
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  160 ( 1257),  selected  160 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  169 ( 1322),  selected  160 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   158      20_B - 177_B       4.52     6.44
  LCS_AVERAGE:     92.41

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   154      24_B - 177_B       1.44     6.68
  LCS_AVERAGE:     87.93

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   153      25_B - 177_B       0.95     6.73
  LCS_AVERAGE:     86.80

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  160
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     T    18_B     T    18_B      9   10   12      7    8    8    9   11   11   11   12   12   13   17   21   22   23   23   25   27   28   30   33 
LCS_GDT     L    19_B     L    19_B      9   10   12      7    8    8    9   11   11   11   12   14   16   17   21   22   23   23   25   27   28   31   33 
LCS_GDT     D    20_B     D    20_B      9   10  158      7    8    8    9   11   11   11   12   14   16   17   21   22   23   26   26   27   28   31   33 
LCS_GDT     G    21_B     G    21_B      9   10  158      7    8    8    9   11   11   11   12   14   16   17   21   22   23   26   26   27   34   39   46 
LCS_GDT     P    22_B     P    22_B      9   10  158      7    8    8    9   11   11   11   12   14   16   17   21   22   26   31   34   39   51   54   59 
LCS_GDT     Y    23_B     Y    23_B      9   10  158      7    8    8    9   11   11   12   12   15   23   37   39   52   63   76   90  108  117  128  136 
LCS_GDT     Q    24_B     Q    24_B      9  154  158      7    8    8    9   12   15   25   35   45   61   79  108  119  133  152  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P    25_B     P    25_B    153  154  158      4    8   23   47   84  124  151  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    26_B     T    26_B    153  154  158      4   13   71  127  150  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S    27_B     S    27_B    153  154  158     18  130  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     F    28_B     F    28_B    153  154  158      8   24   99  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    29_B     N    29_B    153  154  158      3    9  117  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P    30_B     P    30_B    153  154  158      8  130  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P    31_B     P    31_B    153  154  158     43  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    32_B     V    32_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    33_B     N    33_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y    34_B     Y    34_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     W    35_B     W    35_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     M    36_B     M    36_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    37_B     L    37_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    38_B     L    38_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     A    39_B     A    39_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P    40_B     P    40_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    41_B     L    41_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_B    153  154  158     66  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     A    43_B     A    43_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    45_B     V    45_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    46_B     V    46_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    47_B     V    47_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E    48_B     E    48_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G    49_B     G    49_B    153  154  158     18   90  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    50_B     T    50_B    153  154  158     31  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    51_B     N    51_B    153  154  158     13   90  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    52_B     N    52_B    153  154  158     13   90  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    53_B     T    53_B    153  154  158     13   90  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    54_B     N    54_B    153  154  158     41  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     R    55_B     R    55_B    153  154  158     56  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     W    56_B     W    56_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    57_B     L    57_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     A    58_B     A    58_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    59_B     T    59_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I    60_B     I    60_B    153  154  158     72  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    61_B     L    61_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E    63_B     E    63_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P    64_B     P    64_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G    65_B     G    65_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    66_B     V    66_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     