I    41_A      I    41_A     1.272     0    0.075   0.134     1.896   77.143   82.679
LGA    K    42_A      K    42_A     1.687     4    0.034   0.044     1.983   77.143   42.381
LGA    R    43_A      R    43_A     1.119     0    0.014   0.854     2.407   81.429   78.355
LGA    F    44_A      F    44_A     0.752     0    0.036   0.097     1.036   90.476   89.654
LGA    K    45_A      K    45_A     0.618     0    0.006   0.671     3.936   90.476   84.233
LGA    R    46_A      R    46_A     1.195     0    0.029   0.231     2.074   83.690   76.840
LGA    N    47_A      N    47_A     1.498     0    0.030   0.277     2.674   79.286   72.083
LGA    G    48_A      G    48_A     1.236     0    0.060   0.060     1.294   81.429   81.429
LGA    E    49_A      E    49_A     1.503     0    0.038   0.899     2.205   81.548   77.831
LGA    S    50_A      S    50_A     0.942     0    0.020   0.037     1.554   88.214   84.524
LGA    W    51_A      W    51_A     0.406     0    0.036   0.116     1.461  100.000   88.673
LGA    V    52_A      V    52_A     0.590     0    0.048   0.103     0.843   92.857   94.558
LGA    R    53_A      R    53_A     1.405     0    0.015   1.195     5.354   81.429   60.996
LGA    F    54_A      F    54_A     1.406     0    0.017   0.117     1.895   77.143   85.628
LGA    Y    55_A      Y    55_A     2.025     0    0.036   0.207     3.101   72.976   64.365
LGA    L    56_A      L    56_A     1.579     0    0.070   0.093     1.950   77.143   75.000
LGA    A    57_A      A    57_A     1.272     0    0.470   0.426     2.569   73.214   71.524
LGA    I    58_A      I    58_A     1.132     0    0.671   1.001     3.919   77.143   67.560
LGA    D    59_A      D    59_A     5.191     0    0.260   1.456    11.365   32.024   16.607
LGA    A    60_A      A    60_A     3.458     0    0.104   0.105     4.630   43.690   42.381
LGA    A    61_A      A    61_A     5.014     0    0.056   0.073     5.943   30.595   28.762
LGA    H    62_A      H    62_A     3.329     0    0.180   1.025    11.305   48.810   23.429
LGA    S    63_A      S    63_A     3.615     0    0.070   0.631     6.292   43.333   43.413
LGA    H    64_A      H    64_A     4.694     0    0.257   0.305     8.759   42.024   24.190
LGA    P    65_A      P    65_A     3.265     0    0.015   0.331     4.562   50.119   44.626
LGA    I    66_A      I    66_A     1.901     0    0.055   0.146     2.109   72.976   72.917
LGA    E    67_A      E    67_A     1.326     0    0.062   0.199     1.928   79.286   75.714
LGA    R    68_A      R    68_A     0.898     0    0.030   0.302     1.448   90.476   88.831
LGA    P    69_A      P    69_A     0.447     0    0.023   0.356     1.518   95.238   90.680
LGA    L    70_A      L    70_A     0.440     0    0.103   0.259     0.843  100.000   95.238
LGA    A    71_A      A    71_A     0.616     0    0.015   0.020     0.740   90.476   90.476
LGA    R    72_A      R    72_A     0.549     0    0.064   0.970     3.106   95.238   86.926
LGA    V    73_A      V    73_A     0.397     0    0.029   0.054     0.547   92.857   95.918
LGA    S    74_A      S    74_A     0.586     0    0.157   0.545     2.583   86.071   81.984
LGA    K    75_A      K    75_A     0.567     4    0.209   0.262     2.457   81.786   45.397
LGA    A    93_A      A    93_A     0.522     0    0.533   0.584     2.717   79.881   75.333
LGA    R    94_A      R    94_A     0.636     4    0.079   0.093     0.765   90.476   57.576
LGA    P    95_A      P    95_A     0.474     0    0.017   0.099     0.595   97.619   95.918
LGA    V    96_A      V    96_A     0.702     0    0.013   0.038     1.005   90.476   89.184
LGA    I    97_A      I    97_A     0.838     0    0.047   0.093     0.871   90.476   90.476
LGA    E    98_A      E    98_A     0.617     0    0.059   0.364     2.097   90.476   83.651
LGA    L    99_A      L    99_A     0.502     0    0.022   0.049     0.638   97.619   95.238
LGA    D   100_A      D   100_A     0.608     0    0.093   0.288     1.193   90.476   90.536
LGA    I   101_A      I   101_A     0.924     0    0.058   0.094     1.060   90.476   89.345
LGA    C   102_A      C   102_A     0.953     0    0.041   0.076     1.284   90.476   87.460
LGA    M   103_A      M   103_A     0.829     0    0.036   1.077     3.152   90.476   83.214
LGA    G   104_A      G   104_A     0.874     0    0.035   0.035     1.021   88.214   88.214
LGA    S   105_A      S   105_A     1.275     0    0.082   0.143     1.496   83.690   82.937
LGA    A   106_A      A   106_A     0.937     0    0.043   0.046     1.088   88.214   88.667
LGA    M   107_A      M   107_A     0.896     0    0.015   0.143     1.095   90.476   89.345
LGA    R   108_A      R   108_A     0.579     0    0.043   0.211     1.246   90.476   89.654
LGA    S   109_A      S   109_A     0.502     0    0.043   0.186     1.142   92.857   90.556
