
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1250),  selected  159 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  169 ( 1322),  selected  159 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   159      19_B - 177_B       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:     94.08

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   159      19_B - 177_B       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:     94.08

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   159      19_B - 177_B       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:     94.08

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  159
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L    19_B     L    19_B    159  159  159     33  122  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D    20_B     D    20_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    21_B     G    21_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    22_B     P    22_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    23_B     Y    23_B    159  159  159     84  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    24_B     Q    24_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    25_B     P    25_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    26_B     T    26_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    27_B     S    27_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    28_B     F    28_B    159  159  159     60  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    29_B     N    29_B    159  159  159     60  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    30_B     P    30_B    159  159  159     60  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    31_B     P    31_B    159  159  159     71  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    32_B     V    32_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    33_B     N    33_B    159  159  159     57  145  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    34_B     Y    34_B    159  159  159     70  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W    35_B     W    35_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    36_B     M    36_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    37_B     L    37_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    38_B     L    38_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    39_B     A    39_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    40_B     P    40_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    41_B     L    41_B    159  159  159     56  143  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    43_B     A    43_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    45_B     V    45_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    46_B     V    46_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    47_B     V    47_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    48_B     E    48_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    49_B     G    49_B    159  159  159     78  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    50_B     T    50_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    51_B     N    51_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    52_B     N    52_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    53_B     T    53_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    54_B     N    54_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    55_B     R    55_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W    56_B     W    56_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    57_B     L    57_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    58_B     A    58_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    59_B     T    59_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    60_B     I    60_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    61_B     L    61_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    63_B     E    63_B    159  159  159     82  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    64_B     P    64_B    159  159  159     68  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    65_B     G    65_B    159  159  159     29  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    66_B     V    66_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    67_B     A    67_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    68_B     S    68_B    159  159  159     75  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    69_B     T    69_B    159  159  159     78  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    70_B     T    70_B    159  159  159     78  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    71_B     R    71_B    159  159  159     75  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    73_B     Y    73_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    74_B     T    74_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    75_B     