A    67_B     A    67_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S    68_B     S    68_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    69_B     T    69_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    70_B     T    70_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     R    71_B     R    71_B    153  154  158     67  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y    73_B     Y    73_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    74_B     T    74_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    75_B     L    75_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     F    76_B     F    76_B    153  154  158     40  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G    77_B     G    77_B    153  154  158     55  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I    78_B     I    78_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E    80_B     E    80_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Q    81_B     Q    81_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I    82_B     I    82_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E    85_B     E    85_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    86_B     N    86_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S    87_B     S    87_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S    88_B     S    88_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N    89_B     N    89_B    153  154  158     54  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T    90_B     T    90_B    153  154  158     54  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     K    91_B     K    91_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     W    92_B     W    92_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     K    93_B     K    93_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     F    94_B     F    94_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I    95_B     I    95_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     D    96_B     D    96_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L    97_B     L    97_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     M    98_B     M    98_B    153  154  158     75  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     K    99_B     K    99_B    153  154  158     67  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   100_B     T   100_B    153  154  158     67  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   101_B     T   101_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   102_B     S   102_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   103_B     S   103_B    153  154  158     71  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   104_B     G   104_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   106_B     Y   106_B    153  154  158     72  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   107_B     T   107_B    153  154  158     62  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Q   108_B     Q   108_B    153  154  158     67  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     H   109_B     H   109_B    153  154  158      5   46  129  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   110_B     S   110_B    153  154  158      7   56  144  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P   111_B     P   111_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L   112_B     L   112_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L   113_B     L   113_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   114_B     S   114_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E   115_B     E   115_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P   116_B     P   116_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     K   117_B     K   117_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L   118_B     L   118_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   120_B     G   120_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I   121_B     I   121_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     M   122_B     M   122_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     K   123_B     K   123_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     H   124_B     H   124_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_B    153  154  158     72  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   126_B     G   126_B    153  154  158     25  131  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_B    153  154  158     25  131  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     L   128_B     L   128_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     W   129_B     W   129_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   130_B     T   130_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   131_B     Y   131_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     D   132_B     D   132_B    153  154  158     54  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   133_B     G   133_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E   134_B     E   134_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   135_B     T   135_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P   