LGA    I   110_A      I   110_A     0.533     0    0.050   1.502     3.448   97.619   82.619
LGA    E   111_A      E   111_A     0.375     0    0.029   0.698     2.126  100.000   89.894
LGA    V   112_A      V   112_A     0.644     0    0.069   1.053     2.164   90.476   83.129
LGA    N   113_A      N   113_A     0.442     0    0.044   0.784     2.150   97.619   90.893
LGA    L   114_A      L   114_A     0.347     0    0.055   0.083     0.502  100.000   98.810
LGA    T   115_A      T   115_A     0.640     0    0.027   0.090     1.215   95.238   89.320
LGA    D   116_A      D   116_A     0.868     0    0.434   1.138     5.932   82.262   61.905
LGA    R   117_A      R   117_A     1.714     0    0.601   0.903     3.491   69.286   69.524
LGA    S   118_A      S   118_A     2.018     0    0.649   0.624     4.764   71.190   59.921
LGA    A   119_A      A   119_A     4.573     0    0.061   0.057     7.075   38.690   32.952
LGA    F   120_A      F   120_A     3.555     0    0.557   1.030    11.407   57.738   24.978
LGA    Q   121_A      Q   121_A     3.059     0    0.636   1.312    10.455   55.476   28.519
LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.442     0    0.065   0.263     1.926   79.286   83.730
LGA    P   123_A      P   123_A     0.602     0    0.025   0.340     1.336   92.857   89.252
LGA    L   124_A      L   124_A     0.577     0    0.039   0.126     0.703   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.606     0    0.030   0.099     0.835   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.400     0    0.015   0.621     2.160   97.619   93.214
LGA    G   127_A      G   127_A     0.359     0    0.052   0.052     0.539   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.246     0    0.034   0.088     0.663  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.305     0    0.028   0.980     3.883  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.204     0    0.053   0.070     0.451  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.248     0    0.031   0.051     0.337  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.312     0    0.021   0.772     2.253   95.238   88.995
LGA    R   133_A      R   133_A     0.826     0    0.016   1.070     3.781   90.476   81.558
LGA    F   134_A      F   134_A     0.902     0    0.032   0.171     1.208   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     1.001     0    0.075   0.409     2.450   83.690   78.333
LGA    A   136_A      A   136_A     0.835     0    0.073   0.087     0.920   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.911     0    0.023   0.270     2.460   90.476   81.726
LGA    V   138_A      V   138_A     0.648     0    0.016   0.044     0.937   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.751     0    0.020   0.055     1.206   90.476   88.214
LGA    P   140_A      P   140_A     0.719     0    0.013   0.037     1.079   90.476   89.184
LGA    S   141_A      S   141_A     0.830     0    0.065   0.069     0.917   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.513     0    0.018   0.077     0.854   95.238   92.857
LGA    K   143_A      K   143_A     0.200     0    0.035   0.671     2.557  100.000   93.175
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.542     0    0.037   0.085     1.452   92.857   88.254
LGA    A   145_A      A   145_A     0.767     0    0.038   0.049     1.132   88.214   88.667
LGA    A   146_A      A   146_A     1.110     0    0.021   0.041     1.420   83.690   83.238
LGA    G   147_A      G   147_A     1.254     0    0.014   0.014     1.254   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     1.259     4    0.016   0.017     1.345   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.188     0    0.023   0.036     1.535   79.286   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.738     0    0.217   0.209     2.127   79.286   76.381
LGA    C   151_A      C   151_A     1.064     0    0.549   0.620     1.952   81.548   83.016

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.557          1.546                  2.244           83.883   78.771

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.39    89.313    94.184     8.596

LGA_LOCAL      RMSD:   1.389  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.561  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.557  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.054458 * X  +   0.679994 * Y  +  -0.731193 * Z  + -31.999147
  Y_new =  -0.858261 * X  +  -0.406127 * Y  +  -0.313767 * Z  +  23.489367
  Z_new =  -0.510317 * X  +   0.610467 * Y  +   0.605729 * Z  +   1.829119 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.634163  0.535553  0.789294   [DEG:  -93.6307   30.6849   45.2232 ]
ZXZ: -1.165444  0.920115 -0.696278   [DEG:  -66.7750   52.7187  -39.8938 ]
 
# END of job