L    75_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    76_B     F    76_B    159  159  159     74  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    77_B     G    77_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    78_B     I    78_B    159  159  159     59  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_B    159  159  159     79  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    80_B     E    80_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    81_B     Q    81_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    82_B     I    82_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_B    159  159  159     78  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    85_B     E    85_B    159  159  159     75  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    86_B     N    86_B    159  159  159     82  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    87_B     S    87_B    159  159  159     29  111  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    88_B     S    88_B    159  159  159     50  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    89_B     N    89_B    159  159  159     50  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    90_B     T    90_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    91_B     K    91_B    159  159  159     82  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W    92_B     W    92_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    93_B     K    93_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    94_B     F    94_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    95_B     I    95_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D    96_B     D    96_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    97_B     L    97_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    98_B     M    98_B    159  159  159     74  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    99_B     K    99_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   100_B     T   100_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   101_B     T   101_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   102_B     S   102_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   103_B     S   103_B    159  159  159     21  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   104_B     G   104_B    159  159  159     75  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_B    159  159  159     82  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   106_B     Y   106_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   107_B     T   107_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q   108_B     Q   108_B    159  159  159     82  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H   109_B     H   109_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   110_B     S   110_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P   111_B     P   111_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   112_B     L   112_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   113_B     L   113_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   114_B     S   114_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   115_B     E   115_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P   116_B     P   116_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   117_B     K   117_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   118_B     L   118_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   120_B     G   120_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   121_B     I   121_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M   122_B     M   122_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   123_B     K   123_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H   124_B     H   124_B    159  159  159     57  145  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_B    159  159  159     49  141  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   126_B     G   126_B    159  159  159     61  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_B    159  159  159     61  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   128_B     L   128_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W   129_B     W   129_B    159  159  159     79  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   130_B     T   130_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   131_B     Y   131_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   132_B     D   132_B    159  159  159     65  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   133_B     G   133_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   134_B     E   134_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   135_B     T   135_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P   136_B     P   136_B    159  159  159     59  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   137_B     N   137_B    159  159  159     39  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   