136_B     P   136_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   137_B     N   137_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     A   138_B     A   138_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I   139_B     I   139_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   140_B     T   140_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   141_B     N   141_B    153  154  158     59  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   142_B     G   142_B    153  154  158     71  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   143_B     Y   143_B    153  154  158     71  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   144_B     S   144_B    153  154  158     71  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   145_B     T   145_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   146_B     T   146_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   147_B     N   147_B    153  154  158     43  131  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   148_B     Y   148_B    153  154  158     19  107  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     D   149_B     D   149_B    153  154  158     43  129  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   150_B     S   150_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V   151_B     V   151_B    153  154  158     43  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   152_B     N   152_B    153  154  158     35  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     M   153_B     M   153_B    153  154  158     20  131  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   154_B     T   154_B    153  154  158     31  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   155_B     S   155_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     F   156_B     F   156_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     C   157_B     C   157_B    153  154  158     71  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     D   158_B     D   158_B    153  154  158     26  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     F   159_B     F   159_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   160_B     Y   160_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I   161_B     I   161_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I   162_B     I   162_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     P   163_B     P   163_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     R   164_B     R   164_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   165_B     S   165_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Q   166_B     Q   166_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E   167_B     E   167_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     S   168_B     S   168_B    153  154  158     74  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     V   169_B     V   169_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     C   170_B     C   170_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     T   171_B     T   171_B    153  154  158     74  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     E   172_B     E   172_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     Y   173_B     Y   173_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     I   174_B     I   174_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   175_B     N   175_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     N   176_B     N   176_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_GDT     G   177_B     G   177_B    153  154  158     76  134  147  151  151  152  152  153  153  153  153  153  153  153  153  154  154  154  154  154 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  89.05  (  86.80   87.93   92.41 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     76    134    147    151    151    152    152    153    153    153    153    153    153    153    153    154    154    154    154    154 
GDT PERCENT_AT  44.97  79.29  86.98  89.35  89.35  89.94  89.94  90.53  90.53  90.53  90.53  90.53  90.53  90.53  90.53  91.12  91.12  91.12  91.12  91.12
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.57   0.67   0.74   0.74   0.80   0.80   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44
GDT RMS_ALL_AT   6.79   6.74   6.75   6.76   6.76   6.75   6.75   6.73   6.73   6.73   6.73   6.73   6.73   6.73   6.73   6.68   6.68   6.68   6.68   6.68

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    20_B      D    20_B
#   possible swapping detected:  F    76_B      F    76_B
#   possible swapping detected:  F    94_B      F    94_B
#   possible swapping detected:  Y   106_B      Y   106_B
#   possible swapping detected:  E   115_B      E   115_B
#   possible swapping detected:  D   132_B      D   132_B
#   possible swapping detected:  E   134_B      E   134_B
#   possible swapping detected:  Y   143_B      Y   143_B
#   possible swapping detected:  Y   148_B      Y   148_B
#   possible swapping detected:  F   156_B      F   156_B
#   possible swapping detected:  F   159_B      F   159_B
#   possible swapping detected:  Y   173_B      Y   173_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    T    18_B      T    18_B    46.718     0    0.096   0.902    49.929    0.000    0.000
LGA    L    19_B      L    19_B    39.531     0    0.080   1.245    41.997    0.000    0.000
