
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.64     1.64
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.64     1.64
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.93     1.88
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.95     1.68
  LCS_AVERAGE:     24.43

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    4   36   68   90  109  121  125  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     48   84  102  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     42   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     40   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     22   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      7   28   76  113  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   13   54  112  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      4   13   57  112  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     33  131  131      5   63   99  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      5   44  101  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     57   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     54   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     31   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     29   69  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     29   69  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     27   71  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     19   61  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     23   89  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     31   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     31   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     27   75  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     19   74  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     23   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     19   85  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     36   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     36   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     31   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     25   69  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     29   69  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     27   66  102  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     29   69  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     31   76  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     26   83  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      3  131  131      3    3    4    5    5    7   78  111  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      3  131  131      3    3    4    7   13   47  107  122  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      6  131  131      5    6    8   16   29  110  121  126  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      6  131  131      5    6   10   64  116  120  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131     17   41   75   98  114  121  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      5    6   33   62   84  110  124  127  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     12   36   65   98  117  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     27   66  102  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     29   71  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     31   86  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     52   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     52   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     58   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     54   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     53   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     36   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     40   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     58   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     47   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     43   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     58   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     57   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     37   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     57   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     54   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     36   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     32   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   76  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     59   88  104  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     35  131  131      3    3    4    7   12   87  118  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3   20   42   95  114  121  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   16   65   95  119  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131      7   88  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     57   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     52   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     54   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     58   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     52   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     52   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     58   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     59   88  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     59   90  106  117  120  122  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.81  (  24.43  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     59     90    106    117    120    122    125    127    128    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  45.04  68.70  80.92  89.31  91.60  93.13  95.42  96.95  97.71  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.56   0.79   0.96   1.06   1.13   1.26   1.38   1.44   1.57   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64
GDT RMS_ALL_AT   2.00   1.75   1.67   1.66   1.66   1.66   1.65   1.65   1.65   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64   1.64

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.889     4    0.472   0.457     6.323   42.024   20.582
LGA    K     5_A      K     5_A     1.943     0    0.138   0.657     3.539   67.143   61.058
LGA    T     6_A      T     6_A     1.203     0    0.056   0.062     1.337   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.130     0    0.032   0.059     1.304   83.690   82.721
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.569     0    0.079   0.135     1.060   90.476   88.968
LGA    G     9_A      G     9_A     0.681     0    0.057   0.057     0.681   90.476   90.476
LGA    L    10_A      L    10_A     0.252     0    0.024   1.374     3.174  100.000   83.095
LGA    N    11_A      N    11_A     0.225     0    0.012   0.992     2.594  100.000   91.250
LGA    E    12_A      E    12_A     0.397     0    0.049   0.118     0.667   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.930     0    0.006   0.119     3.059   90.476   74.206
LGA    A    14_A      A    14_A     0.627     0    0.121   0.158     0.797   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.129     0    0.011   0.036     1.268   85.952   85.048
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LGA    D    17_A      D    17_A     0.627     0    0.082   0.251     1.786   86.190   93.095
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.546     0    0.061   0.291     2.058   75.119   81.587
LGA    P   123_A      P   123_A     0.606     0    0.028   0.339     1.302   90.476   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.613     0    0.047   0.133     0.753   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.662     0    0.022   0.088     0.872   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.463     0    0.015   0.603     1.869   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.450     0    0.050   0.050     0.541   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.297     0    0.035   0.058     0.532  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.323     0    0.031   0.966     3.890  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.284     0    0.058   0.072     0.556   97.619   98.095
LGA    L   131_A      L   131_A     0.343     0    0.033   0.052     0.454  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.406     0    0.020   0.768     2.297   95.238   88.995
LGA    R   133_A      R   133_A     0.880     0    0.024   1.073     3.865   88.214   80.000
LGA    F   134_A      F   134_A     1.013     0    0.041   0.169     1.343   83.690   88.009
LGA    D   135_A      D   135_A     1.172     0    0.058   0.306     2.170   79.286   76.131
LGA    A   136_A      A   136_A     0.908     0    0.070   0.080     1.064   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     1.024     0    0.027   0.239     2.554   88.214   79.643
LGA    V   138_A      V   138_A     0.773     0    0.012   0.047     1.128   88.214   89.184
LGA    D   139_A      D   139_A     0.965     0    0.028   0.049     1.390   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     1.199     0    0.008   0.054     1.646   81.429   78.980
LGA    S   141_A      S   141_A     1.120     0    0.071   0.076     1.202   81.429   81.429
LGA    L   142_A      L   142_A     0.685     0    0.013   0.081     1.016   90.476   89.345
LGA    K   143_A      K   143_A     0.406     0    0.035   0.661     2.879  100.000   91.005
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.575     0    0.038   0.097     1.558   92.857   86.786
LGA    A   145_A      A   145_A     0.655     0    0.044   0.056     1.007   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.041     0    0.021   0.045     1.271   83.690   83.238
LGA    G   147_A      G   147_A     1.141     0    0.023   0.023     1.141   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.214     4    0.020   0.021     1.318   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.170     0    0.020   0.031     1.504   79.286   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.730     0    0.180   0.174     2.024   77.143   74.667
LGA    C   151_A      C   151_A     1.382     0    0.552   0.604     1.651   79.286   80.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.643          1.641                  2.300           83.208   77.906

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    127    1.38    88.740    93.816     8.584

LGA_LOCAL      RMSD:   1.379  Number of atoms:  127  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.653  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.643  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.817455 * X  +   0.551836 * Y  +  -0.165057 * Z  + -27.283340
  Y_new =   0.315309 * X  +  -0.188912 * Y  +   0.929996 * Z  +  27.728518
  Z_new =   0.482024 * X  +  -0.812274 * Y  +  -0.328426 * Z  +   3.791940 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.368137 -0.502964 -1.955029   [DEG:   21.0927  -28.8177 -112.0149 ]
ZXZ: -2.965940  1.905433  2.606021   [DEG: -169.9358  109.1733  149.3140 ]
 
# END of job