138_B     A   138_B    159  159  159     30  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   139_B     I   139_B    159  159  159     23  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   140_B     T   140_B    159  159  159     49  143  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   141_B     N   141_B    159  159  159     49  125  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   142_B     G   142_B    159  159  159     49  134  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   143_B     Y   143_B    159  159  159     61  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   144_B     S   144_B    159  159  159     61  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   145_B     T   145_B    159  159  159     61  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   146_B     T   146_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   147_B     N   147_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   148_B     Y   148_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   149_B     D   149_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   150_B     S   150_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   151_B     V   151_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   152_B     N   152_B    159  159  159     39  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M   153_B     M   153_B    159  159  159     27  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   154_B     T   154_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   155_B     S   155_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F   156_B     F   156_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     C   157_B     C   157_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   158_B     D   158_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F   159_B     F   159_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   160_B     Y   160_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   161_B     I   161_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   162_B     I   162_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P   163_B     P   163_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R   164_B     R   164_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   165_B     S   165_B    159  159  159     73  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q   166_B     Q   166_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   167_B     E   167_B    159  159  159     84  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   168_B     S   168_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   169_B     V   169_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     C   170_B     C   170_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   171_B     T   171_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   172_B     E   172_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   173_B     Y   173_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   174_B     I   174_B    159  159  159     83  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   175_B     N   175_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   176_B     N   176_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   177_B     G   177_B    159  159  159     85  146  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  94.08  (  94.08   94.08   94.08 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     85    146    158    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159 
GDT PERCENT_AT  50.30  86.39  93.49  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08  94.08
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.55   0.63   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64
GDT RMS_ALL_AT   0.67   0.65   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y    34_B      Y    34_B
#   possible swapping detected:  Y    73_B      Y    73_B
#   possible swapping detected:  E    85_B      E    85_B
#   possible swapping detected:  F    94_B      F    94_B
#   possible swapping detected:  E   134_B      E   134_B
#   possible swapping detected:  Y   143_B      Y   143_B
#   possible swapping detected:  F   156_B      F   156_B
#   possible swapping detected:  F   159_B      F   159_B
#   possible swapping detected:  E   172_B      E   172_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L    19_B      L    19_B     1.367     0    0.339   1.074     3.008   75.833   77.560
LGA    D    20_B      D    20_B     0.550     0    0.075   0.166     0.911   95.238   94.048
LGA    G    21_B      G    21_B     0.422     0    0.056   0.056     0.887   95.238   95.238
LGA    P    22_B      P    22_B     0.613     0    0.049   0.159     0.766   90.476   90.476
LGA    Y    23_B      Y    23_B     0.575     0    0.034   0.108     0.802   90.476   90.476
LGA    Q    24_B      Q    24_B     0.676     0    0.019   0.788     2.207   92.857   86.667
LGA    P    25_B      P    25_B     0.502     0    0.065   0.080     0.729   95.238   94.558