LGA    D    20_B      D    20_B    35.185     0    0.013   1.113    36.848    0.000    0.000
LGA    G    21_B      G    21_B    29.554     0    0.024   0.024    32.697    0.000    0.000
LGA    P    22_B      P    22_B    25.700     0    0.079   0.092    29.351    0.000    0.000
LGA    Y    23_B      Y    23_B    19.938     0    0.051   1.193    28.270    0.000    0.000
LGA    Q    24_B      Q    24_B    13.574     0    0.042   0.518    20.185    0.000    0.000
LGA    P    25_B      P    25_B     6.298     0    0.024   0.062     8.790   13.690   15.986
LGA    T    26_B      T    26_B     3.731     0    0.121   0.997     5.861   54.524   43.265
LGA    S    27_B      S    27_B     1.130     0    0.087   0.637     4.040   81.786   71.508
LGA    F    28_B      F    28_B     2.159     0    0.136   1.460     3.984   75.119   63.939
LGA    N    29_B      N    29_B     2.480     0    0.070   0.260     5.248   62.857   52.619
LGA    P    30_B      P    30_B     1.223     0    0.117   0.364     1.462   81.429   84.014
LGA    P    31_B      P    31_B     1.021     0    0.015   0.324     1.295   85.952   84.014
LGA    V    32_B      V    32_B     0.658     0    0.048   0.128     1.010   90.476   89.184
LGA    N    33_B      N    33_B     0.338     0    0.041   0.190     1.135   97.619   94.107
LGA    Y    34_B      Y    34_B     0.467     0    0.010   0.068     0.696  100.000   93.651
LGA    W    35_B      W    35_B     0.325     0    0.074   0.084     0.680   97.619   99.320
LGA    M    36_B      M    36_B     0.282     0    0.029   1.004     2.396  100.000   90.000
LGA    L    37_B      L    37_B     0.114     0    0.037   0.053     0.710  100.000   96.429
LGA    L    38_B      L    38_B     0.372     0    0.042   0.229     0.972  100.000   95.238
LGA    A    39_B      A    39_B     0.209     0    0.017   0.024     0.301  100.000  100.000
LGA    P    40_B      P    40_B     0.093     0    0.020   0.045     0.199  100.000  100.000
LGA    L    41_B      L    41_B     0.148     0    0.016   0.133     0.576  100.000   97.619
LGA    N    42_B      N    42_B     0.687     0    0.087   0.781     3.814   97.619   77.798
LGA    A    43_B      A    43_B     0.371     0    0.279   0.365     1.802   90.833   92.667
LGA    G    44_B      G    44_B     0.190     0    0.046   0.046     0.288  100.000  100.000
LGA    V    45_B      V    45_B     0.140     0    0.025   0.132     0.337  100.000  100.000
LGA    V    46_B      V    46_B     0.151     0    0.031   0.045     0.277  100.000  100.000
LGA    V    47_B      V    47_B     0.122     0    0.029   0.049     0.283  100.000  100.000
LGA    E    48_B      E    48_B     0.100     0    0.029   0.721     1.933   95.238   85.820
LGA    G    49_B      G    49_B     1.331     0    0.057   0.057     1.331   85.952   85.952
LGA    T    50_B      T    50_B     0.970     0    0.047   0.082     1.272   83.690   85.306
LGA    N    51_B      N    51_B     1.526     0    0.006   0.255     1.793   75.000   78.274
LGA    N    52_B      N    52_B     1.439     0    0.068   0.102     1.962   79.286   76.071
LGA    T    53_B      T    53_B     1.524     0    0.039   1.102     3.502   79.286   73.537
LGA    N    54_B      N    54_B     0.704     0    0.051   0.139     1.786   90.476   86.012
LGA    R    55_B      R    55_B     0.709     0    0.027   1.122     4.302   90.476   71.342
LGA    W    56_B      W    56_B     0.204     0    0.062   0.079     1.113   92.976   92.619
LGA    L    57_B      L    57_B     0.670     0    0.018   0.092     1.128   92.857   88.274
LGA    A    58_B      A    58_B     0.846     0    0.024   0.030     0.923   90.476   90.476
LGA    T    59_B      T    59_B     0.544     0    0.025   0.053     0.730   95.238   94.558
LGA    I    60_B      I    60_B     0.462     0    0.032   0.064     0.512   97.619   98.810
LGA    L    61_B      L    61_B     0.288     0    0.015   0.063     0.358  100.000  100.000
LGA    V    62_B      V    62_B     0.144     0    0.014   0.023     0.352  100.000  100.000
LGA    E    63_B      E    63_B     0.198     0    0.024   0.123     0.455  100.000  100.000
LGA    P    64_B      P    64_B     0.330     0    0.030   0.064     0.620   97.619   98.639
LGA    G    65_B      G    65_B     0.674     0    0.076   0.076     0.696   92.857   92.857
LGA    V    66_B      V    66_B     0.690     0    0.022   0.061     0.768   90.476   90.476
LGA    A    67_B      A    67_B     0.896     0    0.008   0.012     1.150   88.214   86.857
LGA    S    68_B      S    68_B     1.032     0    0.104   0.114     1.116   85.952   85.952
LGA    T    69_B      T    69_B     0.991     0    0.040   0.079     1.216   88.214   86.599
LGA    T    70_B      T    70_B     0.916     0    0.015   0.047     1.065   90.476   89.184
LGA    R    71_B      R    71_B     0.634     0    0.043   0.091     0.723   90.476   93.939
LGA    T    72_B      T    72_B     0.808     0    0.071   0.984     2.063   90.476   84.286
LGA    Y    73_B      Y    73_B     0.703     0    0.042   0.100     1.076   88.214   94.484
LGA    T    74_B      T    74_B     0.887     0    0.075   0.844     2.856   90.476   84.422
LGA    L    75_B      L    75_B     0.763     0    0.006   0.074     0.859   90.476   90.476
LGA    F    76_B      F    76_B     0.896     0    0.060   0.207     0.976   90.476   93.074
LGA    G    77_B      G    77_B     0.756     0    0.063   0.063     0.834   90.476   90.476
LGA    I    78_B      I    78_B     0.740     0    0.016   0.186     1.147   90.476   88.214
LGA    Q    79_B      Q    79_B     0.589     0    0.024   1.045     4.045   90.476   75.185
LGA    E    80_B      E    80_B     0.870     0    0.038   0.121     1.833   90.476   84.550
LGA    Q    81_B      Q    81_B     0.797     0    0.009   0.379     2.889   90.476   79.206
LGA    I    82_B      I    82_B     0.838     0    0.009   0.054     0.896   90.476   90.476
LGA    T    83_B      T    83_B     0.810     0    0.010   0.036     0.872   90.476   90.476
LGA    V    84_B      V    84_B     0.879     0    0.033   0.064     1.061   90.476   86.599
LGA    E    85_B      E    85_B     0.807     0    0.018   0.264     1.005   90.476   91.587
LGA    N    86_B      N    86_B     0.709     0    0.024   0.099     0.816   90.476   94.048
LGA    S    87_B      S    87_B     0.981     0    0.068   0.092     1.187   88.214   85.952
LGA    S    88_B      S    88_B     0.620     0    0.020   0.081     0.670   90.476   93.651
LGA    N    89_B      N    89_B     0.958     0    0.026   0.062     1.751   88.214   83.750
LGA    T    90_B      T    90_B     0.823     0    0.037   0.048     1.168   90.476   89.184
LGA    K    91_B      K    91_B     0.500     0    0.089   0.556     1.628  100.000   91.746
LGA    W    92_B      W    92_B     0.175     0    0.020   0.096     0.524  100.000   98.639
LGA    K    93_B      K    93_B     0.037     0    0.022   0.136     0.961  100.000   96.825
LGA    F    94_B      F    94_B     0.389     0    0.018   0.072     0.520  100.000   99.134
LGA    I    95_B      I    95_B     0.679     0    0.039   0.100     0.877   90.476   90.476
LGA    D    96_B      D    96_B     0.690     0    0.056   0.148     0.962   90.476   90.476
LGA    L    97_B      L    97_B     0.678     0    0.080   0.109     1.115   88.214   88.214
LGA    M    98_B      M    98_B     0.462     0    0.024   0.377     1.413  100.000   92.976
LGA    K    99_B      K    99_B     0.738     0    0.007   0.094     1.023   90.476   89.471
LGA    T   100_B      T   100_B     0.622     0    0.038   0.123     1.427   95.238   90.612
LGA    T   101_B      T   101_B     0.247     0    0.044   0.055     0.588  100.000   98.639
LGA    S   102_B      S   102_B     0.608     0    0.063   0.077     1.312   92.857   89.048
LGA    S   103_B      S   103_B     1.012     0    0.132   0.138     1.374   85.952   84.444
LGA    G   104_B      G   104_B     0.832     0    0.069   0.069     0.839   90.476   90.476
LGA    T   105_B      T   105_B     0.667     0    0.012   0.147     1.160   90.476   89.184
LGA    Y   106_B      Y   106_B     0.553     0    0.025   0.126     0.792   90.476   93.651
LGA    T   107_B      T   107_B     0.634     0    0.035   0.088     0.790   90.476   90.476
LGA    Q   108_B      Q   108_B     0.595     0    0.078   1.047     5.127   85.952   70.265
LGA    H   109_B      H   109_B     2.038     0    0.672   0.798     4.048   59.881   60.810
LGA    S   110_B      S   110_B     1.754     0    0.450   0.514     3.178   67.143   70.476
LGA    P   111_B      P   111_B     0.592     0    0.044   0.164     0.826   90.476   94.558
LGA    L   112_B      L   112_B     0.584     0    0.031   0.065     0.715   90.476   90.476
LGA    L   113_B      L   113_B     0.457     0    0.029   1.331     3.448   97.619   82.798
LGA    S   114_B      S   114_B     0.220     0    0.036   0.088     0.469  100.000  100.000
LGA    E   115_B      E   115_B     0.308     0    0.030   1.380     5.724  100.000   71.905
LGA    P   116_B      P   116_B     0.318     0    0.039   0.074     0.515  100.000   98.639
LGA    K   117_B      K   117_B     0.257     0    0.078   0.099     0.475  100.000  100.000
LGA    L   118_B      L   118_B     0.229     0    0.015   0.121     0.608  100.000   98.810
LGA    Y   119_B      Y   119_B     0.274     0    0.088   0.291     1.108   97.619   92.143
LGA    G   120_B      G   120_B     0.144     0    0.013   0.013     0.169  100.000  100.000
LGA    I   121_B      I   121_B     0.286     0    0.008   0.139     1.260  100.000   95.298
LGA    M   122_B      M   122_B     0.269     0    0.012   0.078     0.322  100.000  100.000
LGA    K   123_B      K   123_B     0.321     0    0.016   0.164     1.108  100.000   95.820
LGA    H   124_B      H   124_B     0.528     0    0.030   0.168     0.795   92.857   93.333
LGA    G   125_B      G   125_B     0.812     0    0.194   0.194     0.812   90.476   90.476
LGA    G   126_B      G   126_B     1.061     0    0.108   0.108     1.066   83.690   83.690
LGA    Q   127_B      Q   127_B     1.029     0    0.020   0.908     2.203   85.952   80.741
LGA    L   128_B      L   128_B     0.658     0    0.015   1.379     3.032   90.476   79.048
LGA    W   129_B      W   129_B     0.466     0    0.025   0.065     0.925  100.000   93.878
LGA    T   130_B      T   130_B     0.431     0    0.048   0.061     0.516   97.619   97.279
LGA    Y   131_B      Y   131_B     0.409     0    0.041   0.118     0.668   95.238   98.413