LGA    T    26_B      T    26_B     0.487     0    0.082   0.101     1.645   95.238   86.871
LGA    S    27_B      S    27_B     0.664     0    0.050   0.690     2.480   92.857   87.778
LGA    F    28_B      F    28_B     0.809     0    0.033   0.292     0.929   90.476   90.476
LGA    N    29_B      N    29_B     0.802     0    0.067   0.369     1.564   90.476   87.143
LGA    P    30_B      P    30_B     0.797     0    0.020   0.236     0.865   90.476   90.476
LGA    P    31_B      P    31_B     0.843     0    0.060   0.071     1.075   90.476   87.891
LGA    V    32_B      V    32_B     0.749     0    0.037   0.997     3.293   88.214   79.728
LGA    N    33_B      N    33_B     1.073     0    0.026   0.493     2.599   83.690   79.524
LGA    Y    34_B      Y    34_B     0.760     0    0.046   0.116     1.479   90.476   87.460
LGA    W    35_B      W    35_B     0.421     0    0.036   0.091     0.866  100.000   95.238
LGA    M    36_B      M    36_B     0.248     0    0.039   0.623     1.322  100.000   93.036
LGA    L    37_B      L    37_B     0.215     0    0.060   0.119     0.513   97.619   98.810
LGA    L    38_B      L    38_B     0.314     0    0.027   0.366     1.583  100.000   93.095
LGA    A    39_B      A    39_B     0.328     0    0.118   0.116     0.679   97.619   98.095
LGA    P    40_B      P    40_B     0.482     0    0.026   0.120     0.846   95.238   95.918
LGA    L    41_B      L    41_B     1.207     0    0.106   1.163     5.696   88.214   66.726
LGA    N    42_B      N    42_B     0.669     0    0.037   0.882     4.098   92.857   79.583
LGA    A    43_B      A    43_B     0.417     0    0.048   0.051     0.517   97.619   98.095
LGA    G    44_B      G    44_B     0.163     0    0.029   0.029     0.428  100.000  100.000
LGA    V    45_B      V    45_B     0.199     0    0.018   0.097     0.404  100.000  100.000
LGA    V    46_B      V    46_B     0.482     0    0.069   1.010     2.144   97.619   87.211
LGA    V    47_B      V    47_B     0.619     0    0.015   0.084     0.715   90.476   90.476
LGA    E    48_B      E    48_B     0.547     0    0.019   0.120     0.670   90.476   92.593
LGA    G    49_B      G    49_B     0.632     0    0.025   0.025     0.632   90.476   90.476
LGA    T    50_B      T    50_B     0.482     0    0.016   0.066     0.825   92.857   95.918
LGA    N    51_B      N    51_B     0.354     0    0.093   0.100     0.645   97.619   98.810
LGA    N    52_B      N    52_B     0.333     0    0.081   1.135     3.497   97.619   87.857
LGA    T    53_B      T    53_B     0.325     0    0.020   0.053     0.415  100.000  100.000
LGA    N    54_B      N    54_B     0.345     0    0.082   0.575     1.816   97.619   94.226
LGA    R    55_B      R    55_B     0.417     0    0.048   0.992     4.004  100.000   84.589
LGA    W    56_B      W    56_B     0.316     0    0.060   0.069     0.678  100.000   96.599
LGA    L    57_B      L    57_B     0.454     0    0.045   1.098     2.712   97.619   89.048
LGA    A    58_B      A    58_B     0.392     0    0.054   0.054     0.414  100.000  100.000
LGA    T    59_B      T    59_B     0.456     0    0.045   0.050     0.558   97.619   97.279
LGA    I    60_B      I    60_B     0.213     0    0.066   1.120     2.689  100.000   84.881
LGA    L    61_B      L    61_B     0.421     0    0.040   0.052     0.490  100.000  100.000
LGA    V    62_B      V    62_B     0.415     0    0.041   0.063     0.664  100.000   95.918
LGA    E    63_B      E    63_B     0.487     0    0.022   0.444     1.263   95.238   89.577
LGA    P    64_B      P    64_B     0.701     0    0.045   0.077     0.861   90.476   90.476
LGA    G    65_B      G    65_B     1.270     0    0.093   0.093     1.270   81.429   81.429
LGA    V    66_B      V    66_B     0.978     0    0.057   0.108     1.117   88.214   89.184
LGA    A    67_B      A    67_B     1.098     0    0.048   0.056     1.224   85.952   85.048
LGA    S    68_B      S    68_B     0.905     0    0.023   0.545     1.300   85.952   84.444
LGA    T    69_B      T    69_B     0.714     0    0.074   0.072     1.039   90.476   89.184
LGA    T    70_B      T    70_B     0.675     0    0.064   0.099     0.907   90.476   90.476
LGA    R    71_B      R    71_B     0.645     0    0.026   0.142     0.645   92.857   93.939
LGA    T    72_B      T    72_B     0.632     0    0.053   1.225     2.602   90.476   82.041
LGA    Y    73_B      Y    73_B     0.655     0    0.030   0.113     0.655   90.476   96.032
LGA    T    74_B      T    74_B     0.724     0    0.060   0.078     0.763   90.476   90.476
LGA    L    75_B      L    75_B     0.544     0    0.029   0.051     0.632   90.476   95.238
LGA    F    76_B      F    76_B     0.611     0    0.072   0.124     0.790   90.476   90.476
LGA    G    77_B      G    77_B     0.699     0    0.063   0.063     0.699   90.476   90.476
LGA    I    78_B      I    78_B     0.659     0    0.044   1.254     4.409   95.238   79.821
LGA    Q    79_B      Q    79_B     0.498     0    0.037   0.367     1.090   97.619   92.646
LGA    E    80_B      E    80_B     0.360     0    0.074   0.181     0.841   97.619   95.767