LGA    D   132_B      D   132_B     0.677     0    0.156   0.657     2.322   88.214   80.655
LGA    G   133_B      G   133_B     0.534     0    0.016   0.016     0.545   95.238   95.238
LGA    E   134_B      E   134_B     0.479     0    0.020   0.188     1.309   95.238   91.587
LGA    T   135_B      T   135_B     0.250     0    0.080   0.103     0.355  100.000  100.000
LGA    P   136_B      P   136_B     0.348     0    0.033   0.056     0.521   97.619   98.639
LGA    N   137_B      N   137_B     0.437     0    0.050   0.062     0.854  100.000   95.238
LGA    A   138_B      A   138_B     0.206     0    0.017   0.018     0.434  100.000  100.000
LGA    I   139_B      I   139_B     0.553     0    0.029   0.085     1.401   97.619   91.786
LGA    T   140_B      T   140_B     0.472     0    0.042   0.110     0.803   92.857   93.197
LGA    N   141_B      N   141_B     0.903     0    0.084   0.807     2.955   95.238   81.071
LGA    G   142_B      G   142_B     0.747     0    0.063   0.063     0.747   92.857   92.857
LGA    Y   143_B      Y   143_B     0.810     0    0.013   0.170     1.586   90.476   86.746
LGA    S   144_B      S   144_B     0.854     0    0.019   0.072     1.103   90.476   87.460
LGA    T   145_B      T   145_B     0.693     0    0.171   1.102     3.038   88.214   80.884
LGA    T   146_B      T   146_B     0.871     0    0.027   0.104     1.325   88.214   85.306
LGA    N   147_B      N   147_B     1.090     0    0.122   1.115     3.244   85.952   78.690
LGA    Y   148_B      Y   148_B     1.387     0    0.046   0.051     1.752   81.548   78.611
LGA    D   149_B      D   149_B     1.136     0    0.041   0.105     1.381   85.952   83.690
LGA    S   150_B      S   150_B     0.302     0    0.029   0.054     0.642   97.619   98.413
LGA    V   151_B      V   151_B     0.700     0    0.014   0.061     1.220   95.238   90.612
LGA    N   152_B      N   152_B     0.942     0    0.035   0.897     4.273   85.952   71.190
LGA    M   153_B      M   153_B     1.102     0    0.098   0.655     2.877   83.690   75.357
LGA    T   154_B      T   154_B     0.778     0    0.065   0.091     1.424   95.238   89.320
LGA    S   155_B      S   155_B     0.286     0    0.034   0.057     0.656   97.619   96.825
LGA    F   156_B      F   156_B     0.305     0    0.054   0.199     1.119  100.000   95.714
LGA    C   157_B      C   157_B     0.608     0    0.021   0.048     0.743   95.238   93.651
LGA    D   158_B      D   158_B     0.703     0    0.049   0.135     1.658   95.238   88.393
LGA    F   159_B      F   159_B     0.387     0    0.026   0.137     0.543   97.619   99.134
LGA    Y   160_B      Y   160_B     0.562     0    0.010   0.130     0.609   97.619   96.032
LGA    I   161_B      I   161_B     0.463     0    0.026   0.098     0.686   97.619   97.619
LGA    I   162_B      I   162_B     0.495     0    0.027   0.087     0.600   97.619   95.238
LGA    P   163_B      P   163_B     0.345     0    0.024   0.111     0.507  100.000   98.639
LGA    R   164_B      R   164_B     0.518     0    0.033   0.195     1.055   90.476   91.385
LGA    S   165_B      S   165_B     0.481     0    0.037   0.052     0.514   97.619   98.413
LGA    Q   166_B      Q   166_B     0.411     0    0.016   0.885     2.058  100.000   92.011
LGA    E   167_B      E   167_B     0.533     0    0.017   0.056     0.613   92.857   95.767
LGA    S   168_B      S   168_B     0.629     0    0.040   0.065     0.709   90.476   90.476
LGA    V   169_B      V   169_B     0.434     0    0.011   0.195     0.792   97.619   97.279
LGA    C   170_B      C   170_B     0.474     0    0.015   0.092     0.474  100.000  100.000
LGA    T   171_B      T   171_B     0.657     0    0.028   0.111     1.079   90.476   89.184
LGA    E   172_B      E   172_B     0.344     0    0.070   0.159     0.659  100.000   96.825
LGA    Y   173_B      Y   173_B     0.243     0    0.030   0.098     0.740  100.000   96.825
LGA    I   174_B      I   174_B     0.294     0    0.052   0.140     0.586   97.619   97.619
LGA    N   175_B      N   175_B     0.165     0    0.014   0.104     0.487  100.000  100.000
LGA    N   176_B      N   176_B     0.357     0    0.020   1.118     2.511  100.000   89.048
LGA    G   177_B      G   177_B     0.413     0    0.026   0.026     0.563   97.619   97.619

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      160     640    640  100.00    1257   1257  100.00               169
SUMMARY(RMSD_GDC):     6.391          6.358                  6.350           83.388   80.867

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  160  169    4.0    153    0.95    87.574    88.524    14.575

LGA_LOCAL      RMSD:   0.950  Number of atoms:  153  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   6.725  Number of assigned atoms:  160 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   6.391  Standard rmsd on all 160 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.061738 * X  +   0.650558 * Y  +   0.756943 * Z  +  50.041794
  Y_new =   0.904210 * X  +   0.284654 * Y  +  -0.318396 * Z  + -13.169148
  Z_new =  -0.422602 * X  +   0.704092 * Y  +  -0.570668 * Z  + -13.937320 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.502624  0.436314  2.251908   [DEG:   86.0940   24.9990  129.0248 ]
ZXZ:  1.172629  2.178115 -0.540572   [DEG:   67.1867  124.7968  -30.9725 ]
 
# END of job