LGA    Q    81_B      Q    81_B     0.425     0    0.039   1.197     3.652  100.000   82.275
LGA    I    82_B      I    82_B     0.385     0    0.033   0.629     2.023  100.000   94.405
LGA    T    83_B      T    83_B     0.524     0    0.034   0.047     0.673   90.476   90.476
LGA    V    84_B      V    84_B     0.617     0    0.030   1.203     3.396   90.476   81.020
LGA    E    85_B      E    85_B     0.664     0    0.024   0.304     1.876   90.476   87.513
LGA    N    86_B      N    86_B     0.581     0    0.039   0.142     1.040   88.214   94.107
LGA    S    87_B      S    87_B     1.520     0    0.114   0.671     1.944   79.286   78.571
LGA    S    88_B      S    88_B     1.077     0    0.017   0.084     1.207   81.429   84.444
LGA    N    89_B      N    89_B     1.204     0    0.217   1.030     3.344   79.286   76.429
LGA    T    90_B      T    90_B     0.764     0    0.070   0.106     1.009   90.476   89.184
LGA    K    91_B      K    91_B     0.402     0    0.031   0.602     1.396   97.619   92.698
LGA    W    92_B      W    92_B     0.287     0    0.055   0.351     1.647  100.000   89.388
LGA    K    93_B      K    93_B     0.267     0    0.059   0.371     1.350  100.000   97.937
LGA    F    94_B      F    94_B     0.301     0    0.055   0.107     0.781   97.619   99.134
LGA    I    95_B      I    95_B     0.315     0    0.024   0.068     0.494  100.000  100.000
LGA    D    96_B      D    96_B     0.501     0    0.034   0.072     0.756   97.619   94.048
LGA    L    97_B      L    97_B     0.322     0    0.045   0.104     0.665   97.619   98.810
LGA    M    98_B      M    98_B     0.735     0    0.085   1.148     4.020   97.619   81.905
LGA    K    99_B      K    99_B     0.312     0    0.045   0.139     0.399  100.000  100.000
LGA    T   100_B      T   100_B     0.472     0    0.163   0.253     1.464   95.238   90.612
LGA    T   101_B      T   101_B     0.608     0    0.041   0.053     0.944   95.238   93.197
LGA    S   102_B      S   102_B     0.422     0    0.123   0.129     1.148   92.976   95.317
LGA    S   103_B      S   103_B     0.888     0    0.162   0.680     1.441   92.857   89.048
LGA    G   104_B      G   104_B     0.676     0    0.018   0.018     0.686   90.476   90.476
LGA    T   105_B      T   105_B     0.559     0    0.056   1.083     3.196   92.857   83.537
LGA    Y   106_B      Y   106_B     0.273     0    0.016   0.087     0.491  100.000  100.000
LGA    T   107_B      T   107_B     0.515     0    0.036   1.057     2.747   97.619   87.279
LGA    Q   108_B      Q   108_B     0.582     0    0.032   0.290     1.250   97.619   92.646
LGA    H   109_B      H   109_B     0.244     0    0.098   1.044     3.038   97.619   85.810
LGA    S   110_B      S   110_B     0.915     0    0.627   1.040     3.859   74.286   68.571
LGA    P   111_B      P   111_B     0.341     0    0.087   0.127     1.398   95.357   90.680
LGA    L   112_B      L   112_B     0.208     0    0.080   0.125     0.430  100.000  100.000
LGA    L   113_B      L   113_B     0.328     0    0.056   1.324     2.857  100.000   84.702
LGA    S   114_B      S   114_B     0.248     0    0.054   0.095     0.772  100.000   96.825
LGA    E   115_B      E   115_B     0.165     0    0.017   0.958     4.192  100.000   77.989
LGA    P   116_B      P   116_B     0.313     0    0.027   0.119     0.715  100.000   95.918
LGA    K   117_B      K   117_B     0.517     0    0.064   0.608     1.479   97.619   89.630
LGA    L   118_B      L   118_B     0.420     0    0.025   0.075     0.717  100.000   97.619
LGA    Y   119_B      Y   119_B     0.411     0    0.052   0.123     0.500  100.000   99.206
LGA    G   120_B      G   120_B     0.438     0    0.032   0.032     0.464  100.000  100.000
LGA    I   121_B      I   121_B     0.298     0    0.054   1.149     2.475  100.000   86.786
LGA    M   122_B      M   122_B     0.453     0    0.040   0.160     0.882   95.238   95.238
LGA    K   123_B      K   123_B     0.682     0    0.071   0.939     2.768   90.476   85.820
LGA    H   124_B      H   124_B     1.079     0    0.021   0.196     1.213   83.690   82.333
LGA    G   125_B      G   125_B     1.253     0    0.156   0.156     1.774   79.286   79.286
LGA    G   126_B      G   126_B     0.880     0    0.121   0.121     0.880   90.476   90.476
LGA    Q   127_B      Q   127_B     0.856     0    0.048   0.973     4.617   90.476   76.349
LGA    L   128_B      L   128_B     0.446     0    0.039   0.088     0.657   95.238   95.238
LGA    W   129_B      W   129_B     0.644     0    0.076   0.260     2.289   97.619   80.714
LGA    T   130_B      T   130_B     0.300     0    0.095   0.170     0.909   97.619   97.279
LGA    Y   131_B      Y   131_B     0.548     0    0.019   0.079     0.901   92.857   91.270
LGA    D   132_B      D   132_B     0.872     0    0.173   0.836     3.075   88.214   79.821
LGA    G   133_B      G   133_B     0.521     0    0.098   0.098     0.825   92.857   92.857
LGA    E   134_B      E   134_B     0.426     0    0.030   0.587     2.386  100.000   85.238
LGA    T   135_B      T   135_B     0.413     0    0.070   0.067     0.635  100.000   97.279
LGA    P   136_B      P   136_B     0.658     0    0.125   0.261     0.919   92.857   91.837
LGA    N   137_B      N   137_B     0.940     0    0.285   0.262     2.136   90.476   81.726
LGA    A   138_B      A   138_B     0.829     0    0.088   0.123     1.133   88.214   88.667
LGA    I   139_B      I   139_B     0.742     0    0.080   1.219     3.646   92.857   82.440
LGA    T   140_B      T   140_B     1.255     0    0.059   0.079     1.473   81.429   81.429
LGA    N   141_B      N   141_B     1.543     0    0.039   1.073     3.816   86.190   72.798
LGA    G   142_B      G   142_B     1.298     0    0.070   0.070     1.876   79.286   79.286
LGA    Y   143_B      Y   143_B     1.027     0    0.018   0.189     1.292   88.214   89.802
LGA    S   144_B      S   144_B     0.985     0    0.044   0.619     2.035   88.214   84.683
LGA    T   145_B      T   145_B     0.798     0    0.084   0.086     1.036   90.476   89.184
LGA    T   146_B      T   146_B     0.340     0    0.072   1.010     2.426   97.619   88.571
LGA    N   147_B      N   147_B     0.239     0    0.067   1.125     2.269  100.000   91.190
LGA    Y   148_B      Y   148_B     0.270     0    0.031   0.054     0.492  100.000  100.000
LGA    D   149_B      D   149_B     0.095     0    0.051   0.094     0.670  100.000   98.810
LGA    S   150_B      S   150_B     0.099     0    0.087   0.088     0.791   97.619   96.825
LGA    V   151_B      V   151_B     0.402     0    0.027   0.179     0.732  100.000   98.639
LGA    N   152_B      N   152_B     0.986     0    0.055   0.118     1.539   90.476   84.881
LGA    M   153_B      M   153_B     0.838     0    0.059   0.661     1.409   88.214   87.083
LGA    T   154_B      T   154_B     0.431     0    0.024   0.064     0.546   95.238   94.558
LGA    S   155_B      S   155_B     0.521     0    0.022   0.674     2.256   97.619   90.952
LGA    F   156_B      F   156_B     0.205     0    0.061   0.150     0.818  100.000   94.805
LGA    C   157_B      C   157_B     0.543     0    0.034   0.087     0.777   97.619   95.238
LGA    D   158_B      D   158_B     0.443     0    0.034   0.154     1.182  100.000   94.107
LGA    F   159_B      F   159_B     0.272     0    0.044   0.122     0.348  100.000  100.000
LGA    Y   160_B      Y   160_B     0.407     0    0.034   0.113     0.833  100.000   95.238
LGA    I   161_B      I   161_B     0.362     0    0.010   0.717     1.941  100.000   93.036
LGA    I   162_B      I   162_B     0.223     0    0.040   0.149     0.339  100.000  100.000
LGA    P   163_B      P   163_B     0.471     0    0.053   0.171     0.614  100.000   95.918
LGA    R   164_B      R   164_B     0.576     0    0.032   1.128     4.717   90.476   76.753
LGA    S   165_B      S   165_B     0.803     0    0.079   0.624     3.040   88.214   82.222
LGA    Q   166_B      Q   166_B     0.278     0    0.166   1.236     2.828   97.619   86.085
LGA    E   167_B      E   167_B     0.482     0    0.014   0.145     1.197   95.238   91.587
LGA    S   168_B      S   168_B     0.567     0    0.025   0.047     0.765   95.238   93.651
LGA    V   169_B      V   169_B     0.389     0    0.036   1.274     2.810  100.000   88.844
LGA    C   170_B      C   170_B     0.249     0    0.029   0.071     0.451  100.000  100.000
LGA    T   171_B      T   171_B     0.566     0    0.029   0.097     0.882   90.476   90.476
LGA    E   172_B      E   172_B     0.653     0    0.034   0.881     2.320   90.476   79.947
LGA    Y   173_B      Y   173_B     0.493     0    0.043   0.314     1.932   92.857   85.437
LGA    I   174_B      I   174_B     0.645     0    0.037   0.535     1.156   92.857   89.405
LGA    N   175_B      N   175_B     0.643     0    0.110   1.110     2.600   92.857   84.286
LGA    N   176_B      N   176_B     0.647     0    0.124   1.016     5.341   92.857   72.381
LGA    G   177_B      G   177_B     0.267     0    0.087   0.087     0.402  100.000  100.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      159     636    636  100.00    1250   1250  100.00               169
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.642          0.666                  1.062           88.492   84.720

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  169    4.0    159    0.64    92.160    93.431    21.426

LGA_LOCAL      RMSD:   0.642  Number of atoms:  159  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.642  Number of assigned atoms:  159 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.642  Standard rmsd on all 159 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.287641 * X  +   0.296323 * Y  +  -0.910744 * Z  +  25.746798
  Y_new =  -0.494114 * X  +   0.860520 * Y  +   0.123925 * Z  + -28.833292
  Z_new =   0.820435 * X  +   0.414365 * Y  +   0.393938 * Z  + -15.095413 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.043616 -0.962172  0.810665   [DEG:  -59.7948  -55.1284   46.4477 ]
ZXZ: -1.706036  1.165884  1.103113   [DEG:  -97.7487   66.8002   63.2037 ]
 
# END of job
